About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Plau
plasminogen activator, urokinase
MGI:97611

48 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30693177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654277fPlau : Locus-Region1SNPT TTC T  TTCT         T   T     CCC/T
rs30693176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654349fPlau : Locus-Region1SNPG GGA G  GGAG         G   G      AA/G
rs30693175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654460fPlau : Locus-Region1SNPG GGA G  GGGG         G   G     GAA/G
rs30693174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654649fPlau : Locus-Region1SNPT TTC T  TTTT         T   T    TTCC/T
rs31159718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654754fPlau : Locus-Region1SNPTCC    C T                        C/T
rs30692273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654899fPlau : Locus-Region1SNPG GGG G  GGAG         G   G     AGA/G
rs30692272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21654963fPlau : Locus-Region1SNPG GGA G  GGGG         G   G     GAA/G
rs16797377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21655259fPlau : Locus-Region1SNP   TTTT CT   TTTT T T      TTTT   C/T
rs30692271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21655411fPlau : Locus-Region1SNPG GGA G  GGGG         G   G    GGAA/G
rs30692270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21655552fPlau : Locus-Region1SNPC CCT C  CCCC         C   C     CTC/T
rs30692269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21655912fPlau : Locus-Region1SNPT TTA T TTTTT         T   T     TAA/T
rs30692268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21655985fPlau : Intron1SNPA AAG A  AA A         A   A    AGGA/G
rs30692267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21656503fPlau : Intron1SNPC CCT C  CCCC         C   C     CTC/T
rs30692266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21656608fPlau : Intron1SNPG GGA G  GGGG         G   G     GAA/G
rs16802796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21656614fPlau : Intron1SNP     G       GGA    G      G  G   A/G
rs30692265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21656637fPlau : Intron1SNPT TTG T  TTTT         T   T     TGG/T
rs16797372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21657597fPlau : Intron2SNPT TTCCT  TTCTTT T T T T   TTTTT CCC/T
rs16797373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21657692fPlau : Intron1SNP   G TG G    GGGG   G      GGGG   G/T
rs16797374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21657694fPlau : Intron1SNP   C AC C    CCCC   C      CCCC   A/C
rs30692264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21657757fPlau : Coding-NonSynonymous1SNPT TTT T TTTA          T   T    TTTA/T
rs30691103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21658239fPlau : Intron1SNPC CCT C  CCTC         C   C     TTC/T
rs30691102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21658261fPlau : Intron1SNPA AAG A  AAAA         A   A    AAGA/G
rs16802797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21658282fPlau : Intron1SNP   CCCC CC   CCGC C C      CCCC   C/G
rs16797375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21658506fPlau : Intron1IN-DEL   T-TT TT   TT-T T T      TTTT   -/T
rs16797376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21658756fPlau : Coding-Synonymous1SNP   CCCC CC   CCTC C C      CCCC   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16797381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21658994fPlau : Intron2SNPC CCTTC CCCCCCCCC C C C   CCCCC CTC/T
rs30691101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659166fPlau : Intron1SNPC CCT C  CCCC         C   C    CCTC/T
rs30691100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659232fPlau : Intron1SNPT TTC T  TTCT         T   T    TCCC/T
rs30691099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659314fPlau : Intron1SNPA AAC A  AA A         A   A      CA/C
rs16797382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659427fPlau : Intron2SNPT TTGGT TTT TTTTT T T T   TTTTTTTGG/T
rs16797383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659502fPlau : Intron2SNPG GGAAG GGGGGGGG    G G   GGG GGGAA/G
rs30691098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659745fPlau : Coding-Synonymous1SNPG GGA G  GGGG         G   G     GAA/G
rs30691097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21659916fPlau : Intron1SNPT TTC T  TTCT         T   T      CC/T
rs16802798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21660015fPlau : Intron1SNP   GGGG G    GGTG G G      GGGG   G/T
rs30691096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21660157fPlau : Intron1SNPC CCG C  CCGC         C   C      GC/G
rs30691095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21660390fPlau : Intron1SNPG GGG G  GGCG         G   G    GGGC/G
rs16797378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21660585fPlau : Intron1Mixed   TTT  G    TTT    T      TT-T   -/G/T
rs16797379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21660589fPlau : Intron1Mixed   ATTA -    AA A A A      AAAA   -/A/T
rs16797380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21660607fPlau : Intron1Mixed   AAAA -A   AAGA A A      AAAA   -/A/G
rs30691094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21661410fPlau : Intron1SNPG GGA G  GGGG         G   G     GAA/G
rs3091048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21661996fPlau : mRNA-UTR2SNPT TTT T GTTGT    T T TTTTTT     GTG/T
rs33902232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21662481fPlau : mRNA-UTR1SNPA AAA A TAATA         A   A    ATAA/T
rs30690223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21662718fPlau : Locus-Region1SNPT TTC T CTTCT         T   T    TCCC/T
rs30690222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21662762fPlau : Locus-Region1SNPC CCC C CCCAC         C   C    CCCA/C
rs30690221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21662931fPlau : Locus-Region1SNPC CCT C CCCCC         C   C    CCTC/T
rs30690220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21662945fPlau : Locus-Region1SNPC CCC C GCCCC         C   C    CCCC/G
rs30690219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21663021fPlau : Locus-Region1SNPC CCC C CCCTC         C   C    CTCC/T
rs30690218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:21663045fPlau : Locus-Region1SNPA AAA A GAAAA         A   A    AAAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory