About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Vim
vimentin
MGI:98932

88 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28262436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13571987fDwh : within coordinates of
Vim : 1940 bp upstream of
1SNPA AAA A GAA A     A   AA A/G
rs28262435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572159fDwh : within coordinates of
Vim : 1768 bp upstream of
1SNPT TTT T TTTGT    TT   TT G/T
rs28262434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572231fDwh : within coordinates of
Vim : 1696 bp upstream of
1SNPA AAA A AAAGA    AA   AA A/G
rs28262433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572336fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPA AAA A GAAGA    AA   AA A/G
rs28262432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572430fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPT TTT T  TTAT    TT   TTTA/T
rs28262431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572500fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPC CCC C  CCGC    CC   CCCC/G
rs28262430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572869fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPA AAA A  AATA    AA   AAAA/T
rs28262429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13572954fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPT TTT T  TTCT    TT   TTTC/T
rs28262428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13573192fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPA AAA A CAACA    AA   ACAA/C
rs28262427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13573767fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPG GGG G GGGTG    GG   GGGG/T
rs28262426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574085fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPC C C C  CCTC    CC   CCCC/T
rs28262425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574111fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPA AAA A CAACA    AA   AAAA/C
rs28262424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574152fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPC CCC C  CCCC    CC   CCTC/T
rs8238688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574596rDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNP  TT TTTCT     TT   T    C/T
rs8238687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574632rDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNP  TT TTTGT     TT   T    G/T
rs8238686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574824rDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNP  CC CCCAC     CC   C    A/C
rs8238685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574845rDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
2SNPG GGGGGGCGGCG  GGGG G GGGC/G
rs8238691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574878rDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNP  CC CC GC     CC   C    C/G
rs8238690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13574887rDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNP  CC CC TC     CC   C    C/T
rs8238689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575121rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1IN-DEL  CC CC -C     CC   C    -/C
rs8238694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575254rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  AA AAAGA     AA   A    A/G
rs8238693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575414rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
2SNPT TTTTTTGTTGT  TTTT T TTTG/T
rs8238692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575418rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  TT TTTCT     TT   T    C/T
rs28262423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575574fDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C CCCTC    CC   CCCC/T
rs8238697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575677rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  GG GGGCG     GG   G    C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575729rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
2SNPG GGGGGGAGGAG  GGGG G GGGA/G
rs8238695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13575772rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC     CC   C    C/T
rs28262422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576054fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPG GGG G GGGAG    GG   GGGA/G
rs8238698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576231rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCGC     CC   C    C/G
rs8238702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576372rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  GG GGGCG     GG   G    C/G
rs8238701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576430rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1IN-DEL  CC CCC-C     CC   C    -/C
rs8238700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576431rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCGC     CC   C    C/G
rs8238699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576453rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  TT TTTCT     TT   T    C/T
rs28262421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576599fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPC CCC C CCCCC    CC   CCGC/G
rs8238707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576641rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
2SNPT TTTTTTCTTCT  TTTT T TTCC/T
rs8238703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13576787rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
4Mixed  -? ---T-     --   -    -/A/T
rs28262420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13577193fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPT TTT T TTTGT    TT   TTTG/T
rs28262419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13577205fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPC CCC C  CCCC    CC   CCAA/C
rs28262418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13577310fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPC CCC C CCCTC    CC   CCCC/T
rs28262417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13577833fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPG GGG G  GGCG    GG   GGGC/G
rs8238709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13578546rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
2SNPC CCCCCCGCCGC  CCCC C CCGC/G
rs8238708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13578575rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
2SNPA AAAAAAGAAGA  AAAA A AAGA/G
rs28262416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13578804fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPA AAA A  AA A    AA   AAGA/G
rs28262415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13578860fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPA AAA A AAAGA    AA   AAAA/G
rs28262414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579007fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPA AAA A GAAGA    AA   AAAA/G
rs28262413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579074fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPG GGG G GGGAG    GG   GGGA/G
rs8238710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579167fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC     CC   C    C/T
rs8238711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579228fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  TT TTTCT      T   T    C/T
rs8238712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579228fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1IN-DEL  TT TT--T      -   T    -/T
rs8238713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579230fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
4Mixed  TT TT-TT      -   T    -/C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8238717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579231fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC      C   C    C/T
rs8238718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579232fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC      C   C    C/T
rs8238719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579235fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC      C   C    C/T
rs8238720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579237fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC      C   C    C/T
rs8238721
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579237fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1IN-DEL  -- ---T-      -   -    -/T
rs8238722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579240fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC      C   C    C/T
rs8238723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579241fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC      C   C    C/T
rs52318100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579246fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP TC                      C/T
rs28262412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579413fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPC CCC C TCCTC    CC   CCCC/T
rs28262411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579513fDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNPA A A A   AGA    AA   AAAA/G
rs28262410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13579571fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPG GGG G  GG G    GG   GGAA/G
rs28262409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13580227fDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C  CCAC    CC   CCCA/C
rs28262408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13580491fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPT TTT T TTTCT    TT   TTTC/T
rs28262407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13580889fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPT TTT T TTTTT    TT   TTAA/T
rs8238731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581151rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  TT TTTCT     TT   T    C/T
rs8238730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581166rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  TT TTTGT     TT   T    G/T
rs8238729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581176rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC     CC   C    C/T
rs8238728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581204rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1IN-DEL  GG GGG-G     GG   G    -/G
rs8238727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581216rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  GG GGGAG     GG   G    A/G
rs8238726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581225rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  AA AAAGA     AA   A    A/G
rs8238725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581226rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  GG GGGAG     GG   G    A/G
rs8238724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581229rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  GG GGGTG     GG   G    G/T
rs28262406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581351fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPA AAA A  AAGA    AA   AAAA/G
rs28262405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581393fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPA AAA A GAAGA    AA   AAAA/G
rs28262404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581444fDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNPG GGG G GGGAG    GG   GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28262403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581674fDwh : within coordinates of
Vim : Coding-Synonymous
1SNPG GGG G AGGAG    GG   GGGA/G
rs8238732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13581854rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  CC CCCTC     CC   C    C/T
rs8238734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13582360rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1SNP  AA AAAGA     AA   A    A/G
rs8238733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13582364rDwh : within coordinates of
Vim : Intron
1IN-DEL  -- ---T-     --   -    -/T
rs16786038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13582636fDwh : within coordinates of
Vim : mRNA-UTR
2SNPA AAAAAAGAAGAAGAAAAAAAAAAA/G
rs28262402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583037fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNPC CCC C ACCAC    CC   CCCA/C
rs28262401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583128fDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNP  AAA   C ACA         AA A/C
rs8238739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583313rDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNP  AA AAACA     AA   A    A/C
rs8238738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583315rDwh : within coordinates of
Vim : Locus-Region
1SNP  CC CCCTC     CC   C    C/T
rs8238737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583478rDwh : within coordinates of
Vim : 652 bp downstream of
1SNP  GG GGGAG     GG   G    A/G
rs8238736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583481rDwh : within coordinates of
Vim : 655 bp downstream of
1SNP  GG GGGAG     GG   G    A/G
rs8238735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13583546rDwh : within coordinates of
Vim : 720 bp downstream of
1SNP  GG GGGAG     GG   G    A/G
rs8238741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:13584036rDwh : within coordinates of
Vim : 1210 bp downstream of
1SNP  CC CCCAC     CC   C    A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/19/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory