About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Cyp19a1
cytochrome P450, family 19, subfamily a, polypeptide 1
MGI:88587

100 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29739256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54011791fCyp19a1 : Locus-Region1SNPTTT    G  G              G/T
rs29594722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54011792fCyp19a1 : Locus-Region1SNPAAA    G  G              A/G
rs45686750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54011927fCyp19a1 : Locus-Region1SNPT TTT T T TTCT     T  TTTC/T
rs8240044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012082fCyp19a1 : Locus-Region1SNP   T  T C           T    C/T
rs8240045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012201fCyp19a1 : Locus-Region1SNP   C  C T           C    C/T
rs48686165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012384fCyp19a1 : Locus-Region1SNPC CCC C   CCTC    CC  CCCC/T
rs33748630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012634fCyp19a1 : Locus-Region1SNP TT    C  C              C/T
rs46990107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012751fCyp19a1 : Locus-Region1SNPA AAA A A AACA    AA  AAAA/C
rs8259445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012790fCyp19a1 : Locus-Region1SNP  TT TTTG T   T TT  TT   G/T
rs8259446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012792fCyp19a1 : Locus-Region3SNPGGGAGGGAG AA GA GA AGAAAGA/G
rs8259447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012794fCyp19a1 : Locus-Region2SNP GGA GGAG A   A GA  GA   A/G
rs48607715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54012933fCyp19a1 : Locus-Region1SNPA AAA A   AAGA     A  AAAA/G
rs8259448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54013017fCyp19a1 : Locus-Region1SNP  GGGGGGA G   GGGG  GG   A/G
rs8259444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54013238rCyp19a1 : Locus-Region1SNP  ACAAACA C   CAAC  AC   A/C
rs8259443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54013403rCyp19a1 : Locus-Region3SNPAAACAAACA CC A AACCCACCCAA/C
rs48620861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54014155fCyp19a1 : mRNA-UTR1SNPT TCT T T CC T    CC  CCTC/T
rs47925091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54014240fCyp19a1 : mRNA-UTR1SNPC CCC C C CCAC    CC  CCCA/C
rs30138615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54014560fCyp19a1 : mRNA-UTR2SNPCCCTC CTC TTTC    TT  TTCC/T
rs46530594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54015207fCyp19a1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG    GG  GGGA/G
rs29894070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54015427fCyp19a1 : Intron2SNPTTTCT T T CCCT    CC  CCTC/T
rs29597490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54015606fCyp19a1 : Intron2SNP TTCT T C CCCC    CC  CCTC/T
rs30275493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54016079fCyp19a1 : Intron2SNPAAAGA AGA GGGA    GG  GGAA/G
rs46165853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54016151fCyp19a1 : Intron1SNPA AGA A A GGGA    GG  GGAA/G
rs30476118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54016242fCyp19a1 : Intron2SNPCCCGC CGC GG C     G  GGCC/G
rs33632738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54016740fCyp19a1 : Intron2SNPC CTC C C TTTC    TT  TTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46326160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54016846fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C C CC C    CC  CCTC/T
rs48837155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54017201fCyp19a1 : Intron1SNPT TCT T C CCCT    CC  CCTC/T
rs30335048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54017564fCyp19a1 : Intron2SNPGGGCG G G CC G     C  CCGC/G
rs49810377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54018067fCyp19a1 : Intron1SNPA AGA A G GGGA    GG  GGAA/G
rs29594921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54018530fCyp19a1 : Intron1SNPA G       G              A/G
rs29745144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54018678fCyp19a1 : Intron2SNPG GTG G G TT G    TT  TTGG/T
rs51238436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54018706fCyp19a1 : Intron1SNPG GGG G G TGGG    GG  GGGG/T
rs51661569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54020426fCyp19a1 : Intron1SNPT TTT T C TTTT    TT  TTTC/T
rs50127030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54020428fCyp19a1 : Intron1SNPG CGC C G GGGC    GG  GGGC/G
rs50115773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54020489fCyp19a1 : Coding-Synonymous1SNPG GGG G A GG G     G  GGGA/G
rs51988106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54020539fCyp19a1 : Coding-NonSynonymous1SNPT TTT T C TT T     T  TTTC/T
rs47117750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54021348fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CC C    CC  CCCC/T
rs47907040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54021427fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC    CC  CCCC/T
rs47514464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54021520fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A G AA A     A  AAAA/G
rs49492618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54021957fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC    CC  CCCC/T
rs51787569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54022527fCyp19a1 : Intron1SNPG GGG G C GGGG    GG  GGGC/G
rs52042572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54022561fCyp19a1 : Intron1SNPT TTT T C TT T    TT  TTTC/T
rs49681314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54022696fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC     C  CCCC/T
rs29887131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54022712fCyp19a1 : Intron1SNPAAG    G                 A/G
rs6255786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54022755fCyp19a1 : Intron2SNPT TTT TTCCTTTT    TT  TTTC/T
rs46793122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54023224fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A T AA A     A  AAAA/T
rs49256604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54023955fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A G AAAA    AA  AAAA/G
rs48199525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54023968fCyp19a1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG    GG  GGGA/G
rs29877215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54024043fCyp19a1 : Intron1SNP G     A  A              A/G
rs46518004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54024151fCyp19a1 : Intron1SNPT TTC   T TTT     TT  TTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51699608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54024229fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC    CC  CCCC/T
rs30185270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54024879fCyp19a1 : Intron1SNPT T    C  C              C/T
rs33718531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54025634fCyp19a1 : Intron2SNPGGGGG G G AAGG    AA  AGGA/G
rs33733348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54026103fCyp19a1 : Intron2SNPT TCT TCC CCCT    TC  CCCC/T
rs48815173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54026420fCyp19a1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG    GG  GGGA/G
rs47837496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54026495fCyp19a1 : Intron1SNPT TGT T G GGGT    TG  GGGG/T
rs33683597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54027149fCyp19a1 : Intron2SNPCCCTC  TC TTCC    C   TTCC/T
rs33746960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54027596fCyp19a1 : Intron2SNPAAAGA AGG GGGA    AG  GGGA/G
rs30486781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54028172fCyp19a1 : Intron1SNP AA       G              A/G
rs49020378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54028366fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC    CC  CCCC/T
rs48655333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54029143fCyp19a1 : Intron1SNPG GCG G G CCGG    GG  CCCC/G
rs47083044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54029310fCyp19a1 : Intron1SNPT TTT T C TTCT    TT  TTTC/T
rs46106975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54029505fCyp19a1 : Intron1SNPG GAG G G AAGG    GA  AAAA/G
rs52495672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54029815fCyp19a1 : Intron1SNPA GAG G A AAAG    AA  AAAA/G
rs51915265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54029913fCyp19a1 : Intron1SNPA AGA A G GGGA    A   GGGA/G
rs33708185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54030829fCyp19a1 : Intron1SNP  A    G  G              A/G
rs33678477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54030830fCyp19a1 : Intron1SNP  C    T  T              C/T
rs29653654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54030839fCyp19a1 : Intron2SNPG GA  GAG AAGG        AAAA/G
rs47000973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54030841fCyp19a1 : Intron1SNPG GA      AAGG     G  AAAA/G
rs47854610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54030966fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC    CC  CCCC/T
rs30479642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54031059fCyp19a1 : Intron2SNPG GAG GAA AAAG    AA  AAAA/G
rs50820947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54031118fCyp19a1 : Intron1SNPC AAA A A AAAA    AA  AAAA/C
rs29937915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54031350fCyp19a1 : Intron2SNPGGGAG GAG AAAG    GA  AAAA/G
rs48045952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54031701fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C C CCCC    AA  CCCA/C
rs46847334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54031774fCyp19a1 : Intron1SNPG GAG G   AA G     A  AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51239086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54031930fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA    AA  AAAA/G
rs50397060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54032214fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A C AA A    AA  AAAA/C
rs51133570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54032449fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A G AAAA    AA  AAAA/G
rs30079405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54032681fCyp19a1 : Intron2SNPTTTGT TGG GGGT    TG  GGTG/T
rs30226720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54033014fCyp19a1 : Intron2SNPA AGA AGG GGGA    AG  GGAA/G
rs30280428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54033286fCyp19a1 : Intron2SNPA ACA ACC CCCA    AC  CCAA/C
rs30525230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54033311fCyp19a1 : Intron2SNPT TCT TCC CCCT    TC  CCTC/T
rs47023266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54033431fCyp19a1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA    A   AAAA/G
rs30390934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54034168fCyp19a1 : Intron2SNPCCCTC CTC TT C    C   TTCC/T
rs50446739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54034873fCyp19a1 : Intron1SNPC CCC C C CCCC    CC  CCTC/T
rs29887989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54034973fCyp19a1 : Intron2SNPAAAGA A G GGGA    AG  GGAA/G
rs50697766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54035075fCyp19a1 : Intron1SNPG GGG G G GGGG    GG  GGAA/G
rs51721771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54035345fCyp19a1 : Intron1SNP  AAA A C  ACA    AA  AAAA/C
rs50559244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54035947fCyp19a1 : Intron1SNP  CCC C T CC C     C  CCCC/T
rs47007361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54036906fCyp19a1 : Intron1SNP  GGG G A GGGG     G  GGGA/G
rs47961590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54037507fCyp19a1 : Intron1SNP  T T T G TT T        TT G/T
rs45780469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54037929fCyp19a1 : Intron1SNP  GGG G A GGAG     G  GGGA/G
rs49369193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54038677fCyp19a1 : Intron1SNP  CCC C T CC C     C   CCC/T
rs49221235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54039004fCyp19a1 : Intron1SNP  GGG G A GG G     G  GGGA/G
rs48573147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54039100fCyp19a1 : Intron1SNP  CCC C T CC C     C  CCCC/T
rs51608111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54039516fCyp19a1 : Intron1SNP  CCC   T  C C     C   CCC/T
rs49081009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54040270fCyp19a1 : Intron1SNP  AAA A G AA A     A  AA A/G
rs48397367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54040800fCyp19a1 : Intron1SNP  AAA A G AA A    AA  AAAA/G
rs30318057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54041020fCyp19a1 : Intron2SNP TTCT TCC CCCT     C  CCTC/T
rs51541878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:54041283fCyp19a1 : Locus-Region1SNP  CCC C T CCCC     C  CCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory