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Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Syngap1
synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat)
MGI:3039785

95 matching SNPs displayed
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Legend
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SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108655081
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1SNP           T  A   A/T
rs107703395
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1SNP           C  C   C
rs107735417
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1SNP           G  A   A/G
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1SNP           T  A   A/T
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1SNP           T  G   G/T
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1SNP           G  A   A/G
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  A   A/G
rs108683429
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  T   C/T
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1SNP           C  G   C/G
rs108385088
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1SNP           C  G   C/G
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1SNP           C  G   C/G
rs108085814
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1SNP           T  A   A/T
rs107617893
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rs108156084
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1SNP           T  G   G/T
rs107755643
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rs108254591
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  G   G
rs108112672
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1SNP           A  G   A/G
rs108892813
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  A   A/C
rs108600069
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  C   A/C
rs108910533
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1SNP           T  A   A/T
rs108566661
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs107859448
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rs108238206
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rs107809348
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  A   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108805549
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rs108814261
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  T   G/T
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1SNP           C  T   C/T
rs108275751
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Syngap1 : Intron
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rs107779854
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Mir3083 : Locus-Region
Syngap1 : Intron
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rs108644390
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs249007447
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Mir3083 : Locus-Region
Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs107634374
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Mir3083 : Locus-Region
Syngap1 : Intron
1SNP           G  A   A/G
rs108097168
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Hst4 : within coordinates of
Mir3083 : Locus-Region
Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs108668789
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Hst4 : within coordinates of
Mir3083 : Locus-Region
Syngap1 : Intron
1SNP           C  A   A/C
rs108348392
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  G   C/G
rs108859882
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  A   A/G
rs108648682
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  C   C/G
rs108186429
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  T   C/T
rs108732698
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  A   A/G
rs108079700
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  T   C/T
rs222540913
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Syngap1 : Coding-Synonymous
1SNP           C  T   C/T
rs108085909
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  C   A/C
rs47920571
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Syngap1 : Intron
2SNPC C CC CCTCCC TC  C/T
rs107963976
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  T   C/T
rs108510928
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  G   A/G
rs108668093
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1SNP           T  C   C/T
rs218279335
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  G   A/G
rs108023106
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs108773343
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  A   A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs107996041
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Syngap1 : Intron
1SNP           G  G   G
rs108220501
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  G   A/G
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1SNP           A  G   A/G
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1SNP           T  C   C/T
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Syngap1 : Coding-Synonymous
1SNP           C  T   C/T
rs107702743
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rs51497500
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rs107802148
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1SNP           C  T   C/T
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1SNP           G  G   G
rs253132833
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1SNP           G  A   A/G
rs48948185
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1SNPG G GGGGGAG GG GGGA/G
rs49567133
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Syngap1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGGGGGGG GG GGCC/G
rs46179311
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1SNPC CCCCCCCTC CC CCCC/T
rs49937823
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2SNPT TTTTGTTTTTTGGTTTG/T
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1SNPG GGGGGGGGG GG GAGA/G
rs51070643
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1SNPC CCCCCCCTC CC CCCC/T
rs108799090
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1SNP           C  T   C/T
rs262125105
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1SNP           G  A   A/G
rs47928794
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2SNPT TTTTCTTCTTTCCTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49129276
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1SNPT TTTTTTTCT TT TTTC/T
rs48459242
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1SNPC   CCCCCAC C  CACA/C
rs48283586
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2SNPA AAAAGAAGAGAGGAGGA/G
rs108702614
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  C   C
rs229191206
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1SNP           A  G   A/G
rs107731249
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1SNP           G  A   A/G
rs107771713
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs107688771
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  A   A
rs108888497
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  C   C
rs33439287
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Syngap1 : Intron
3SNP CC    C   C  C   C
rs108260130
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs108125260
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Syngap1 : Intron
1SNP           T  C   C/T
rs108371848
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1SNP           G  A   A/G
rs108835484
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Syngap1 : Intron
1SNP           C  T   C/T
rs107736511
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1SNP           G  G   G
rs108163857
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1SNP           T  C   C/T
rs108866023
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Syngap1 : Intron
1SNP           A  G   A/G
rs107768179
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hlb156 : within coordinates of
Hst4 : within coordinates of
Syngap1 : 184 bp downstream of
1SNP           A  G   A/G
rs225387466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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hlb156 : within coordinates of
Hst4 : within coordinates of
Syngap1 : 706 bp downstream of
Zbtb9 : Locus-Region
1SNP           A  G   A/G
rs245525941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:26972368fDel(17D17Jcs40-D17Mit198)7Jcs : within coordinates of
Del(17D17Jcs41-D17Jcs15)8Jcs : within coordinates of
hlb156 : within coordinates of
Hst4 : within coordinates of
Syngap1 : 1723 bp downstream of
Zbtb9 : Locus-Region
1SNP           C  T   C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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09/09/2014
MGI 5.19
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