About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Tnfsf4
tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 4
MGI:104511

126 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33742907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163323659fTnfsf4 : Locus-Region1SNPT TTTT T TTTTCCTTCC/T
rs6333295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163323778fTnfsf4 : Locus-Region1SNP      T G         G/T
rs6333870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163323907fTnfsf4 : Locus-Region1SNP      C G         C/G
rs6334333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163323985fTnfsf4 : Locus-Region2SNPG GGAGGGAAGAGGGGAGA/G
rs33742906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324392fTnfsf4 : Locus-Region1SNPG GGGG G  GGG  GGCC/G
rs33742905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324519fTnfsf4 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCCCTTCCTC/T
rs33742904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324522fTnfsf4 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs33742003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324530fTnfsf4 : Locus-Region1SNPT TTCT T CTCTTTT TC/T
rs33742002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324555fTnfsf4 : Locus-Region1SNPT TTCT T CTTTTTTTTC/T
rs33742001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324783fTnfsf4 : Locus-Region1SNPT TT T T GTGTGGTGGG/T
rs33742000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324799fTnfsf4 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs33741999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163324954fTnfsf4 : Locus-Region1SNPA AAAA A AAAATTAAAA/T
rs33741998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163325088fTnfsf4 : Locus-Region1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs33741997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163325163fTnfsf4 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTCCCCTCC/T
rs33741996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163325194fTnfsf4 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs33741995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163325349fTnfsf4 : Locus-Region1SNPA AATA A TATAAAA AA/T
rs32055280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163325977fTnfsf4 : Intron1SNP  T   T  C        C/T
rs32651862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326100fTnfsf4 : Intron2SNPA AAGAAA GAGAAAAGAA/G
rs32387251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326133fTnfsf4 : Intron2SNPT TTATTT ATATTTTATA/T
rs31572491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326139fTnfsf4 : Intron1SNP  A   A  G        A/G
rs31188476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326228fTnfsf4 : Intron2SNPG GGAGGG AGAGGGGAGA/G
rs33741994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326591fTnfsf4 : Intron1SNPC CCTC C TCTCCCCTCC/T
rs33741173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326698fTnfsf4 : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGGGA/G
rs33741172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326759fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT T CTCTTTTCTC/T
rs33741171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326894fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33741170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163326991fTnfsf4 : Intron1SNPG GGAG G AGAGGGGAGA/G
rs33741169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327099fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT T CTCTTTTCTC/T
rs33741168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327149fTnfsf4 : Intron1SNPG GG G A AGAGGGGAGA/G
rs33741167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327298fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT T CTCTTTTTTC/T
rs33741166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327429fTnfsf4 : Intron1SNPG GGCG C CGCGGGGCGC/G
rs33741165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327473fTnfsf4 : Intron1SNPG GGGG C GGGGGGGGGC/G
rs33741164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327474fTnfsf4 : Intron1SNPA AACA A CACAAAACAA/C
rs33740483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327563fTnfsf4 : Intron1SNPC CCAC C AC CCCCACA/C
rs33740482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327667fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
rs33740481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327720fTnfsf4 : Intron1SNPG GGAG A AGAGGGGAGA/G
rs33740480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327777fTnfsf4 : Intron1SNPC CCAC   ACACCCCACA/C
rs33740479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327828fTnfsf4 : Intron1SNPG AGGA   GAG A GGGA/G
rs33740478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327870fTnfsf4 : Intron1SNPT TTAT T ATATTTTATA/T
rs33740477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163327909fTnfsf4 : Intron1SNPC CCTC C TCTCCCCCCC/T
rs33740476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163328538fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs31633054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163328810fTnfsf4 : Intron1SNP TT   T  G        G/T
rs33740475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163329137fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33740474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163329548fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
rs33739543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163329663fTnfsf4 : Intron1SNPG GGAG G AGAGGGGAGA/G
rs33739542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163329897fTnfsf4 : Intron1SNPT TCTT T TCTCTTTTTC/T
rs33739541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330000fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
rs33739540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330158fTnfsf4 : Intron1SNPG GG G G TGTGGGGTGG/T
rs33739539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330168fTnfsf4 : Intron1SNPC CC C C TCTCCCCTCC/T
rs33739538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330643fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
rs33739537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330682fTnfsf4 : Intron1SNPC CC C C ACACCCCACA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33739536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330685fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A  A AAAA AA/G
rs33739535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330710fTnfsf4 : Intron1SNPA AACA A CACAAAACAA/C
rs33739534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330808fTnfsf4 : Intron1SNPC CCTC C TCTCCCCTCC/T
rs33746868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163330813fTnfsf4 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs33746867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331021fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33746866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331331fTnfsf4 : Intron1SNPA AA A G GA AAAAGAA/G
rs33746865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331366fTnfsf4 : Intron1SNPA AACA C CACAAAACAA/C
rs33746864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331394fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
rs33745743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331614fTnfsf4 : Intron1SNP   AG  G GAGA  AG A/G
rs33745742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331701fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA G  A AAAAGAA/G
rs33745741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163331707fTnfsf4 : Intron1SNPT TT T T CTCTTTTCTC/T
rs33745740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332005fTnfsf4 : Intron1SNPA AACA A CACAAAACAA/C
rs33745739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332026fTnfsf4 : Intron1SNPT TTGT T GTGTTTTGTG/T
rs33745738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332125fTnfsf4 : Intron1SNPT TTGT T GTGTTTTGTG/T
rs31200646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332298fTnfsf4 : Intron2SNPCCCC CCC ACACCCCACA/C
rs32558692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332301fTnfsf4 : Intron1SNP CC   C  A        A/C
rs32143436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332325fTnfsf4 : Intron2SNPCCCC CCA AC CCCC CA/C
rs30951223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332333fTnfsf4 : Intron2SNPAAAA AAA GAGAAAAGAA/G
rs31914123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332589fTnfsf4 : Intron2SNPT TTATTT ATATTTTATA/T
rs31333656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332731fTnfsf4 : Intron2SNPCCCCACCA ACACCCCACA/C
rs33745737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332920fTnfsf4 : Intron1SNPC CCTC C TCTCCCCTCC/T
rs33745736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163332993fTnfsf4 : Intron1SNPG GGAG G AGAGGGGAGA/G
rs33745735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163333028fTnfsf4 : Intron1SNPC CCGC C GCGCCCCGCC/G
rs33745734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163333270fTnfsf4 : Intron1SNPG GGGG G TGTGGGGTGG/T
rs33745123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163333295fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA A GAGAAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33745122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163333777fTnfsf4 : Intron1SNPA AA A A GAGAAAAGAA/G
rs6193916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163336706fTnfsf4 : Intron1SNP      C G         C/G
rs6194435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163336798fTnfsf4 : Intron1SNP      C T         C/T
rs6194917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163336872fTnfsf4 : Intron1SNP      T C         C/T
rs6195070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163336961fTnfsf4 : Intron1SNP      G A         A/G
rs6195485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163337019fTnfsf4 : Intron1SNP      T G         G/T
rs6195503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163337023fTnfsf4 : Intron1SNP      C T         C/T
rs32474433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163337881fTnfsf4 : Intron1SNPC C   C  A        A/C
rs30550959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338184fTnfsf4 : Intron1SNPAAA   A  T        A/T
rs32604766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338194fTnfsf4 : Intron1SNPTTT   T  C        C/T
rs31988983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338203fTnfsf4 : Intron1SNPCCC   C  A        A/C
rs30561115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338231fTnfsf4 : Intron1SNPTTT   T  C        C/T
rs31793481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338265fTnfsf4 : Intron1SNPGGG   G  A        A/G
rs32453666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338563fTnfsf4 : Intron1SNP CC   C  T        C/T
rs32261468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338708fTnfsf4 : Intron1SNP AA   A  G        A/G
rs31041765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163338850fTnfsf4 : Intron1SNP AA   A  G        A/G
rs32640273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163339797fTnfsf4 : Intron1SNP      A  T        A/T
rs33745121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163339843fTnfsf4 : Intron1SNPA AA A    A AGGA GA/G
rs32154167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163340420fTnfsf4 : Intron1SNP  C      T        C/T
rs31323547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163340435fTnfsf4 : Intron1SNP  C      T        C/T
rs31474369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163340474fTnfsf4 : Intron1SNP  T      A        A/T
rs30609378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163340557fTnfsf4 : Intron1SNP  T      A        A/T
rs32571786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163340873fTnfsf4 : Intron1SNPAAA   A  G        A/G
rs32678320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163340931fTnfsf4 : Intron1SNPTTT   T  C        C/T
rs32177053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163341071fTnfsf4 : Intron1SNPAAA   A  G        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4138224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163342825fTnfsf4 : Intron1SNP     GA           A/G
rs33745120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163345163fTnfsf4 : Intron1SNPC CCGC G GCGCCCCGCC/G
rs33745119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163345180fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33745118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163345855fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33745117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346122fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33745116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346281fTnfsf4 : Intron1SNPC CCTC C TCTCCCCTCC/T
rs33745115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346388fTnfsf4 : Intron1SNPC CCTC T TCTCCCCTCC/T
rs33745114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346430fTnfsf4 : Intron1SNPC CCAC A  C CCCC CA/C
rs33744343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346466fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33744342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346504fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C  T TTTT TC/T
rs33744341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346516fTnfsf4 : Intron1SNPT TTCT C CTCTTTTCTC/T
rs33744340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346653fTnfsf4 : Intron1SNPA AAGA G GAGAAAAGAA/G
rs33744339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163346693fTnfsf4 : Intron1SNP   CT    TCT CC T C/T
rs33744338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163347059fTnfsf4 : Intron1SNPG GGAG A AGAGGGGAGA/G
rs33744337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163347166fTnfsf4 : Coding-Synonymous1SNPC CCTC C TCTCCCCTCC/T
rs31951704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163347818fTnfsf4 : mRNA-UTR2SNPGGGGAGGG AGAGGGGAGA/G
rs33744336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163347821fTnfsf4 : mRNA-UTR1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs33744335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348149fTnfsf4 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G TGTGGGGTGG/T
rs32359707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348236fTnfsf4 : mRNA-UTR1SNP AA   A  T        A/T
rs33744334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348382fTnfsf4 : Locus-Region1SNPT TT T T ATATTTTATA/T
rs32476559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348399fTnfsf4 : Locus-Region2SNPGGGGAGGG AGAGGGGAGA/G
rs32294797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348440fTnfsf4 : Locus-Region2SNPTTTTCTTT CTCTTTTCTC/T
rs32271414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348562fTnfsf4 : Locus-Region2SNPCCCCTCCC TCTCCCCTCC/T
rs33743133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348638fTnfsf4 : Locus-Region1SNPG GG G G AGAGGGGAGA/G
rs31315369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348664fTnfsf4 : Locus-Region2SNPTTTTATTT ATATTTTATA/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31914578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:163348779fTnfsf4 : Locus-Region2SNPTTTT TTT CTCTTTTCTC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory