About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Ren1
renin 1 structural
MGI:97898

219 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3164380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245505rRen1 : Locus-Region1SNP  TATTTT A A        A  TT A           AT     A A        A/T
rs16812288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245527rRen1 : Locus-Region1SNP  TTTTTT C T   T   TT TTT T       T   TT  T  T T        C/T
rs16812285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245549rRen1 : Locus-Region3IN-DEL  A-AAAA A -   -   -- -AA -       -   -A  -  - -        -/A
rs3164379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245628rRen1 : Locus-Region1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG A       A   AG     A A        A/G
rs33550117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245683fRen1 : Locus-Region1SNPT CTC C    T TT          T           C        T       T C/T
rs33550115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245849fRen1 : Locus-Region1SNP  TCT T  T CCCC          C           T        C  C    C C/T
rs33557468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135245961fRen1 : Locus-Region1SNPT CT  C  C TTTT          T           C        T  T    T C/T
rs16812070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246499rRen1 : Locus-Region1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246510rRen1 : Locus-Region1SNP  TGTTTT T G   G   GG GTT G       G   GT  G  G G        G/T
rs16812068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246614rRen1 : Locus-Region1SNP  AAAAAA T A   A   AA AAA A       A   AA  A  A A        A/T
rs16812067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246616rRen1 : Locus-Region1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246625rRen1 : Locus-Region1SNP  GAGGGG G A   A   AG AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs33557466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246626fRen1 : Locus-Region1SNP  CT  C       T                      C                T C/T
rs16812065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246648rRen1 : Locus-Region1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246666rRen1 : Locus-Region1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246667rRen1 : Locus-Region1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246677rRen1 : Locus-Region1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246678rRen1 : Locus-Region1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246693rRen1 : Locus-Region1SNP  CCCCCC T C   C   CC CCC C       C   CC  C  C C        C/T
rs16812059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246712rRen1 : Locus-Region1SNP  CTCCCC C T   T   TC TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246738rRen1 : Locus-Region5Mixed  -A---- - A   A   AA A-- A       A   A-  A  A A        -/A/C
rs16812053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246756rRen1 : Locus-Region1SNP  TATTTT T A   A   AA ATT A       A   AT  A  A A        A/T
rs16812052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246763rRen1 : Locus-Region1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246764rRen1 : Locus-Region1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs16812181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246810rRen1 : Locus-Region1SNP  AGAAAA G G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16812180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246833rRen1 : Locus-Region1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246841rRen1 : Locus-Region1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246961rRen1 : Locus-Region1SNP  TATTTT T A   A   A  ATT A       A   A   A  A A        A/T
rs16812177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246967rRen1 : Locus-Region1SNP  AGAA A G G   G   G   AA         G   G   G             A/G
rs16812176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135246976rRen1 : Locus-Region1SNP  AGAA A A G   G   G  GAA         G   G   G  G G        A/G
rs16812175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247003rRen1 : Locus-Region1Mixed  CTCCCC C T   -      TCC T           T   T             -/C/T
rs33557464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247201fRen1 : Locus-Region1SNP  G G G  G   A                                          A/G
rs16812093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247203fRen1 : Locus-Region1SNP  GTGGGG G T   T   TT TGG T       T   TG  T  T T        G/T
rs33556212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247291fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  AGA A    G GG                      A        G       G A/G
rs16812094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247444fRen1 : Intron2SNPG AGAAAA A G  GG   GG GAAGG       G  AGA  G  G G G      A/G
rs16812095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247451fRen1 : Intron2SNP  AGAAAA G G GGG   GG GAA G       G  AGA  G  GGG      G A/G
rs16812096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247514fRen1 : Intron1SNP  CACCCC C A   A   AA ACC A       A   AC  A  A A        A/C
rs16812097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247520fRen1 : Intron1SNP  GCGGGG G C   C   CC CGG C       C   CG  C  C C        C/G
rs16812100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247755rRen1 : Intron1SNP       G C             G                                C/G
rs16812099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135247961rRen1 : Intron1SNP       A T             A               A                A/T
rs16812098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248036rRen1 : Intron1SNP  T  T   A             A               C                A/C/T
rs3166408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248283fRen1 : Intron1SNP  T TTTT C C   C    C CTT C       C    T  C  C          C/T
rs16812297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248384rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248404rRen1 : Intron1SNP  TCTTTT C C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248538rRen1 : Intron1SNP  C CCCC C            ACC             AC                A/C
rs33556209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248584fRen1 : Intron1SNPG AGA A  A GGGG          G                    G  G    G A/G
rs16812294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248613rRen1 : Intron2SNP  CACCCC C A A A   CA ACC C       C  CAC  A  AAA      A A/C
rs16812293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248626rRen1 : Intron1SNP  CCCCCC T C   C   CC CCC C       C   CC  C  C C        C/T
rs16812292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248653rRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248662rRen1 : Intron1SNP  CCCCCC T     C   C   CC C       C   CC  C  C C        C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16812290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248672rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs16812071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248830rRen1 : Intron1IN-DEL  G  -     G           -                                -/G
rs16812072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135248830rRen1 : Intron1IN-DEL  -  G     G           G                                -/G
rs33556206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249109fRen1 : Intron1SNP  AG  A      G           G           A                  A/G
rs33556204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249139fRen1 : Intron1SNP   T  C    T TT          T           C           T    T C/T
rs16812087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249369rRen1 : Intron1SNP  CTCC C C T   T   T  TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249370rRen1 : Intron1SNP  TGTTTT T G   G   G  GTT G       G   GT  G  G G        G/T
rs16812085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249414rRen1 : Intron1SNP  TGTTTT T G   G   G  GTT G       G   GT  G  G G        G/T
rs16812084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249442rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A   A  AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs16812083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249454rRen1 : Intron1SNP  ACAAAA A C   C   C  CAA C       C   CA  C  C C        A/C
rs16812082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249462rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs33555332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249488fRen1 : Intron1SNPG TG  T    GGGG          G           T        G  G    G G/T
rs16812081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249577rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A   A  AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs16812080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249625rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   T  TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249634rRen1 : Intron1SNP  TGTTTT T G   G   GG GTT G       G   GT  G  G G        G/T
rs16812078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249654rRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249657rRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249694rRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249696rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249745rRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   G  GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812073
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249818rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   T  TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs33555330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249849fRen1 : Intron1SNP  GCC G  C CCCC                      G        C         C/G
rs16812298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249939fRen1 : Intron2SNPT CTCCCC C T TTT   TT  CCTT          CT      TTT T    T C/T
rs16812299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249963fRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G         AA AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs16812300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249971fRen1 : Intron1SNP  C CCCC T T           CC T            C                C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16812301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249976fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249992fRen1 : Intron1SNP  C CCCC C A       AA ACC A            C  A    A        A/C
rs16812303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135249993fRen1 : Intron1SNP  C CCCC C         T   CC         G    C  T             C/G/T
rs16812304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250037fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CG CTT C       C    T  C  C          C/G/T
rs16812305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250168fRen1 : Intron1SNP  ACAAAA A C   C   CC CAA C       C   CA  C  C C        A/C
rs16812306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250334fRen1 : Intron1SNP  G GGGG G         A   GG              G                A/G
rs16812307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250340fRen1 : Intron1SNP  C CCCC A         A   CC              C                A/C
rs16812183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250389fRen1 : Intron1SNP  C CCCC C A       A  ACC A            C  A             A/C
rs16812184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250391fRen1 : Intron1IN-DEL  T TTTT T -   -   -- -TT -       -   -T  -  -          -/T
rs32572071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250489fRen1 : Intron1SNP G         A                                            A/G
rs16812185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250567fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA         G    A  G    G        A/G
rs16812186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250639fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250654fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GA  G    G        A/G
rs16812188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250710fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG A       A   AG  A    A        A/G
rs16812189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250725fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C    C        C/T
rs16812190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250768fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  AAAAAA A A   A   AC AAA A       A   AA  A    A        A/C
rs16812191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250787fRen1 : Coding-NonSynonymous1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG         A   AG  A    A        A/G
rs16812192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250804fRen1 : Coding-NonSynonymous1SNP  C CCCC C T   T   TT TCC             TC                C/T
rs16812193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250830fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCC T C   C   CC CCC C       C   CC  C    C        C/T
rs16812194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250864fRen1 : Intron2SNPG AGAAAA G GGGGG   GG GAAGG       G  AGA  G   GG G    G A/G
rs16812195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250974fRen1 : Intron1SNP  GAGGGG A     A   A   GG A       A   AG                A/G
rs16812196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135250984fRen1 : Intron1SNP  G GGGG A             GG              G                A/G
rs16812198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251175rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251444rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCC T C   C   CC CCC C       C   CC  C  C          C/T
rs33555326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251447fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  TCT T      C                       T        C       C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33555324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251707fRen1 : Intron1SNPA GA  G  G AAAA                      G        A       A A/G
rs3022836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251786fRen1 : Intron2SNP  CTCCCC C T T T   T  TCC T       T  CTC  T  TTT      T C/T
rs16812092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251794rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T       CC              C     T T        C/T
rs16812091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251878rRen1 : Intron1IN-DEL  -T----       -      T--         T   T-     T T        -/T
rs16812090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251920rRen1 : Intron1SNP  C CCCC T             CC              C                C/T
rs16812089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135251999rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A          AGG         A   AG                A/G
rs3022837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252127fRen1 : Coding-Synonymous2SNP  CCCCCC T C C         CCC           C        C  C    C C/T
rs16812088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252154rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  CTCCCC T            TCC             TC                C/T
rs33554520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252363fRen1 : Intron1SNP  GA  G  G AAAA          A           G        A  A    A A/G
rs33554518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252433fRen1 : Intron1SNPT CTC C  C TTTT          T           C        T  T    T C/T
rs16812199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252674fRen1 : Intron1SNP   G       G   G   GA G   G       G   G   G  G G        A/G
rs33554516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252735fRen1 : Intron1SNPA GAG G  G AAAA          A           G        A       A A/G
rs33554514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252784fRen1 : Intron1SNPC TC  T  T CCCC          C           T        C  C    C C/T
rs16812211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252852rRen1 : Intron1SNP  ACAAAA A C   C   C  CAA C       C   CA  C  C C        A/C
rs16812210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252854rRen1 : Intron1SNP  GTGGGG G T   T   T  TGG T       T   TG  T  T T        G/T
rs16812209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135252917rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   T  TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253034rRen1 : Coding-NonSynonymous2SNP  TGTTTT T GGGGG   G  GTTGG       G  TGT  G  GGG        G/T
rs16812207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253045rRen1 : Coding-Synonymous2SNP  ACAAAA A C C C   C  CAA C       C  ACA  C  CCC      C A/C
rs16812206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253078rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  AGAAAA A G   G   G  GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253087rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  AGAAAA A G   G   G  GAA G       G   GA  G  G G        A/G
rs16812204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253126rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  TCTTTT T C   C   C  CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs16812203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253133rRen1 : Coding-NonSynonymous1SNP  CTCCCC C T   T   T  TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253277rRen1 : Intron2SNP  TCTTTT T CCCCC   C  CTTCC       C  TCT  C  CCC T    C C/T
rs16812201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253313rRen1 : Intron1SNP  A AA   A G   G   G   AA G       G   G   G  G G        A/G
rs16812200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253319rRen1 : Intron1SNP  G GGGG G A   A   A   G  A       A   A   A  A A        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16812218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253442rRen1 : Intron1SNP      TT T                        C                     C/T
rs16812217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253519rRen1 : Intron1SNP      CC C                        T                     C/T
rs16812216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253587rRen1 : Intron1SNP      TT T                        C                     C/T
rs16812215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253604rRen1 : Intron1SNP      CC C                        T          T          C/T
rs16812214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253609rRen1 : Intron1SNP   C  TT T         C              C                     C/T
rs16812213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253825rRen1 : Intron2SNP  CTC CC C T T      T             T  C                T C/T
rs16812212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135253836rRen1 : Intron1SNP      TT A                        T                     A/T
rs3166345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254018fRen1 : Intron1SNP  A AAAA G G   G    G  AA             GA  G  G G        A/G
rs3166346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254216fRen1 : Intron1SNP  GCGGGG G C   C   CC CGG C       C   CG  C  C C        C/G
rs3166347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254246fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs3164373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254334rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs3166282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254340rRen1 : Intron2SNP  TCTTTT C C C C   CC CTT C       C  TCT  C  C C      C C/T
rs16812229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254495rRen1 : Intron1SNP  A AAAA A             A                  G             A/G
rs16812228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254518rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG A A   A   AA AGG A       A   AG  A  A A        A/G
rs16812223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254685rRen1 : Intron5Mixed  G-GGGG G -   -   -- -GG -       -   -G  -  - -        -/A/C/G
rs16812222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254697rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs3164449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254896fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135254919rRen1 : Intron2Mixed  -?---- - ?   ?   ?? ?-- ?       ?   ?-  ?  ? ?        -/A/G
rs3166348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255020fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CT  C  C C        C/T
rs3164450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255023fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255032rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCC C C   C   CT CCC C       C   CC  C  C C        C/T
rs3166349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255038fRen1 : Coding-Synonymous2SNP  TCTTTT T C   C   C  CTTCC       C  TCT  C  C C      C C/T
rs3166281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255114rRen1 : Intron1SNP  A AAAA A     G       AA              A                A/G
rs3164371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255256rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255280rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3164370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255293rRen1 : Intron1SNP  A AAAA A G          GAA G       G    A  G             A/G
rs16812119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255294rRen1 : Intron1SNP  C CCCC T C          CCC C       C    C  C             C/T
rs16812118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255312rRen1 : Intron1SNP  G GGGG T             GG              G                G/T
rs16812240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255319rRen1 : Intron2Mixed  -A---- - ?   ?   ?A ?-- ?       ?   ?-  ?  A A        -/A/C
rs16812239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255343rRen1 : Intron2SNPG AGAAAA A GG G        AAG           A A         G    G A/G
rs3166242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255426rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T    C  T  T          C/T
rs16812237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255430rRen1 : Intron1Mixed  ACAAAA A C        - CAA C       C    A  A    -        -/A/C
rs16812236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255446rRen1 : Intron1SNP  C CCCC T C   C   CC CCC C       C   CC  C             C/T
rs16812231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255449rRen1 : Intron5Mixed  -G---- - G   G   GG G-- G       G   G-  G  G G        -/A/C/G
rs16812230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255593rRen1 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCC A C   C   CC CCC C       C   CC  C  C          A/C
rs16812124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255678fRen1 : Intron1SNP  AGAA A A G   G   GG GAA         G   G   G             A/G
rs16812125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255693fRen1 : Intron1SNP  GAGGGG A A   G   GG GGG         G   G   G    G        A/G
rs16812126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255715fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC         T   T   T  T T        C/T
rs16812127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255716fRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG         A   A   A  A A        A/G
rs16812128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255719fRen1 : Intron1SNP  TATTTT T A   A   AA ATT A       A   A   A  A A        A/T
rs16812129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255722fRen1 : Intron1SNP  ACAAAA A C   C   CC CAA C       C   C   C  C C        A/C
rs16812130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255732fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   C   C  C C        C/T
rs16812131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255734fRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A   AA AGG A       A   A   A  A A        A/G
rs3164451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255735fRen1 : Intron1SNP  CTC C  C T TT                      C                T C/T
rs16812132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255735fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   T   T  T T        C/T
rs16812133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255736fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   T   T  T T        C/T
rs16812134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255748fRen1 : Intron1SNP  GTGGGG G T   T   TT TGG T       T   T   T    T        G/T
rs16812135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255750fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   G   G  G G        A/G
rs16812136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255809fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CC  C  C C        C/T
rs16812137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255822fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GG  G  G G        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16812138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255834fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT C C   C   CC CTT C       C   CC  C  C C        C/T
rs16812139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255871fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GG  G  G G        A/G
rs16812140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255875fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   CC  C  C C        C/T
rs16812141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255878fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TT  T  T T        C/T
rs16812142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255921fRen1 : Coding-NonSynonymous1SNP  AGAAAA A G   G   GG GAA G       G   GG  G  G G        A/G
rs16812143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255952fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  TCTTTT T C   C   C  CTT C       C   C   C  C C        C/T
rs16812144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255958fRen1 : Coding-Synonymous1SNP  TCTTTT T C   C   C  CTT C       C   C   C  C C        C/T
rs16812145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135255959fRen1 : Coding-NonSynonymous1SNP  GAGGGG G A   A   A  AGG A       A   A   A  A A        A/G
rs16812146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -C---- - C   C   CC C-- C       C   CC  C  C C        -/C
rs16812147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -A---- - A   A   AA A-- A       A   AA  A  A A        -/A
rs16812148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G-- - - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -C---- - C   C   CC C-- C       C   CC  C  C C        -/C
rs16812152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -C---- - C   C   CC C-- C       C   C   C  C C        -/C
rs16812153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -T---- - T   T   TT T-- T       T   TT  T  T T        -/T
rs16812154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -A---- - A   A   AA A-- A       A   A   A  A A        -/A
rs16812160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -C---- - C   C   CC C-- C       C   C   C  C C        -/C
rs16812161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -A---- - A   A   AA A-- A       A   A   A  A A        -/A
rs16812162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16812163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256029fRen1 : Intron1IN-DEL  -G---- - G   G   GG G-- G       G   GG  G  G G        -/G
rs16812164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256045fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC CTT C       C   C   C  C C        C/T
rs33553114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256079fRen1 : Intron1SNP  GAG G  G A AA                      G           A    A A/G
rs16812165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256110fRen1 : Intron1SNP  GGGGGG G G   G   GG GGG G       G   GG  G  T G        G/T
rs16812166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256118fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   G  GAA G       G   GG  G  G G        A/G
rs16812167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256139fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC  TT C       C   CC  C  C C        C/T
rs16812168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256142fRen1 : Intron1SNP  TCTTTT T C   C   CC  TT C       C   C   C  C C        C/T
rs16812169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256184fRen1 : Intron1SNP  AGAAAA A G   G   G   AA G       G   G   G  G G        A/G
rs16812170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256187fRen1 : Intron1SNP  TGTTTT T G   G   GG GT  G       G   G   G  G G        G/T
rs16812171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256199fRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T       CC T       T   T   T    T        C/T
rs16812172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256201fRen1 : Intron1SNP  T TT T T     C       T  C           C   C             C/T
rs16812174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256279rRen1 : Intron1SNP  GAGGGG G A   A      AGG A            G  A    A        A/G
rs3164276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256302rRen1 : Intron1SNP  CTCCCC C T   T   TT TCC T       T   TC  T  T T        C/T
rs16812173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256537rRen1 : Intron1SNP  GGGGGG A G   G   GG GGG G       G   GG  G  G G        A/G
rs3164528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256584fRen1 : Coding-NonSynonymous1SNP  CGCCCC C G       GG GCC G           GC  G  G          C/G
rs3022833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256759fRen1 : mRNA-UTR2SNPCCGCGGGGGCCCCCCCCCCCCCCGG CCGGGGCCCCCGCGCCCCGCCCC CGCCCCC/G
rs33552152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256874fRen1 : mRNA-UTR1SNPC TCT T  T   C                       T           C    C C/T
rs33552150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256956fRen1 : Locus-Region1SNP  AGA A  G   GG                      A                G A/G
rs33552148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:135256972fRen1 : Locus-Region1SNP  TCT T  T                           T                  C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory