About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Syn1
synapsin I
MGI:98460

75 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Exclude SNPs that map to multiple locations

Legend
*The reference flanking sequence for this SNP maps to multiple locations in the mouse genome.
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29688749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20860894fAraf : Intron
Syn1 : mRNA-UTR
1SNPA A A   A A G     A    GAA/G
rs29688752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20861253fSyn1 : mRNA-UTR1SNPG GGG G G GGAG   GG   GGGA/G
rs29689565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20861912fSyn1 : Intron1SNPC CCC C T CCT    CC   CTTC/T
rs29689568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20862407fSyn1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA   AA   AGAA/G
rs29689571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20862669fSyn1 : Coding-Synonymous1SNPA AAA A   AA      A    G A/G
rs29690344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20863446fSyn1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA   AA   AGGA/G
rs29690347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20863864fSyn1 : Intron1SNPG GGG G G GG G   GG   GAGA/G
rs29690350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20864637fSyn1 : Intron1SNPA AAA A A AAGA   AA   AGAA/G
rs29690353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20864707fSyn1 : Intron1SNPG GGG G G GG G   GG   GAGA/G
rs29691226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20865289fSyn1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG   GG   GGGA/G
rs29691229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20865651fSyn1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG   GG   GGGA/G
rs29691232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20866122fSyn1 : Intron1SNPT TTT T T TTCT   TT   TCTC/T
rs29692185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20866148fSyn1 : Intron1SNPT TTT T T TTCT   TT   TCTC/T
rs29692188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20866608fSyn1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC   CC   CCCC/T
rs29692191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20866849fSyn1 : Intron1SNPA AAA A A AA A   AA   AGAA/G
rs29685066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20866910fSyn1 : Intron1SNPA AAA A T AAA    AA   AAAA/T
rs29685068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20867185fSyn1 : Intron1SNPA AAA A G AAAA   AA   AAAA/G
rs29685071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20868995fSyn1 : Intron
Timp1 : Locus-Region
1SNPA AAA A A AAGA   AA   AGAA/G
rs29685864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20869575fSyn1 : Intron
Timp1 : Locus-Region
1SNPT TTT T A TTTT   TT   TTTA/T
rs29685867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20869924fSyn1 : Intron
Timp1 : Locus-Region
1SNPG GGG G G GGAG   GG    GGA/G
rs29685870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20870038fSyn1 : Intron
Timp1 : Locus-Region
1SNPC CCC C C CCTC   CC   CCCC/T
rs29685873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20870270fSyn1 : Intron
Timp1 : mRNA-UTR
1SNPT TTT T C TTCT   TT   TCTC/T
rs29686666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20870320fSyn1 : Intron
Timp1 : mRNA-UTR
1SNPC CCC C C CCT    CC   CTCC/T
rs29686669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20872900fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPA AAA A C AACA   AA   ACAA/C
rs29686672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873113fSyn1 : Intron
Timp1 : Coding-NonSynonymous
1SNPA AAA A A AAGA   AA   AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29687425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873157fSyn1 : Intron
Timp1 : Coding-Synonymous
1SNPT TTT T T TTCT   TT   TCTC/T
rs29687428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873572fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT   TT   TTTC/T
rs29687431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873653fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPT TTT T C TTCT   TT   TCTC/T
rs29688214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873759fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPC CCC C A CCCC   CC   CCCA/C
rs29688217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873834fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPC CCC C T CCCC   CC   CCCC/T
rs29688220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873838fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPC CCC C C CCGC   CC   CGCC/G
rs29688223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873862fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPT TTT T C TTCT   TT   TCTC/T
rs29688996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20873937fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPA AAA A A AATA   AA   ATAA/T
rs29688999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20874312fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPA AAA A T AATA   AA   ATAA/T
rs29689002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20874753fSyn1 : Intron
Timp1 : Intron
1SNPT TTT T A TTTT   TT   TTTA/T
rs29689875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20875809fSyn1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG   GG   GAGA/G
rs29689878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20876018fSyn1 : Intron1SNPG GGG G   G A    GG   GAGA/G
rs29689881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20876282fSyn1 : Intron1SNPG GGG     G C    GG    G C/G
rs29690824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20878134fSyn1 : Intron1SNPG GGG     G AG    G    AGA/G
rs216319176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20880193fSyn1 : Intron1SNP              A    C     A/C
rs29690827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20880531fSyn1 : Intron1SNPG GGG     G      GG   GAGA/G
rs29690830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20880659fSyn1 : Intron1SNP  GGG     G A    GG    A A/G
rs29690833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20880840fSyn1 : Intron1SNP  CCC C   C C    CC    TCC/T
rs6226792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20881300fSyn1 : Intron1SNP       T C               C/T
rs29691646 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20886856fSyn1 : within coordinates of1SNPG GGG G C GGCG   GG   GCGC/G
rs29691649 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20886934fSyn1 : within coordinates of2SNPA AAA A G AAGA   AA   AGGA/G
rs31419678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20888387fSyn1 : Intron2SNP TA    A  A              A/T
rs29691652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20898693fSyn1 : Intron1SNPC CCC C C CCTC   CC   CTCC/T
rs29692605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20899698fSyn1 : Intron1SNPG GGG G G GGCG   GG   GGGC/G
rs29692608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20900038fSyn1 : Intron1SNPT TTT T G TTG    TT   TGTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29692611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20900061fSyn1 : Intron1SNPC CCC G C CCCC   CC   CCCC/G
rs29684475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20900107fSyn1 : Intron1SNPT TTT     TTCT   TT   TCTC/T
rs29684478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20904275fSyn1 : Intron1SNPT T     C   C    TT      C/T
rs29684481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20904522fSyn1 : Intron1SNPC CCC C T CCTC   CC   CTCC/T
rs29685254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20904690fSyn1 : Intron1SNPA AAA       C     A    CAA/C
rs29685257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20904731fSyn1 : Intron1SNPC CCC C C CCGC   CC   CCCC/G
rs29685260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20906979fSyn1 : Intron1SNPG GGG G G GGG    GG   GTGG/T
rs29685263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20907173fSyn1 : Intron1SNP        A   G          A A/G
rs29686036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20907622fSyn1 : Intron1SNP        T   T          C C/T
rs29686039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20908387fSyn1 : Intron1SNP        C   C          T C/T
rs29686042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20908422fSyn1 : Intron1SNP        C   C          T C/T
rs29686935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20909436fSyn1 : Intron1SNP        A   A          C A/C
rs29686938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20909559fSyn1 : Coding-NonSynonymous1SNP        T   T          C C/T
rs29686941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20910719fSyn1 : Intron1SNP        A   G          G A/G
rs29687854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20912973fSyn1 : Intron1SNP        T   C          C C/T
rs29687857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20913266fSyn1 : Intron1SNP        G   G          A A/G
rs29687860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20913288fSyn1 : Intron1SNP        G   A          A A/G
rs29687863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20913347fSyn1 : Intron1SNP        T   C          C C/T
rs29688796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20913479fSyn1 : Intron1SNP            T          G G/T
rs107660075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20913718fSyn1 : Intron1SNP A        A          C   A/C
rs107754081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20914137fSyn1 : Intron1SNP CC       C          T   C/T
rs29688799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20915487fSyn1 : Intron1SNP   G    A G A         GA A/G
rs8238248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:20921629rSyn1 : Locus-Region1SNP  CC CCCT C    CC   C    C/T
rs29691646 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:21371811f 1SNPG GGG G C GGCG   GG   GCGC/G
rs29691649 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:21371889f 2SNPA AAA A G AAGA   AA   AGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/16/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory