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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Atrx alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked homolog (human) MGI:103067 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs29074360 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102993586 | f | Atrx : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29074359 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102994394 | f | Atrx : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29074358 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102994715 | f | Atrx : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29074357 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102996066 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29074356 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102996239 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29074355 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102996271 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29074354 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102996348 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31813296 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102996667 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078733 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102996977 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078732 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102997162 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078731 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102997221 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078730 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102997362 | f | Atrx : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31813295 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102997516 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102997607 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078728 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102997909 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078727 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102998287 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078726 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102998310 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078725 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102999067 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31813294 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:102999642 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078724 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103000550 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078463 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103000630 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078462 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103000810 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078461 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103000985 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | G | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078460 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103001086 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078459 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103001181 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs29078458 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103001228 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078457 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103001274 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31812393 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103001536 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078456 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103001996 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078455 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002352 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29078454 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002430 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077943 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002484 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077942 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002514 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077941 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002580 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077940 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002722 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077939 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103002811 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077938 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103003058 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33869115 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103003531 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077937 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103003761 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077936 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103003836 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31812392 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103004418 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077934 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103005665 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077383 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103005782 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077382 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103006270 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077381 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103006401 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077380 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103006573 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33869525 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103006806 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077379 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103006842 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077378 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103006920 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29077377 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103007702 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs29077374 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103008391 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076882 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103008490 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076881 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103008611 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076880 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103009216 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076879 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103009645 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076878 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103009809 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31812391 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103009898 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076877 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103010188 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076876 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103010329 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076874 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103011314 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076373 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103011323 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076371 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103011439 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076369 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103012033 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076367 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103012664 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076366 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103013044 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076365 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103013197 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29076364 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103013271 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075843 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103013282 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075842 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103013694 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075841 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103013899 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075840 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103014220 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075839 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103014347 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075838 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103014569 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31812390 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103014636 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31812389 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103014670 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs29075836 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017105 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075835 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017201 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075834 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017245 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075313 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017706 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075312 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017707 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075311 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017733 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075310 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103017815 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075309 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103018617 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075308 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103018760 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31812388 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103019139 | f | Atrx : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075307 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103019572 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075306 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103019576 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29075304 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | ChrX:103022046 | f | Atrx : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
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