About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Ptgs2
prostaglandin-endoperoxide synthase 2
MGI:97798

105 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33663910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098371fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPG GGG G AGGGG    GG   GGGA/G
rs33663909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098435fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
2SNPA AAA A AAAGAG   GAA  AGAA/G
rs33663908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098483fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPG GGG G AGGGG    GG   GGGA/G
rs33663907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098535fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPG GGG G AGGGG    GG   GGGA/G
rs219590112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098559fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNP             T     A     A/T
rs33663906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098656fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
2SNPG GGG G GGGAGA   AGG  GGGA/G
rs33663905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098657fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPG GGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs259257762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098851fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNP             T     G     G/T
rs32793596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098873fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
4SNPAACAA CACCACAC   CCC  ACAA/C
rs33663904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098958fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPT TTT T GTTTT    TT   TTTG/T
rs32230433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150098974fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
4SNPGGTGG TGTTGTGT   TTT  GTGG/T
rs31620789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099028fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
4SNPCCTCC TCTTCTCT   TTT  CTCC/T
rs33663013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099041fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPC CCC C TCCCC    CC   CCCC/T
rs33663012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099047fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPA AAA A  AAAA    AA   ACAA/C
rs33663011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099091fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
2SNPC CCC C CCCTCT   TCC  CCCC/T
rs33663010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099269fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
1SNPT TTT T TTTTT    TT   TGTG/T
rs33663009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099406fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
2SNPT TTT T CTTCTC   CTT  TCTC/T
rs33663008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099450fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Noncoding-Transcript-Variant
1SNPT TTT T CCTTT    TT   TTTC/T
rs214651655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099528fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP             T     C     C/T
rs224889773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099535fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Noncoding-Transcript-Variant
1SNP             C     T     C/T
rs245709335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150099982fPtgs2 : Locus-Region
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             A     G     A/G
rs33663007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100157fPtgs2 : mRNA-UTR
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
2SNPG GGG G AGGAGA   AGG  GGGA/G
rs234996521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100159fPtgs2 : mRNA-UTR
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             T     A     A/T
rs263686709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100196fPtgs2 : mRNA-UTR
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             C     T     C/T
rs30469796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100303fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
3SNP AG    A G   A     G     A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs236069039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100340fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             A     C     A/C
rs33663006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100440fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNPC CCC C CCCCC    CC   CTCC/T
rs257797009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100643fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             A     T     A/T
rs33663005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100645fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
2SNPT TTT T ATTATA   ATT  TTTA/T
rs33663004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100718fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
2SNPA AAA A AAATAT   TAA  AAAA/T
rs33662213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100780fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
2SNPA AAA A AAAGAG   GAA  AAAA/G
rs33662212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150100807fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNPG GGG G AGGGG    GG   GGGA/G
rs223600471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101385fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             T     C     C/T
rs247706928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101386fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
1SNP             G     A     A/G
rs32559831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101501fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
4SNPA TAA TAATAAAA   ATT  AAAA/T
rs30798100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101522fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
4SNPC GCC GCGGCGCG   GGG  CGCC/G
rs33662211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101553fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
2SNPG GGG G  GGCGC   CGG  GGGC/G
rs33662210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101693fPtgs2 : Intron
Ptgs2os : Intron
Ptgs2os : Locus-Region
2SNPG GGG G GGGAGA   AGG  GGGA/G
rs33662209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150101835fPtgs2 : Intron1SNPT TTT T CTTTT    TT   TCTC/T
rs50060890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102058fPtgs2 : Coding-Synonymous1SNP TC      C               C/T
rs33662208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102097fPtgs2 : Coding-Synonymous2SNPC CCC C CCCACA   ACC  CCCA/C
rs33662207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102301fPtgs2 : Intron1SNPG GGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs33662206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102492fPtgs2 : Intron2SNPG GGG G AGGAGA   AGG  GAGA/G
rs33662205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102581fPtgs2 : Intron1SNPA AAA A AAA A     A   AGAA/G
rs33662204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102585fPtgs2 : Intron2SNPA AAA A TAATAT   TAA  A AA/T
rs229027859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102586fPtgs2 : Intron1SNP             T     C     C/T
rs32774401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102897fPtgs2 : Intron4SNPAAGAA GAGGAGAG   GGG  AGAA/G
rs33668980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150102950fPtgs2 : Intron2SNPC CCC C ACCACA    CC  CACA/C
rs31523808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150103203fPtgs2 : Intron4SNPT GTT GTGGTGTG   GGG  T TG/T
rs33668979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150103240fPtgs2 : Intron2SNPG GGG G GGGAGA   AGG  GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33668978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150103300fPtgs2 : Intron1SNPA AAA A AAAAA    AA   AGAA/G
rs33668977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150103355fPtgs2 : Intron1SNPC CCC C CCCCC    CC   CTCC/T
rs213602173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150103832fPtgs2 : Intron1SNP             C     T     C/T
rs33668976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104183fPtgs2 : Intron1SNPA AA  A TAATA    TA   AA A/T
rs33668975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104220fPtgs2 : Intron1SNPG GGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs8238843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104241fPtgs2 : Intron4SNPCCTC CTCTT   T CC  TT    C/T
rs8238844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104242fPtgs2 : Intron5SNPAAGAAAGAGGAGAG AAGGGG AGAA/G
rs33668974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104296fPtgs2 : Coding-Synonymous1SNPG GGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs33667753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104305fPtgs2 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C TCCCC    CC   CCCC/T
rs8238845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104496fPtgs2 : Coding-NonSynonymous1SNP  T  A AA                A/T
rs33667752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104579fPtgs2 : Intron1SNPG GGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs33667751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104666fPtgs2 : Intron1SNPG GGG G GGGGG    GG   GAGA/G
rs8238847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104831rPtgs2 : Intron5SNPAACAAACAACAAAA A ACCCAAAAA/C
rs8238846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150104895rPtgs2 : Intron4SNPA AAAAA GAAGAG A GAAAGAAAA/G
rs8238854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105193rPtgs2 : Intron5Mixed  GG GGG-G     GG   G    -/A/G
rs8238853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105248rPtgs2 : Intron2SNPG GGGGGGAGGGG  GGGG G GGGA/G
rs8238852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105260rPtgs2 : Intron1SNP  TT TTTCT     TT   T    C/T
rs8238851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105261rPtgs2 : Intron1SNP  CC CCCTC     CC   C    C/T
rs33667750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105265fPtgs2 : Intron1SNPG GGG G  GGAG    AG   GGGA/G
rs8238850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105267rPtgs2 : Intron1IN-DEL  -- ---A-     --   -    -/A
rs8238849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105286rPtgs2 : Intron2SNP  CC CCCTC   T CC  CC    C/T
rs220345470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105290fPtgs2 : Intron1SNP             A     G     A/G
rs8238848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105305rPtgs2 : Intron1SNP  TT T TCT     TT   T    C/T
rs244437042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105325fPtgs2 : Intron1SNP             T     C     C/T
rs33667749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105327fPtgs2 : Intron2SNPG GGG G  GGAGA   AGG  GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33667748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105360fPtgs2 : Intron2SNPT TTT T CTTCTC   CTT  TTTC/T
rs8238859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105395fPtgs2 : Coding-Synonymous3SNPA AAAAA GAAGAG AAGAA  AAAA/G
rs8238860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105485fPtgs2 : Coding-Synonymous3SNPG GGGGG AGGAGA GGAGG  GGGA/G
rs233518836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105581fPtgs2 : Coding-Synonymous1SNP             T     C     C/T
rs8238861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105796fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP   A A AAA    GA    A    A/G
rs33667747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150105851fPtgs2 : mRNA-UTR2SNPT TTT T TTTGTG    TT  TTTG/T
rs33667746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106094fPtgs2 : mRNA-UTR2SNPT TTT T TTTCTC   CTT  TTTC/T
rs8238862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106138fPtgs2 : mRNA-UTR3SNPC CCCCC TCCTCT   TCCC CTCC/T
rs33667745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106407fPtgs2 : mRNA-UTR3SNPGGGGG G GGGAGA   AGG AGGGA/G
rs33667744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106467fPtgs2 : mRNA-UTR1SNPG GGG G GGGGG    GT   GGGG/T
rs8238863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106592rPtgs2 : mRNA-UTR1SNP  AA  AACA          A    A/C
rs33666513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106603fPtgs2 : mRNA-UTR1SNPT TTT T TTTTT    TT   TCTC/T
rs8238864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106940fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP  TT TTTTT    CTT   T    C/T
rs8238865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106986fPtgs2 : mRNA-UTR2SNP  CC CCCCC   TTCC  CC    C/T
rs8238866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150106994fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP  GG GGGG     AGG   G    A/G
rs8238867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107016fPtgs2 : mRNA-UTR1IN-DEL  -- -----    C--   -    -/C
rs8238868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107032fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP  GG GGGG     AGG   G    A/G
rs8238869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107087fPtgs2 : mRNA-UTR1IN-DEL  -- ---A-    ---   -    -/A
rs8238870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107123fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP  CC CCCCC    TCC   C    C/T
rs33666512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107283fPtgs2 : mRNA-UTR2SNP  AAA A GAAGAG   GAA  AGAA/G
rs246403191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107511fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP             A     G     A/G
rs217403936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107573fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP             A     G     A/G
rs239537691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150107616fPtgs2 : mRNA-UTR1SNP             A     T     A/T
rs261623230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150108251fPtgs2 : Locus-Region1SNP             A     G     A/G
rs220625166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150108258fPtgs2 : Locus-Region1SNP             A     T     A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs239240778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150108316fPtgs2 : Locus-Region1SNP             A     G     A/G
rs249977219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150108379fPtgs2 : Locus-Region1SNP             T     A     A/T
rs221591669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150108386fPtgs2 : Locus-Region1SNP             C     T     C/T
rs239512405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150108526fPtgs2 : 516 bp downstream of1SNP             G     A     A/G
rs51252793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:150109425fPtgs2 : 1415 bp downstream of2SNP CT          C     T     C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory