About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Cd200
CD200 antigen
MGI:1196990

255 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32755732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45380416fCd200 : Locus-Region1SNPT     C C C CT     TT  TC C/T
rs4181015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45380574fCd200 : Locus-Region3SNPA A   CCC A CA     AA  AC A/C
rs32756335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45381543fCd200 : Locus-Region1SNPC     T T   T      CC  CT C/T
rs32756337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45382068fCd200 : Locus-Region1SNPA     T T   T      AA  AT A/T
rs32756339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45382214fCd200 : Locus-Region1SNPT     C C C C      TT  TC C/T
rs32756341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45382693fCd200 : mRNA-UTR1SNPG     A   A A      G   G  A/G
rs32756343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45383243fCd200 : mRNA-UTR1SNPG     A A A A      G   G  A/G
rs32756895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45383446fCd200 : mRNA-UTR1SNPC     T T   T      C   CT C/T
rs32756896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45383563fCd200 : mRNA-UTR1SNPC     T     T      CC  C  C/T
rs32756897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45383659fCd200 : Intron1SNPC     T     T      CC  C  C/T
rs4181016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45383836fCd200 : Intron2SNP AG    G                  A/G
rs4181017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45386494fCd200 : Intron3SNPT T   CC  T C          T  C/T
rs4181018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45386614fCd200 : Intron3SNPT C   CCC C C      TT  TC C/T
rs4181019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45386615fCd200 : Intron2SNPG A    G  A               A/G
rs4181020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45387015fCd200 : Intron3SNPGGG   AAG G        GG  GA A/G
rs4181021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45387162fCd200 : Intron3SNPAAG   GGG G G      A   AG A/G
rs32756903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45387200fCd200 : Intron1SNPT     G   G G      TT  TG G/T
rs6406040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45388208fCd200 : Intron2SNPC C C CC TC CC     CC  CTCC/T
rs4181022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45388258fCd200 : Intron3SNPT TTT CC  T C      TT  TCTC/T
rs32757907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45388355fCd200 : Intron1SNPT AAA A A A AT     TT  TAAA/T
rs4181023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45389361fCd200 : Intron2SNP  T    C  T               C/T
rs4181024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45389415fCd200 : Intron3SNPA AAA GG  A GA     AA  AGAA/G
rs32757910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45389454fCd200 : Intron1SNPT CCC C C C CT     TT  TCCC/T
rs4181025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45389553fCd200 : Intron3SNP  AAA GG  A G           G A/G
rs4181026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45389560fCd200 : Intron3SNPA AA  GG  A GA     AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32751867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45389671fCd200 : Intron1SNPA AAA G   A GA     AA  AGAA/G
rs32751869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45390035fCd200 : Intron1SNPA AAA T   AATA     AA  ATAA/T
rs32751871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45390384fCd200 : Intron1SNPG GG  A   G A          GA A/G
rs4181027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45390387fCd200 : Intron3SNP GG G TT  G T      GG   T G/T
rs4181028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45390501fCd200 : Intron3SNPGGGGG AA  G A      GG  GA A/G
rs32752915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45390941fCd200 : Intron1SNPC CCC C C CCCC     TC  CCCC/T
rs4181029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391040fCd200 : Intron3SNPCCCCC GG  C GC     CC  CGCC/G
rs32752918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391173fCd200 : Intron1SNPC CCC A C C AC     CC  CCCA/C
rs8249737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391311fCd200 : Intron1SNP  TTTTTTG T   T TTT  TT   G/T
rs8249738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391312fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAG A   A AAA  AA   A/G
rs8249739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391383fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGA G   G GGG  GG   A/G
rs8249740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391401fCd200 : Intron3SNPGGTTTTTTT T T G GTTGGTGGTGG/T
rs8249741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391421fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAG A   A AAA  AA   A/G
rs8249742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391442fCd200 : Intron1SNP  TTTTTTC T   T TTT  TT   C/T
rs4181030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391445fCd200 : Intron4SNPCCTCTTCCC T CCC CTCCCTCCCCC/T
rs4181031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391587fCd200 : Intron2SNPC T    T  T               C/T
rs8249749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391651fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAA A   AGAAA  AA   A/G
rs4181032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391746fCd200 : Intron4SNPT TTTTGGT T GTT TTGTTTTTT G/T
rs8249750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391831fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGA G   GGGGG  GG   A/G
rs8249736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45391922rCd200 : Intron1SNP  TTTTTTC T   T TTT  TT   C/T
rs4181033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392176fCd200 : Intron4SNPAAAAAACC  A C A AACAAAAAC A/C
rs4181034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392264fCd200 : Intron3SNPGGGGG CC  G C      GG  GC C/G
rs4181035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392300fCd200 : Intron2SNP C     C  T               C/T
rs4181036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392301fCd200 : Intron2SNP C     C  A               A/C
rs4181037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392445fCd200 : Coding-NonSynonymous3SNPCCCCC TTC C TC     CC  CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8249744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392627fCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC C   CTCCC  CC   C/T
rs8249745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392669fCd200 : Intron1SNP  TCTTTTT T   TTTTT  TT   C/T
rs8249746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392721fCd200 : Intron1SNP  TTTTTTT T   TCTTT  TT   C/T
rs8249747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392780fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAA A   AGAAA  AA   A/G
rs4181038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392781fCd200 : Intron4SNPC CCCCAA? C A CCCCACCCCCACA/C
rs8249748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392811fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAA A   AGAAA  AA   A/G
rs4181039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392913fCd200 : Intron3SNPG AGA GGG A GG     GG  GGGA/G
rs4181040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45392933fCd200 : Intron3SNPT GGG TT  G TT     TT  TTTG/T
rs32753989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393054fCd200 : Intron1SNPG GGG G G G GG     GG  GAGA/G
rs8249729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393240fCd200 : Intron5Mixed  ----TTT -   T T-T  -    -/A/C/G/T
rs8249734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393325fCd200 : Intron2SNPG GGGGAA? G AGG G AGGG GAGA/G
rs8236428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393487fCd200 : Intron4SNPA AAAACCC A CAA AACAAAAACAA/C
rs8237566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393540fCd200 : Intron2SNP  TTTTTTC T   T TTT  TT   C/T
rs8249743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393720fCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC C   A ACC  CA   A/C
rs32753993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45393969fCd200 : Intron1SNPT CCC C   C C      TT  TCCC/T
rs32755184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394279fCd200 : Intron1SNPC T T C   T CC     CC  CCTC/T
rs6155279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394411fCd200 : Intron2SNPG     AA  G A      GG  GA A/G
rs32755186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394423fCd200 : Intron1SNPA G G A   G A          AA A/G
rs6155317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394433fCd200 : Intron1SNPA      G                  A/G
rs8251620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394578rCd200 : Intron1SNP  CCCCAAA C   ACAC   CA   A/C
rs8251619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394583rCd200 : Intron1IN-DEL  AAAAAA- A   AAAA   AA   -/A
rs8259497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394584fCd200 : Intron1IN-DEL  TT TTT- T   TTTTT  TT   -/T
rs8251618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394606rCd200 : Intron2SNPA AAAAGGG A GAAAAA AAAAAG A/G
rs8259498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394621fCd200 : Intron1SNP  TTTTAAA T   AAATA  TA   A/T
rs8237567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394640rCd200 : Intron2SNP  GGGGAAA G   AGAGA  GA   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32755188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394648fCd200 : Intron1SNPG     G   GGAG     GG  GG A/G
rs8237568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394650rCd200 : Intron3SNPG AAAAGGG AGGGGGGAGGGAGGG A/G
rs8251617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394681rCd200 : Intron2SNPG CCC GGG CGGGGCGC GGCGGGCC/G
rs8251616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394739rCd200 : Coding-NonSynonymous1IN-DEL  AAA -AA     AAAA   AA   -/A
rs8259499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394851fCd200 : Coding-Synonymous1SNP  GG GGGG G   GAGG   GG   A/G
rs8249726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394914fCd200 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCCT C   CCCCC  CC   C/T
rs8249727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394950fCd200 : Coding-Synonymous1SNP  GGGGGGG G   GAGGG  GG   A/G
rs8249728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45394959fCd200 : Coding-Synonymous1SNP  AAAAAAA A   ATAAA  AA   A/T
rs32755191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395011fCd200 : Intron1SNPG GGG G   G GG     GG  GGAA/G
rs32755193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395079fCd200 : Intron1SNPA AAA A   AAAA     AA  AGAA/G
rs4181041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395280fCd200 : Intron3SNPC AAA CCC ACCC     CC  CCCA/C
rs4181042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395367fCd200 : Intron4SNPCCGGGGCCC G CCC CG CCG CCGC/G
rs8249724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395469fCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC     CT CC  CC   C/T
rs8249725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395571fCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC     CA CC  CC   A/C
rs4181043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395632fCd200 : Intron4SNPGGGGGGAAG G A GG GAGGGGGAGA/G
rs4181044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395677fCd200 : Intron4SNPTTTTTTAAA T A TT TAT TTTA A/T
rs8249757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395959fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG G   GAGGG  GG   A/G
rs4181045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45395996fCd200 : Intron3SNP GTTTTGGG T   GGGTG  TG   G/T
rs8249758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396009fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAG A   AAAAA  AA   A/G
rs8249759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396037fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG G   GTGGG  GG   G/T
rs4181046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396040fCd200 : Intron4SNPTTAAAAAAA A ATTATAATTATTAAA/T
rs4181047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396090fCd200 : Intron2SNP G     A                  A/G
rs8249714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396481fCd200 : Intron2SNPC AAAAAAA A A C CAACCACCAAA/C
rs8249715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396528fCd200 : Intron2SNPC TTTTCCC T CCC CTCCCTCCCTC/T
rs8249716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396596fCd200 : Intron2SNPC TTTTCC? TCCCC CTCCCTCCCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32756280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396638fCd200 : Intron1SNPC CCC C   C TC     CC  CCCC/T
rs8249717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396645fCd200 : Intron5Mixed  CCCC--- C   - -C-  C-   -/C/T
rs8249722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396679fCd200 : Intron2SNPG AAAAGGG AGGGG GAGGGAGGGAA/G
rs8249723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396704fCd200 : Intron2SNPA CCCCCCC C CAA ACCAACAACCA/C
rs32757694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396737fCd200 : Intron1SNPG GGG A   G AG     GG  GA A/G
rs32757696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396753fCd200 : Intron1SNPC TTT C   T CC     CC  CCTC/T
rs32757698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396776fCd200 : Intron1SNPA GGG G G G GA     AA  AGGA/G
rs8249707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396820fCd200 : Intron1SNP  TTTTTTT T   TCT T  TT   C/T
rs32757700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396823fCd200 : Intron1SNPC GGG G G G G      CC  CGGC/G
rs32757702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396840fCd200 : Intron1SNPT CCC C   C C      T   TCCC/T
rs32758424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396844fCd200 : Intron1SNPA GGG A G G A      AA  AAGA/G
rs8249708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396873fCd200 : Intron1SNP  TTTTCCC T   CTCTC  TC   C/T
rs32758426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396874fCd200 : Intron1SNPG     A   A AG     GG  GA A/G
rs32755934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396885fCd200 : Intron1SNPA     A   C A      AA  AA A/C
rs32755936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396897fCd200 : Intron1SNPC     C   A CC     CC  CC A/C
rs8249709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396910fCd200 : Intron1SNP  TTTTTTT T   TCTTT  TT   C/T
rs8249710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396944fCd200 : Intron1IN-DEL   ---AAA -   A-A-A  -A   -/A
rs8249711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396945fCd200 : Intron1IN-DEL  ----CCC -   C-C-C  -C   -/C
rs8249712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396977fCd200 : Intron1SNP  AAAAGGG A   GAGAG  AG   A/G
rs8249713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45396980fCd200 : Intron1SNP  GGGGAAA G   AGAGA  GA   A/G
rs13467594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397152rCd200 : Coding-Synonymous1SNPC TTT C   T CC     CC  CCTC/T
rs32755938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397341fCd200 : Coding-Synonymous1SNPT C C T   C T      TT  TT C/T
rs33857537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397508fCd200 : Intron1SNPG     G   A GG     GG  GG A/G
rs8251626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397551fCd200 : Intron1IN-DEL  A -AAAA     A AAA  -A   -/A
rs8251627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397554fCd200 : Intron1IN-DEL  --A-AAA A   A A-A  AA   -/A
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8251628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397555fCd200 : Intron1IN-DEL  ----AAA -   A-A-A  -A   -/A
rs8251629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397639fCd200 : Intron1SNP  GA           A          A/G
rs32755940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397806fCd200 : Intron1SNPC TTT C T T CC     CC  CCTC/T
rs8251615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397835rCd200 : Intron2SNPT CCCCCCC C CTTCTCCTTC TCCC/T
rs32755942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397835fCd200 : Intron1SNPG TTT G T T GG     GG  GGTG/T
rs8251614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397913rCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG G   GA GG  G    A/G
rs32756905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45397969fCd200 : Intron1SNPG AAA A   A AG     GG  GAAA/G
rs32756907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398020fCd200 : Intron1SNPA GGG A G G AA     AA  AAGA/G
rs32756909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398105fCd200 : Intron1SNPT CCC C C C CT     TT  TCCC/T
rs32756911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398155fCd200 : Intron1SNPC GGG C   GCCC     CC  CCGC/G
rs32756913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398183fCd200 : Intron1SNPG AAA G   AGGG     GG  GGAA/G
rs32757755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398228fCd200 : Intron1SNPC     T   C TC     CC  CCCC/T
rs32757757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398251fCd200 : Intron1SNPT     T   CTTT     TT  TT C/T
rs32757759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398311fCd200 : Intron1SNPT AAA A A A AT     TT  TAAA/T
rs32757761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398328fCd200 : Intron1SNPC CCC A C CCAC     CC  CACA/C
rs32757763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398489fCd200 : Intron1SNPC CCC C C CCCC     CC  CTCC/T
rs32758545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398526fCd200 : Intron1SNPC CCC T C CCTC     CC  CTCC/T
rs32758547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398665fCd200 : Intron1SNPA GGG G   G G      AA  AGGA/G
rs32758548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398676fCd200 : Intron1SNPT TTT C   T C          TCTC/T
rs8249751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398722fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG     A A    GA   A/G
rs8249752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398735fCd200 : Intron1SNP  TTTTAAA T   A AT   TA   A/T
rs8249753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398797fCd200 : Intron1IN-DEL  GGGGGGG G   - -    G-   -/G
rs8249754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398797fCd200 : Intron1IN-DEL  AAAAAAA A   - -A   A-   -/A
rs8249755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398938fCd200 : Intron1SNP  TTTTAAA T   AAA    T    A/T
rs32758549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45398978fCd200 : Intron1SNPC TTT C   TCCC     CC  CCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32758550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399177fCd200 : Intron1SNPT C C   C CTTT     T   TTCC/T
rs32758551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399188fCd200 : Intron1SNPA AAA A C AAAA     AA  AAAA/C
rs32758552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399265fCd200 : Intron1SNPT CCC C C C CT     T   TCCC/T
rs32759684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399313fCd200 : Intron1SNPG AAA A A A A      G   GAAA/G
rs32759685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399328fCd200 : Intron1SNPA G G   A G A          AA A/G
rs32759686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399347fCd200 : Intron1SNPG       G A GG     G   GGAA/G
rs32759687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399413fCd200 : Intron1SNPG AAA G G A GG     GG  GG A/G
rs8251613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399449fCd200 : Intron2SNPT GGG   G G G T T  TT TTGGG/T
rs8249699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399654fCd200 : Intron1SNP  CCCC  C     CTCCC  CC   C/T
rs8249700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399655fCd200 : Intron1SNP  CCCC  C     CGCC   CC   C/G
rs8249701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399745fCd200 : Intron2SNPG TTTTGGG T GGGGGTGGGTGGGTG/T
rs8249702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399808fCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC C   CTCCC  CC   C/T
rs8249703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399869fCd200 : Intron1SNP  TTTTTTT T   TCTTT  TT   C/T
rs8249704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399929fCd200 : Intron2SNPC TTTTCCC TCCCCCCTCCCTCCC C/T
rs8249705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399939fCd200 : Intron1Mixed  ----TT- -   -C--T  --   -/C/T
rs8249706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399946fCd200 : Intron1SNP  CCCCTTC C   CCC T  CC   C/T
rs32759689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45399992fCd200 : Intron1SNPT TTT   C T CT     TT   CTC/T
rs32759691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400224fCd200 : Intron1SNPA GGG G G G GA     AA  AGGA/G
rs32759692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400322fCd200 : Intron1SNPA GGG   G G G      A   AGGA/G
rs8249696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400405fCd200 : Coding-Synonymous2SNPC TTTTTTT T TCC CTTCCTCCTTC/T
rs8259490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400454fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG G   GAGGG  GG   A/G
rs8249697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400587fCd200 : Intron2SNP  AAAATTT A TAA AAT  AA TAA/T
rs8259491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400593fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAA A   ACAAA  AA   A/C
rs8237569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400595fCd200 : Intron3SNPG GGGGGGA G G GGGGG  GGGGGA/G
rs8237570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400597fCd200 : Intron3SNPA GGGGGGG G G AGAGGAAGAAGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8259492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400627fCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC C   CACCC  CC   A/C
rs8259493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400635fCd200 : Intron2SNPA AAAAGGA A G AGAAGAAAAAGAA/G
rs8259494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400692fCd200 : Intron2SNPC TTTTTTT T T CCCTT  TCCTTC/T
rs8259495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400697fCd200 : Intron1SNP  AAAAAAA A   AGAAA  AA   A/G
rs8259496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400713fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG G   GAGGG  GG   A/G
rs32761399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400715fCd200 : Intron1SNPT TTT T T T TT     TT  TATA/T
rs32761401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400852fCd200 : Intron1SNPT TTT T C TTCT     TT  TC C/T
rs32761403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400966fCd200 : Intron1SNPC C C C T C CC     CC  CC C/T
rs32762465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45400968fCd200 : Intron1SNPC TTT T   T CC     CC  CCTC/T
rs32762467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401027fCd200 : Intron1SNPA AAA   C A CA     AA  ACAA/C
rs32762469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401130fCd200 : Intron1SNPT           A      T   TA A/T
rs8240613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401139rCd200 : Intron1SNP  T  T CC                 C/T
rs8240612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401154rCd200 : Intron2SNPG GGGG TG G T      GG  GTGG/T
rs8240611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401201rCd200 : Intron1SNP  T  T CC                 C/T
rs8240610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401312rCd200 : Intron1SNP  G  G GC                 C/G
rs8240609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401352rCd200 : Intron1SNP  C  C CT                 C/T
rs32762472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401380fCd200 : Intron1SNPC TTT   T T TC     CC  CTTC/T
rs32762473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401406fCd200 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GGAA/G
rs8249756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401607fCd200 : Intron1IN-DEL  CCCCCC-     C CCC  C    -/C
rs8237571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401787fCd200 : Intron3SNPT TTTTTTC TTTTTCTTTTTTTTCTC/T
rs8237572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401803fCd200 : Intron3SNPA AAAAGGG A GAAAAAGAAAAAGAA/G
rs8259489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401806rCd200 : Intron1SNP  CCCCCCC C   CTCCC   C   C/T
rs32756116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401841fCd200 : Intron1SNPG GGG G G G GG     GG  GCGC/G
rs4181048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401885fCd200 : Intron5SNPCCCCCCTTC C TCCCCCTC CCCCCC/T
rs8249686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401953fCd200 : Intron1SNP  GGGGGGG     GAGGG  G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4181049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45401975fCd200 : Intron4SNPCCCCCCTTC C TCCCCCTCCC CCCC/T
rs8237573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402096rCd200 : Intron3SNP AAAAAGGA A   AAAAG  A    A/G
rs8249687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402124fCd200 : Intron2SNPT CCCCCCC C C TCTCCT C TCCC/T
rs8249688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402128fCd200 : Intron1IN-DEL  ------- -   -G---  -    -/G
rs8249689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402137fCd200 : Intron2SNPA TTTTTTT T T AAATTA T ATTA/T
rs4181050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402151fCd200 : Intron4SNPTTGGGG TT G TT     TT  TTGG/T
rs8249690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402214fCd200 : Intron2SNPG AAAAAAA AGAGGAG AGGA GAAA/G
rs8240608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402281rCd200 : Intron1SNP  T  T TC                 C/T
rs8240607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402301rCd200 : Intron1SNP  T  T TC                 C/T
rs8240606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402308rCd200 : Intron1SNP  C  C CT                 C/T
rs8240605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402312rCd200 : Intron1SNP  A  A CA                 A/C
rs8240604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402345rCd200 : Intron1SNP  C  C A                  A/C
rs8240603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45402362rCd200 : Intron1SNP  A  A AG                 A/G
rs4181051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403012fCd200 : Intron3SNPC CCC  TC CCTC     CC  CCCC/T
rs4181052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403176fCd200 : Intron3SNPG GGG  TG G TG     GG  GGGG/T
rs32757485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403245fCd200 : Intron1SNPC CCC C T C CC     CC  CTCC/T
rs32757487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403296fCd200 : Intron1SNPA AAA A G AAAA     AA  AAAA/G
rs32757489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403420fCd200 : Intron1SNPA GGG   A G AA     AA  AAAA/G
rs32757491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403578fCd200 : Intron1SNPA TTT   T T T      A   ATTA/T
rs32757493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403600fCd200 : Intron1SNPC CCC   C C TC     CC  C CC/T
rs32758365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45403690fCd200 : Intron1SNPA AAA A T A TA     AA  ATAA/T
rs4181053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45404776fCd200 : Intron3SNPT TTT  AA T A      TT  TATA/T
rs32758368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45405048fCd200 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GAGA/G
rs32758370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45405161fCd200 : Intron1SNPT TTT C T T CT     T   TTTC/T
rs4181054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45405541fCd200 : Intron2SNP AA    G  A               A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4181055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45405858fCd200 : Intron2SNPTTT    C  T               C/T
rs4181056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406039fCd200 : Intron3SNPT TTT  CC T CT     TT  TCTC/T
rs4181057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406067fCd200 : Intron2SNPG G    A  G               A/G
rs4181058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406077fCd200 : Intron3SNPG G G  AG G A      G   GGGA/G
rs4181059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406269fCd200 : Intron3SNPGGGGG AAG G A      G   GGGA/G
rs32759515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406480fCd200 : Intron1SNPC CCC   T C CC     CC  CCCC/T
rs32759517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406774fCd200 : Intron1SNPC CCC C C C CC     CC  CTCC/T
rs4181060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45406994fCd200 : Intron3SNPAAGGG A A GAAA     AA  AAAA/G
rs32759520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407027fCd200 : Intron1SNPA AAA   G A AA     AA  AGAA/G
rs32759522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407080fCd200 : Intron1SNPG GGG G G G GG     GG  GGAA/G
rs4181061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407114fCd200 : Intron3SNPGGCCC CCC C CG     GC  GCCC/G
rs4181062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407136fCd200 : Intron2SNP GG    A  G               A/G
rs4181063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407320fCd200 : Intron2SNP GA    A  A               A/G
rs4181064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407339fCd200 : Intron2SNP CC    T  C               C/T
rs32760395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407594fCd200 : Intron1SNPG GGG   A G GG     GG  GGGA/G
rs32760396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407647fCd200 : Intron1SNPT TTT T C T TT     TT  TCTC/T
rs4181065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407697fCd200 : Intron2SNP TA       A               A/T
rs4181066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407697fCd200 : Intron2SNP TA       A               A/T
rs4181067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407697fCd200 : Intron2SNP TA       A               A/T
rs4181068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407697fCd200 : Intron2SNP TA       A               A/T
rs4181069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407697fCd200 : Intron2SNP TA       A               A/T
rs32760397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45407786fCd200 : Intron1SNPA AAA   G A G      AA  AGAA/G
rs32760398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45408065fCd200 : Intron1SNPA AA    A   C      AA  A AA/C
rs32760399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45408359fCd200 : Intron1SNPC CCC   C C TC     CC  CCCC/T
rs32760401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45408428fCd200 : Intron1SNPT TTT T T TTTT     TT  TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4181070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45408596fCd200 : Intron3SNPCCTTT  CC T CC     CC  CCCC/T
rs8250467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45408818fCd200 : Intron2SNPC CCCCCCT C CCC CCCCCCCCCCC/T
rs4181071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45409105fCd200 : mRNA-UTR2SNP CC    T  C               C/T
rs32761725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45409377fCd200 : Locus-Region1SNPA AAA A A AAAA     AA  AGAA/G
rs32761727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:45409462fCd200 : Locus-Region1SNPG G G A G G A      G   GAGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory