About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
T
brachyury
MGI:98472

60 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47475760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8432536fT : Locus-Region1SNPA AAAA G AA A GA AGAA/G
rs46744537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8432669fT : Locus-Region1SNPT TTTT C TT T CT TCTC/T
rs46652427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8432740fT : Locus-Region1SNPC CCCC C CC C TC CCCC/T
rs50985819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8432755fT : Locus-Region1SNPG GGGG A GG G AG GAGA/G
rs46516908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8432835fT : Locus-Region1SNPA AAAA A AA A GA AGAA/G
rs46174644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8432890fT : Locus-Region1SNPC CCCC T CC C CC CCCC/T
rs48100197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8433297fT : Locus-Region1SNPG GGGG A GG G GG GGGA/G
rs46453495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8433305fT : Locus-Region1SNPA AAAA A AA A AA ATAA/T
rs49508277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8434303fT : Locus-Region1SNPC CCCC T CC C CC CCCC/T
rs49493340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8434800fT : Intron1SNPA AAAA G AA A AA A AA/G
rs50445732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8434836fT : Intron1SNPC CCCC C CC C CC CTCC/T
rs49430179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435058fT : Intron1SNPA   AA T       A A AA/T
rs45998903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435093fT : Intron1SNPG GGGG G GG G GG GAGA/G
rs49777590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435272fT : Coding-Synonymous1SNPG GGGG T GG G GG GGGG/T
rs51284438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435401fT : Coding-Synonymous1SNPG GGGG T GG G GG GGGG/T
rs50140458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435515fT : Intron1SNPA AAAA A AA A AA ATAA/T
rs29504049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435652fT : Intron3SNPTTCCCCC  CC C  C C CC/T
rs49109066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435653fT : Intron1SNP  CCCC G CC C GC C CC/G
rs48804697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435677fT : Intron1SNPG GGGG G GG G AG GGGA/G
rs47819927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435720fT : Intron1SNPG GGGG A GG G AG GAGA/G
rs50811005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435752fT : Intron1SNPG GGGG C GG G GG GGGC/G
rs47602716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435886fT : Intron1SNPC CCCC C CC C CC CTCC/T
rs48532747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8435910fT : Intron1SNPG GGGG G GG G AG G GA/G
rs51398555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8436416fT : Intron1SNPG GGGG G GG G AG GAGA/G
rs49442459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437019fT : Coding-Synonymous1SNPC CCCC T CC C CC CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6170463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437273fT : Intron1SNP      A C           A/C
rs6170558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437323fT : Intron1SNP      G A           A/G
rs6171618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437506fT : Intron1SNP      C T           C/T
rs6172106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437579fT : Intron2SNPG GGGGGAAGG G AG GAGA/G
rs6172682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437673fT : Intron1SNP      G A           A/G
rs6172701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437684fT : Intron2SNPG GGGGGAAGG G AG G GA/G
rs6172774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437723fT : Intron2SNPC CCCCCCGCC C CC CGCC/G
rs47041777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437871fT : Intron1SNPT TTTT G TT T GT T  G/T
rs49469751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8437902fT : Intron1SNPA AAAA G AA A AA AAAA/G
rs46355305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8438258fT : Intron1SNPG GGGG G GG G AG GAGA/G
rs47475799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8438455fT : Intron3SNPCCTCTT   TT TT CCT CC/T
rs48907684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8438533fT : Intron1SNPG GGGG G GG G GA GGGA/G
rs49746991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8439036fT : Intron1SNPA AAAA   AA A TA ATAA/T
rs49427979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8439914fT : Coding-Synonymous1SNPT TTTT C TT T CT TCTC/T
rs50608810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8440149fT : Intron1SNPA AAAA C AA A AA AAAA/C
rs49645468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8440328fT : Intron1SNPA AAAA G AA A AA AAAA/G
rs51800558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8440388fT : Intron1SNPC CCCC T CC C CC CCCC/T
rs45746278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8440647fT : Intron1SNPG GGGG A GG G GG GGGA/G
rs50609470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8440650fT : Intron1SNPT TTTT T TT T AT TATA/T
rs50426837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8441017fT : Intron1SNPG GGGG A GG G GG GGGA/G
rs51354830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8441124fT : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT TGTG/T
rs50625444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8441220fT : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG GGGA/G
rs45739998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8441424fT : Intron1SNPC CCCC C CCTC TC CTCC/T
rs33684691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8441719fT : Coding-Synonymous2SNPAAGGGGGG GGAG AG GAGA/G
rs50569488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8441863fT : Coding-Synonymous1SNPT TTTT C TTCT CT TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51063100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8442124fT : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTCT CT TCTC/T
rs48237184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8442411fT : mRNA-UTR1SNPT TTTT T TTCT CT TCTC/T
rs47841648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8442521fT : Locus-Region1SNPG GGGG A GGAG AG GAGA/G
rs46431353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8442800fT : Locus-Region1SNPG GGGG G GGAG AG GAGA/G
rs47938750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8442856fT : Locus-Region1SNPT TTTT C TTCT CT TCTC/T
rs51088429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8443385fT : 889 bp downstream of1SNPC CCCC G CCGC GC CGCC/G
rs51965874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8443470fT : 974 bp downstream of1SNPT TTTT G TTTT TT TTTG/T
rs51772958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8443602fT : 1106 bp downstream of2SNPA ATAA A AAAAAATTAAAA/T
rs51919673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8443740fT : 1244 bp downstream of1SNPC CCCC C CCTC TC CTCC/T
rs45909195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:8444476fT : 1980 bp downstream of1SNPC CCCC A CCAC AC CACA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/01/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory