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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Mmp9 matrix metallopeptidase 9 MGI:97011 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs33244796 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772134 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29864218 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772321 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262084 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772695 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33589091 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772709 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262083 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772878 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262082 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772950 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262081 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164772962 | f | Mmp9 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | G | A | A | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262080 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164773194 | f | Mmp9 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | G | A | G | A | G | G | G | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29621976 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164773310 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262079 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164773374 | f | Mmp9 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | G | A | A | G | A | A | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33612705 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164773450 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262078 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164773700 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | A | C | A | C | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223657 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774010 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223658 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774097 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223659 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774250 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | T | G | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262077 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774634 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262076 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774686 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262075 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774894 | f | Mmp9 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | G | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262074 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164774939 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262073 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775038 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262072 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775136 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262071 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775200 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29502352 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775367 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262070 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775407 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | T | T | C | T | C | C | T | C | C | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262069 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775416 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | A | G | G | A | A | G | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs33419602 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775678 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | G | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29578459 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775688 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262068 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775725 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | C | T | C | T | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262067 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775738 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | T | C | T | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262066 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164775811 | f | Mmp9 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | A | A | G | A | A | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262065 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776023 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262064 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776241 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | T | T | T | A | T | T | T | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29624755 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776250 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29674488 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776268 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262063 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776402 | f | Mmp9 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262062 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776428 | f | Mmp9 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262061 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776589 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | G | G | A | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262060 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164776893 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262059 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164777036 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C | C | C | C | T | C | C | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262058 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164777129 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | T | T | A | T | T | A | T | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262057 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164777182 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C | C | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262056 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164777611 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | T | T | T | C | T | T | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262055 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164777624 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | A | C | A | A | A | A | C | A | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262054 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164777730 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262053 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778129 | f | Mmp9 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | C | C | G | C | G | C | G | G | C | G | G | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262052 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778308 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262051 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778327 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262050 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778451 | f | Mmp9 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262049 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778581 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262048 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778736 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs28262047 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778849 | f | Mmp9 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13475086 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164778875 | f | Mmp9 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6185704 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779025 | f | Mmp9 : Coding-Synonymous | 4 | SNP | C | C | T | C | T | T | C | C | T | C | T | T | T | C | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | C | C | C | T | C | T | T | C | T | T | C | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |
| rs6186671 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779160 | f | Mmp9 : Intron | 3 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6187226 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779239 | f | Mmp9 : Intron | 3 | SNP | T | T | G | T | G | G | T | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6200053 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779429 | f | Mmp9 : Intron | 3 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6200058 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779435 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | G | T | G | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29919640 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779483 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29555477 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779657 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | G | C | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262046 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779679 | f | Mmp9 : Intron | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | A | A | G | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33598886 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779723 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33533861 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164779829 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262045 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164780220 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262044 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164780238 | f | Mmp9 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs28262043 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164780345 | f | Mmp9 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | A | A | C | A | C | C | A | A | C | C | A | C | C | A | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33471938 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164780820 | f | Mmp9 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33760941 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164781392 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33319142 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:164781609 | f | Mmp9 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | G | A | G | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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