About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Tnni3
troponin I, cardiac 3
MGI:98783

63 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16802865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4469858rTnni3 : Locus-Region1SNP  G  GGGG    GGA GG  GGG    A/G
rs46198257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4469888fTnni3 : Locus-Region1SNPT TTT T  TTGT      TT    TGTG/T
rs8269183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4469932rTnni3 : mRNA-UTR1SNP  GGGGGGGG   G G GG    AG   A/G
rs8269182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4469939rTnni3 : mRNA-UTR1SNP  CCCCCCAC   C C CC    CC   A/C
rs49918674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470104fTnni3 : Intron1SNPC CCC C  CCTC      CC    CTCC/T
rs8269170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470185rTnni3 : Intron1SNP  A  AAAAA   A GA A    A    A/G
rs8269169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470201rTnni3 : Intron1SNP  T  TTTCT   T T TT    T    C/T
rs8269168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470229rTnni3 : Intron2SNPA AAAAAAGAAGAA GAAAAA  A AGAA/G
rs8269167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470230rTnni3 : Intron1SNP  C CCCCCC   C TCCC    C    C/T
rs8269166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470253rTnni3 : Intron1IN-DEL  A  AAAAA   A -AAA    AA   -/A
rs8269145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470270rTnni3 : Intron1SNP  A AAAA A   A G AA    AA   A/G
rs8269146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470270rTnni3 : Intron1SNP  G GGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs8269163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470270rTnni3 : Intron1SNP  G  GGGGG   G AGGG    G    A/G
rs8269165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470270rTnni3 : Intron1IN-DEL  G GGGGGG   G -GGG    G    -/G
rs8269162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470271rTnni3 : Intron1SNP  C CCCC C   C GCCC    C    C/G
rs8269164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470271rTnni3 : Intron1SNP  C CCCC C   C TCCC    CC   C/T
rs8269161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470302rTnni3 : Intron1SNP  A AAAAAA   A GAAA    AA   A/G
rs8269160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470304rTnni3 : Intron1IN-DEL  G  GGGGG   G -GGG    GG   -/G
rs8269159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470306rTnni3 : Intron1SNP  A  AAAA    A GAAA    A    A/G
rs8269158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470310rTnni3 : Intron1SNP  T  TTTTT   T CTTT    TT   C/T
rs8269157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470313rTnni3 : Intron1IN-DEL  -  ----    - G---    --   -/G
rs8269156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470317rTnni3 : Intron1SNP  A  AAAA    A GAAA    AA   A/G
rs8269155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470323rTnni3 : Intron1SNP  G GGGGG    G CGGG    GG   C/G
rs8269154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470329rTnni3 : Intron1SNP  C  CCCCC   C GCCC    CC   C/G
rs8269153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470333rTnni3 : Intron1IN-DEL  -   -  G   - GG       -   -/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8269152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470336rTnni3 : Intron1Mixed  G   GGG    G A-       G   -/A/G
rs8269151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470340rTnni3 : Intron1SNP  A AAAAAA   A GAAA    AA   A/G
rs8269150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470343rTnni3 : Intron1SNP  T TTTT T   T ATTT    TT   A/T
rs8269149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470346rTnni3 : Intron1SNP  A  AAAAA   A GAAA    AA   A/G
rs8269148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470347rTnni3 : Intron1SNP  T TTTTTT   T ATTT    T    A/T
rs8269147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470350rTnni3 : Intron1SNP  A  AAA     A G AA    A    A/G
rs8269171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470620fTnni3 : Intron1SNP  GG GGGG    G A GG    G    A/G
rs8269172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470626fTnni3 : Intron1SNP  AA AAAA    A G AA    A    A/G
rs8269173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470659fTnni3 : Intron1SNP  TT TTTC    T C TT    C    C/T
rs8269174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470662fTnni3 : Intron1SNP  TT TTTC    T C TT    C    C/T
rs8269175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470677fTnni3 : Intron1SNP  CC CCCC    C TCC     C    C/T
rs8269178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470827rTnni3 : Intron1IN-DEL  -T- ----   - T-       -   -/T
rs8269177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4470841rTnni3 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T C T      T   C/T
rs8269176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471033rTnni3 : Coding-Synonymous1SNP  C CCCC C   C T CC     C   C/T
rs8269179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471307fTnni3 : Intron1SNP  CC CCCC    C T C     C    C/T
rs46579309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471319fTnni3 : Intron1SNPG GGG G  GGAG      GG    GAGA/G
rs8269180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471324fTnni3 : Intron1SNP  CC CCCC    C G C     C    C/G
rs51656566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471367fTnni3 : Intron1SNPC CCC C  CCAC      CC    CACA/C
rs8269181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471375fTnni3 : Intron1SNP  TT TTTC    T C T     T    C/T
rs47154151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471776fTnni3 : Intron1SNPG GG    AGGAG      GG    GAGA/G
rs51414174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471830fTnni3 : Intron1SNPT TTT T  TTAT      TT    TATA/T
rs50160821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4471857fTnni3 : Intron1SNPC CCC C TCCTC      CC    CTCC/T
rs50828215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4472145fTnni3 : Intron1SNPG GGG G  GGAG      GG    GAGA/G
rs49127670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4472309fTnni3 : Intron1SNPC TTT T CTTCT      CT    TCCC/T
rs33895229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4472518fTnni3 : Intron2SNPCCTTT TC TTCT      CT    TCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48361178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4472607fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Coding-Synonymous
1SNPG GGG G GG AG      GG    GAGA/G
rs51732364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4472628fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C CCCAC      CC    CACA/C
rs33894723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4472917fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP CA      A                  A/C
rs8269142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473032fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  TT TT T    T C T     T    C/T
rs8269143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473073fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  GG GGGG    G C G     G    C/G
rs8269144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473093fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  GG GGGC    G C G     G    C/G
rs8269134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473132fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  CC CC      C T C     C    C/T
rs8269135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473173fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  GG GGGA    G G G     G    A/G
rs8269136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473176fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  AA AAAA    A T A     A    A/T
rs8269137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473193fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
1SNP  TT TTTT    T G T     T    G/T
rs31092413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473215fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
2SNPCCGGG GCCGGC       CG    GCCC/G
rs8269138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473362fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
2SNP  CC CCCT    CCC C   CCC    C/T
rs8269139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:4473870fDnaaf3 : Locus-Region
Tnni3 : Intron
4Mixed  -- ----    --T -   ---    -/C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory