About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Itga2b
integrin alpha 2b
MGI:96601

206 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29457292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102312815fItga2b : Locus-Region1SNP  G    A                                                A/G
rs16795739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102313825rItga2b : Locus-Region1SNP  TC  T   T C   T    CTTC            C    C             C/T
rs16795738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102313870rItga2b : Locus-Region1SNP  GG GGG  G G   G   GAGGG         A  G   AGA            A/G
rs16795737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102313871rItga2b : Locus-Region1SNP  AA AAA  A A   A   AGAAA         A  AA  AA             A/G
rs16795736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102313930rItga2b : Locus-Region2SNP AGA AAA  A A   A   AAAGA         A  AA  AAA  A         A/G
rs16795735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102313976rItga2b : Locus-Region1SNP  AA AA   A A   A   AGAAA         A  AA  AAA  A         A/G
rs16795734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314022rItga2b : Locus-Region1SNP  AAAAA   A A   A   AGAAA         A  AA  A A  A         A/G
rs16795733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314089rItga2b : Locus-Region1SNP  CC CC   C C   C   CTCCC         C  CC  CCC  C         C/T
rs16795728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314141rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  TTTTTT  T T   T   T-TTT T       T  TT  TTT  T         -/T
rs16795729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314141rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  TTTTTT  T T   T   T-TTT T       T  TT  TTT  T         -/T
rs16795730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314141rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  TTTTTT  T T   T   T-TTT T       T  TT  TTT  T         -/T
rs16795731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314141rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  TTTTTT  T T   T   T-TTT         T  TT  TTT  T         -/T
rs16795732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314141rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  GGGGGG  G G   G   G-GGG         G  GG  GG   G         -/G
rs16795727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314232rItga2b : Locus-Region1SNP  AAAAAA  A A   A   AGAAA A       A  AA  AAA  A         A/G
rs16795654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314468rItga2b : Locus-Region1SNP  TTTTTT  T T   T   TATTT T       T  TT  TTT  T T       A/T
rs16795653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314492rItga2b : Locus-Region1SNP  TTTTTT  T T   T   TGTTT T       T  TT  TTT  T T       G/T
rs16795652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314504rItga2b : Locus-Region1SNP  CCCCCC  C C   C    ACCC C       C  CC   C   C C       A/C
rs16795651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314577rItga2b : Locus-Region1SNP  AAAAAA  A A   A   AAAAA A       A  AA  AAC  A A       A/C
rs4229109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314581rItga2b : Locus-Region2SNP  TTTTTT  T T   T   TCTTT T       T  TT  TTT  T T       C/T
rs4229108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314586rItga2b : Locus-Region2SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs4229107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314634rItga2b : mRNA-UTR2SNP  AAAAAA  A A   A   AGAAA A       A  AA  AAA  A A       A/G
rs4229106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314872rItga2b : Intron3SNP  TTTTTT  ? TT TT   TCTTTTT       C TTT  CTC  C T C   T C/T
rs4229105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314888rItga2b : Intron2SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs4229104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314889rItga2b : Intron2SNP  GGGGGG  ? G   G   GGGGG G       A  GG  AG   A G       A/G
rs4229103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314912rItga2b : Intron3SNPG GGG GG  ? GG GG   GGGGGG        A GG   AGA  A G A   G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4229102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102314920rItga2b : Intron1SNP  G G G   G G        AG                                 A/G
rs16794516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315024rItga2b : Intron1SNP  G A     A A   A   AG G  A       G  AA  GA             A/G
rs16794515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315124rItga2b : Intron1SNP    AA    G A       A  GA A       G  A   G G  G         A/G
rs16794514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315126rItga2b : Intron1SNP  G A  G    A       A     A       G       GG  G         A/G
rs16794513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315148rItga2b : Intron1SNP    AA      A       A     A       G  AA  G G  G         A/G
rs16794512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315151rItga2b : Intron1SNP  GG            G     GGG         A      AGG  G G       A/G
rs16794503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315160rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   AAAAA A       A  AA  AAA  C A       A/C
rs16794493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315323rItga2b : Intron25Mixed  AAAAAA  A A   A   AGAAA A       -  AA  -A-  - A       -/A/C/G/T
rs16794501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315323rItga2b : Intron1IN-DEL   AAA A  A     A   A A A A       -   A  -A-  - A       -/A
rs16795740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102315387rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   AAAAA A       T  AA  TAT  T A       A/T
rs16794525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316141rItga2b : Intron1SNP  GA  AA  A A   A     AGA A       A  AA  AAA  A A       A/G
rs16794524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316187rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   T TTT T       C  TT  CTC  C T       C/T
rs16794523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316275rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   A AAA A       G  AA  GAG  G A       A/G
rs16794522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316297rItga2b : Intron1SNP  GG  GG  G G   G   G GGG G       A  GG  AGA  A G       A/G
rs16794521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316315rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   A AAA A       G  AA  GAG  G A       A/G
rs16794520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316522rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   T TTT T       A  TT  ATC  C T       A/C/T
rs16794519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316539rItga2b : Intron1SNP  CCC CC  C C   C     CCC C       A   C  ACA  A C       A/C
rs16794518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316578rItga2b : Intron1SNP  TTT TT  T T   T   T TTT T       A  TT  ATA  A T       A/T
rs16794517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316591rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   G GGG G       T  GG  TGT  T G       G/T
rs16794528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316706rItga2b : Intron1SNP  AA AAA  A A   A   ATA A A          AA   A     A       A/T
rs27040378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316782fItga2b : Intron1SNPG GGG G      G G         G          G             A   G A/G
rs16794527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102316855rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   AGAAA A          AA   A     A       A/G
rs16794526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102317183rItga2b : Intron1SNP  CC CCC    C   C   CTCCC C               C     C       C/T
rs29455575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102317310fItga2b : Coding-NonSynonymous1SNP GA         G                                           A/G
rs16794537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102317959rItga2b : Intron1SNP   A   A            AA AA A       G  A   GAG  G A       A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16794536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102317965rItga2b : Intron1SNP  GG   G            GA GG G       A  G   AGA  A G       A/G
rs16794535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318052rItga2b : Intron1SNP  GG   G            GG GG G       A  G   AGA  A G       A/G
rs16794534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318060rItga2b : Intron1SNP  GG   G             G GG G       A  G   AG   A G       A/G
rs16794533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318169rItga2b : Intron1SNP  AA   A            AG AA A       A  A   AAA  A A       A/G
rs16794532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318170rItga2b : Intron1SNP  GG   G            GA GG G       G  G   GGG  G G       A/G
rs16794531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318173rItga2b : Intron1SNP  GG   G            GG GG G       A      AGA  A G       A/G
rs16794530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318204rItga2b : Intron1SNP  AA   A            AA AA A       G  A   GAG  G A       A/G
rs16794529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318312rItga2b : Coding-Synonymous1SNP  GG   G            GC GG G       G      GGG  G G       C/G
rs29409171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318731fItga2b : Intron1SNP CT    C    C                                           C/T
rs27040377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102318804fItga2b : Coding-NonSynonymous1SNP  GT  G      T T         G          T             G   T G/T
rs16784901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319003rItga2b : Intron1SNP  CCC CC  C C   C    GCCC C          CC  CCG  G C       C/G
rs16784900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319013rItga2b : Intron1SNP  TT TTT  T T   T   TCTTT T       T  TT  TTC    T       C/T
rs16784899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319065rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CCCCC C       C  CC  CCT  T C       C/T
rs16784898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319225rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC  C C       C/T
rs16784897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319237rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GGGGG G       A  GG  AGG  G G       A/G
rs16784896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319252rItga2b : Intron1SNP  GAGGGA  G A   G   AGGGA A       G  AG  GAG    A       A/G
rs16784887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319287rItga2b : Intron9Mixed  T?????  ? ?   ?   ?-?T? ?       T  ??  T??  ? ?       -/A/C/G/T
rs16784886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319295rItga2b : Intron1SNP  GAAAAA  A A   A   AGAGA A       G  AA  GAG  G A       A/G
rs16784885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319311rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GCGGG G       G  GG  GGG  G G       C/G
rs16794544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319312rItga2b : Intron1SNP  TCCCCC  C C   C    CCTC C       T  CC  TCT  T C       C/T
rs16794543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319313rItga2b : Intron1SNP  TGGGGG  G G   G   GAGTG G       T  GG  TGT  T G       A/G/T
rs16794542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319354rItga2b : Intron1SNP  ACCCCC  C C   C   CCCAC C       A  CC  ACA  A C       A/C
rs16794541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319355rItga2b : Intron1SNP  CTTTTT  T T   T   TCTCT T       C  TT  CTC  C T       C/T
rs16794540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319364rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC    C       C/T
rs16794539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319394rItga2b : Intron1SNP  CTTTTT  T T   T   TCTCT T       C  TT  CTC  C T       C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16794538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319483rItga2b : Coding-Synonymous2SNP  CT TTT    TT T    TCTCTTT         T T  CT     T C   T C/T
rs27040376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319713fItga2b : Coding-Synonymous1SNP  CC  C      C C         C          C             T   C C/T
rs16808884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319719rItga2b : Coding-Synonymous1SNP  GG  GG  G G   G   GAGGG G           G   G     G       A/G
rs16808883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102319858rItga2b : Intron1SNP  AGA AG  A G   A   G AAG G          G    G     G       A/G
rs27040375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320591fItga2b : Intron1SNP  CC  C      C C         C          C             A   C A/C
rs16784902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320714fItga2b : Intron1SNP  AA  AA  A A   A   AAAAA A       T  AA  TAT  T A       A/T
rs16784903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320770fItga2b : Intron1SNP  TTT TT  T T   T   TCTTT T       C  TT  CTC  C T       C/T
rs16784904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320878fItga2b : Intron1SNP  GGG GG  G G   G   GTGGG G       G  GG  GGG  G G       G/T
rs16784905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320895fItga2b : Intron1SNP  AAA AA  A A   A   ATAAA A       A  AA  AAA  A A       A/T
rs16784906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320924fItga2b : Intron1SNP  GGG GG  G G   G   GTGGG G       G  GG  GGG  G G       G/T
rs16784907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102320981fItga2b : Intron2SNP  AAA AA  A AA AA    GAAAAA       G AAA  GAG  G A G   A A/G
rs16784908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321020fItga2b : Intron3SNP GGTG GT  G ?T TG   TGGGTGT       G TTG  GTG  G T G   T G/T
rs16784909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321029fItga2b : Intron1SNP  CCC CC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC  C C       C/T
rs16784910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321109fItga2b : Intron1SNP  TTT TT  T T   T   TTTTT T       C  TT  CT     T       C/T
rs16784911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321139fItga2b : Intron1SNP  GGG GG  G G   G   GTGGG G       G  GG  GGG  G G       G/T
rs16784912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321241fItga2b : Coding-Synonymous1SNP  C   CC  C     C     CC          T      TCT  T C       C/T
rs16784913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321250fItga2b : Coding-Synonymous1SNP  T   TT  T T   T   TCTT          C       T   C T       C/T
rs16784914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321256fItga2b : Coding-Synonymous1SNP  G   GG  G G   G   G GG          C       GC            C/G
rs16784925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321344rItga2b : Intron1IN-DEL  ------  - -   -   ----- -       A  --  A-A  A -       -/A
rs16784924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321349rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GGGGG G       A  GG  AGA  A G       A/G
rs16784923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321539rItga2b : Intron1SNP  CCC CC  C C   C   CACCC C       C  CC  CCC  C C       A/C
rs16784922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321540rItga2b : Intron1SNP  GGG GG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs27040374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321617fItga2b : Intron1SNP  TTT T      T T         T          T             C   T C/T
rs16784921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321646rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       T  CC  TCT  T C       C/T
rs16784920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321653rItga2b : Intron1SNP  AAA AA  A A   A   AGAAA A       G  AA  GA     A       A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16784919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321657rItga2b : Intron1SNP  GGG GG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GG     G       A/G
rs16784918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321668rItga2b : Intron1SNP  TTT TT  T T   T   TGTTT T       T  TT  TTT  T T       G/T
rs16784917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321710rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TTTTT T          TT  CTC  C T       C/T
rs16784916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321736rItga2b : Intron1Mixed  TTTTTT  T T   T   TTTTT T       -  TT  -T-  C T       -/C/T
rs16784915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321755rItga2b : Intron1SNP   T  TT  T T   T   TCTTT T           T  CTC    T       C/T
rs29473582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321766fItga2b : Intron1SNP GG    T    G                                           G/T
rs16796449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321961rItga2b : Intron1IN-DEL  CCCCCC  C C   C     CCC C       -  CC  -C-  - C       -/C
rs16796448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102321962rItga2b : Intron1IN-DEL  AAAAAA  A A   A     AAA A       -  AA  -A-  - A       -/A
rs16784935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322096rItga2b : Coding-Synonymous3SNP  AGGGGG  G GG GG   GAGAGGG       A GGG  AGA    G A   G A/G
rs16784934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322138rItga2b : Coding-Synonymous2SNP  GGAAAG  A ?   A   G AGG G       G  GA  GGG  G G       A/G
rs16784933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322220rItga2b : Intron2SNP  AAAAAA  A  A AA   ACAAAAA       C AAA   AC  C A C   A A/C
rs16784932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322223rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16784931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322253rItga2b : Intron2SNP  AAAAAA  A  A AA   AAAAAAA       G AAA   A     A G   A A/G
rs16784930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322268rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16784929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322392rItga2b : Intron1SNP  ACAAA   A     A   CCAA  C       C  CA   C     C       A/C
rs13481197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322655fItga2b : Coding-Synonymous3SNPC?TTCCCTTTCCCTCTCTCTTCCTTCTTTTTTCCCCTTCCCCTCCTCCTC TCTTCC/T
rs27040373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322731fItga2b : Intron2SNPGGAA  GA     A A         G          A             G   A A/G
rs16795632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322822rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GGGGG G       A  GG  AGA  A G       A/G
rs16795631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322858rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TCTTT T       T  TT  TTT    T       C/T
rs16795630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322884rItga2b : Intron3SNPCCCTCCCT  C ?T TC   TCCCTCT       C TTC  CTC    T C   T C/T
rs16795629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102322937rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA    A   A   AGAAA A       A  A   AAA            A/G
rs16808885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323213fItga2b : Intron1SNP   TT TT  T T   T   TCTTT T       T  TT  TTT  T T       C/T
rs16808886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323236fItga2b : Intron1SNP    A AA  A A   A    CAA          A       A   A A       A/C
rs16808887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323238fItga2b : Intron1SNP    T TT  T T   T   TGTT  T               TT  T T       G/T
rs16808888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323381fItga2b : Intron1SNP    A AA  A A   A   AGAA  A       A   A   AA    A       A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16808889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323385fItga2b : Intron1SNP  G T  T  T T   T   TTT   T       T       T     T       G/T
rs16808890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323388fItga2b : Intron1SNP  G T       T        T    T          G   GT             G/T
rs16808891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102323472fItga2b : Intron1SNP    T TT  T T   T    CTT  T       T       T     T       C/T
rs29480476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102324324fItga2b : Intron1SNPAAG    G                                                A/G
rs16795639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325355rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TGTTT T       T  TT  TTT  T T       G/T
rs16795638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325359rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   AGAAA A       A  AA  AAA  A A       A/G
rs16795637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325385rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC  C C       C/T
rs16795636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325441rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   ACAAA A       A  AA  AAA  A A       A/C
rs16795635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325456rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GGGGG G       A  GG  AGA  G G       A/G
rs16795634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325503rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CCCCC C       T  CC  TCT  T C       C/T
rs27040372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325506fItga2b : Intron1SNP  AA  A      A A         A          A             G     A/G
rs29467807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325564fItga2b : Intron1SNPT C    C    T                                           C/T
rs16795633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325750rItga2b : Intron1SNP  CC CCC    T   C   CCCCC C          C   C C    C       C/T
rs16796458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325921rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   AGAAA A       A  AA  AAA  A A       A/G
rs16796457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102325955rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16796456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326016rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16796455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326076rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC  C C       C/T
rs16796454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326084rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   ATAAA A       A  AA  AAA  A A       A/T
rs16796453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326141rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16796452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326142rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16796451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326171rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TCTTT T       T  TT  TTT  T T       C/T
rs16796450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326287rItga2b : Coding-NonSynonymous1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  C   CCC    C       C/T
rs16796464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326499rItga2b : Intron1SNP  CCC CC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC  C C       C/T
rs16796463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326526rItga2b : Intron1SNP  AAA AA  A A   A   AGAAA A       A  AA  AAA  A A       A/G
rs16796462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326621rItga2b : Coding-Synonymous1SNP  CCC CC  C C   C   CTCCC C          CC  CCC  C C       C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16796461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326694rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   ACAAA A       A  AA  AAA  A A       A/C
rs16796460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326788rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C          CC  CCC  C C       C/T
rs16796459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102326807rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16796465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102327366rItga2b : Intron1IN-DEL   C  CC  C     C     - C C               C     -       -/C
rs16796474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102327662rItga2b : Coding-Synonymous2SNPC CC  CC  ? CC C    C CCCC        G CC         GC G   C C/G
rs27040371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102327863fItga2b : Intron1SNP  CC  C   G  CGC         C          C          G  G   C C/G
rs16796473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102327930rItga2b : Intron1SNP      G         G     G   A       G      G G  G         A/G
rs16796472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102327999rItga2b : Intron1SNP  AA A A  A A       AT AA A       A  A   AA             A/T
rs16796471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328015rItga2b : Intron1SNP     C                 C                 C      T       C/T
rs16796470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328043rItga2b : Intron1SNP  GG G G  G G       GG GG G       A  G   AG     G       A/G
rs16796469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328060rItga2b : Intron1SNP   A                      A       G      G              A/G
rs16796468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328064rItga2b : Intron1SNP  AA A A    C       AA  A A              A              A/C
rs16796467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328090rItga2b : Intron1SNP  TT T T    T       TT TT T       G  T   TTT    T       G/T
rs16796466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328092rItga2b : Intron1SNP  CC C C            CC CC C       G  C   CC             C/G
rs16796480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328172rItga2b : Intron1SNP  TTT TT  T T   T   TATTT T       A  TT  AT   A T       A/T
rs16796479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328189rItga2b : Intron1SNP  GG  GG  G G   G   GGGGG G       A  GG  AGA  A G       A/G
rs27040370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328328fItga2b : Intron1SNPT TT  T   C  TC          T          T          C  C     C/T
rs16796478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328462rItga2b : Intron2SNPA AAA AA  ? AAGAA   AGAAAAA       G AAA  GAG  GGA G   A A/G
rs16796477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328503rItga2b : Intron1SNP  TTT TT  T T   T   TATTT T       T  TT  TTT  T T       A/T
rs16796476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328635rItga2b : Intron1SNP  CC CCC  C     C   CTCCC C          CC  CC     C       C/T
rs16796475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328676rItga2b : Coding-NonSynonymous1SNP  CC CCC    C   C   CACCC C           C   C     C       A/C
rs27040369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328765fItga2b : Coding-Synonymous1SNPC CCC C   T CCTC         C          C          T  T   C C/T
rs16795647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328853rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16795646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328867rItga2b : Intron2SNP  TTTTTT  ? TTC T   TCTTT T       C TTT  CTC  CCT C     C/T
rs16795645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328878rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CACCC C       C  CC  CCC  C C       A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16795644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328890rItga2b : Intron2SNP  AA AAA  ? AAGAA   AGAAAAA       G AAA  GAG  GGA G   A A/G
rs16795643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102328984rItga2b : Coding-NonSynonymous1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       G  GG  GGG  G G       A/G
rs16795642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329081rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   ACAAA A       C  AA  CAC    A       A/C
rs16795641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329101rItga2b : Coding-Synonymous1SNP  CC  CC    C   C    TC   C       C       CC    C       C/T
rs27040368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329155fItga2b : Coding-Synonymous1SNPG GGG G   G GGGG         G          G          G  A   G A/G
rs16795640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329266rItga2b : Intron1SNP  C   C     C         C           T        T    C       C/T
rs27025367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329300fItga2b : Intron1SNPC CC  C     CCTC         C          C          T  T   C C/T
rs16796484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329474rItga2b : Intron2SNPA AAAAAA  ? AAGAA   A AAAAA       G AAA  GAG  GGA G   A A/G
rs16796483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329660rItga2b : Intron2SNP  AAAAAA  ? AAG A   AGAAAAA       G  AA  GAG  GGA G   A A/G
rs16796482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329712rItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TTTTT T       C  TT  CTC  C T       C/T
rs16796481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329722rItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   AAAAA A       C  AA  CAC  C A       A/C
rs27025366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329791fItga2b : Intron2SNP GAG  GG  G   G          G          G          G  G   G A/G
rs27025365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329873fItga2b : Intron1SNP  G       A  AA          G                     A  A     A/G
rs16808892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102329984fItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TCTTT T       T  TT  TTT    T       C/T
rs16808893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330036fItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GAGGG G       A  GG  AGA  A G       A/G
rs16808894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330130fItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T   TATTT T       T  TT  TTT  T T       A/T
rs16808895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330155fItga2b : Intron1SNP  TTTTTT  T T   T    CTTT T       T  TT  TTT  T T       C/T
rs16808896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330168fItga2b : Intron1SNP  AAAAAA  A A   A   ATAAA A       A  AA  AA   A A       A/T
rs16808897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330266fItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  CC   C   C C       C/T
rs16795628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330526rItga2b : Intron1SNP  CCCCCC  C C   C    TCCC C       C  CC  CC   C C       C/T
rs16795627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330527rItga2b : Intron2SNPC CCCCCC  C CCCCC    CCCCCC       C CC   CC   TTC C   C C/T
rs16795655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330602rItga2b : Intron1SNP  GGGGGG  G G   G   GCGGG G       G  GG  GGG  G G       C/G
rs27025364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330769fItga2b : Intron1SNPT TT  T   C  TCT         T          T          C  C   T C/T
rs16796487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330793rItga2b : Intron2SNPC CCC CC  ? CCTCC   CCCCCCC       T C C  TCT  TTC T   C C/T
rs16796486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330917rItga2b : Coding-NonSynonymous2SNP  AAAAAA  ? AATAA   AAAAAAA       T AAA  TAT  TTA T   A A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16796485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102330975rItga2b : Coding-NonSynonymous1SNP  CCCCCC  C C   C   CCCCC C       T   C  TCT    C       C/T
rs16795650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102331180rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  --C---  - -   -   -C--- -          --  - -  - -       -/C
rs16795649
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102331193rItga2b : Locus-Region1IN-DEL  --G---  - -       -G--- -       G  --  G-G  G -       -/G
rs16795648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102331296rItga2b : Locus-Region1SNP  CCCCCC  C C   C   CTCCC C       C  CC  CCC  C C       C/T
rs27025363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102331408fItga2b : Locus-Region1SNPC CC  C   C  CCC         C          C          C  T   C C/T
rs27025362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:102331463fItga2b : Locus-Region1SNPT TT  T   C  TCT         T          T          C  C     C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory