About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Mc1r
melanocortin 1 receptor
MGI:99456

39 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49884258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405086fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPG GGGG   G GGGG   G          G      A G   G A/G
rs47408673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405249fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPA AAAA   G AAAA   A          A      A A   A A/G
rs52011134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405310fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCCC   C          C      C T   C C/T
rs51227439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405333fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCCC   C          C      T C   C C/T
rs51079619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405439fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   A CCAC   C          C      C A   C A/C
rs48237106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405565fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPG GGGG   G GGAG   G          G      G A   G A/G
rs51200340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405576fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPA AAAA   G AAGA   A          A      A G   A A/G
rs51704984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405589fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCTC   C          C      C C   C C/T
rs46664385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405670fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPG GGGG   G GGGG   G          G      G A   G A/G
rs46198455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405706fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   T CCCC   C          C      C C   C C/T
rs33506524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123405960fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
3SNP  A        G   G              A             A/G
rs32599939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406173fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
4SNPCTTCTCT  C CCCTC  C          CT     C C   C C/T
rs47602386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406324fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCCC   C          C      T C   C C/T
rs33032159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406433fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
4SNPAGGAGAG  G AAGGA  A          AG     G G   A A/G
rs51502654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406571fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   G CCGC   C          C      C G   C C/G
rs50577481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406826fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPC CCCC   T CCTC   C          C      C T   C C/T
rs33210052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406851fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
3SNP  A   A    G   G              A             A/G
rs49091233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123406962fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
1SNPG GGGG   G GGAG              G      G A   G A/G
rs4227438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407482rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
1SNP  T TTT  C T    CT                          C/T
rs49142779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407560fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT   T TTCT              T      T C   T C/T
rs4227437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407589rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-NonSynonymous
1SNP  T TTT  T T    GT                          G/T
rs4227436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407618rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-NonSynonymous
1SNP  A AAA  A A    GA                          A/G
rs4227435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407644rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-Synonymous
1SNP  G GGG  G G    AG                          A/G
rs4227434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407647rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-Synonymous
1SNP  T TTT  T T    CT                          C/T
rs4227433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407764rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-Synonymous
1SNP  T TTT  T T    CT                          C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4227432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407811rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-NonSynonymous
6SNPAGGAGAGAAAGAAGGAGAAGGGGAAAGGGAGAAGGGGGGGGGAAA/G
rs4227431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407815rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-Synonymous
1SNP  G GGG  G G    AG                          A/G
rs4227430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123407816rGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-NonSynonymous
1SNP  T TTT  T T    CT                          C/T
rs48431356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123408114fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-NonSynonymous
1SNPC CCCC   C CC C              C      T C   C C/T
rs47579828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123408115fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG   G GGAG              G      G A   G A/G
rs46562323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123409896fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
Tubb3 : Locus-Region
1SNPT TTTT   T TTCT              T      T C   T C/T
rs46744703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123409923fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
Tubb3 : Locus-Region
2SNPC CACA   C CCCCA             CC     C C   C A/C
rs51540820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123410302fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
Tubb3 : Locus-Region
2SNP A         G   G              A             A/G
rs46357043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123410372fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
Tubb3 : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCTC   C          C      C T   C C/T
rs47126818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123410561fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
Tubb3 : Locus-Region
1SNPA AAAA   A AA A              A      A G   A A/G
rs51386684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123410625fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : mRNA-UTR
Tubb3 : Locus-Region
1SNPT TTTT   C TTCT   T          T      T C   T C/T
rs46170184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123411098fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
Tubb3 : Locus-Region
1SNPC CCCC   T CCTC              C      C T   C C/T
rs48930047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123411211fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : Locus-Region
Tubb3 : Locus-Region
1SNPG GGGG   A GGGG              G      G G   G A/G
rs3671779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:123412188fGm20388 : within coordinates of
Mc1r : 1444 bp downstream of
Tubb3 : Intron
5SNPA CT TC  T ATCTA  T          TC     T C   T A/C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/16/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory