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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Il3 interleukin 3 MGI:96552 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs13496294 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54076612 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485786 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54076706 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496295 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54076932 | f | Il3 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | G | G | G | G | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485787 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077122 | f | Il3 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945911 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077161 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29451655 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077185 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29435715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077205 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485788 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077319 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496296 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077430 | f | Il3 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | T | G | G | G | G | G | G | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485789 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077510 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29397655 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077616 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29424729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077625 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29390377 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077633 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496297 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077849 | f | Il3 : Locus-Region | 3 | SNP | G | G | G | A | A | A | G | A | G | A | G | G | A | G | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945910 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077856 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485790 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54077907 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485791 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078018 | f | Il3 : Locus-Region | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496298 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078138 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485792 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078256 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29430226 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078335 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496299 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078377 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485793 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078413 | f | Il3 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496300 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078511 | f | Il3 : Locus-Region | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485794 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078791 | f | Il3 : mRNA-UTR | 3 | SNP | C | C | C | T | T | T | C | T | T | C | C | C | C | T | C | T | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13502500 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078858 | f | Il3 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs13496301 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54078917 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485795 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079025 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496302 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079036 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485796 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079155 | f | Il3 : Intron | 3 | SNP | A | A | A | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | G | A | G | A | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485797 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079192 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496303 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079237 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485798 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079412 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496304 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079485 | f | Il3 : Intron | 3 | SNP | A | A | A | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | G | A | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485799 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079642 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485800 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079718 | f | Il3 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496305 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079875 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485801 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54079997 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945909 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080113 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496306 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080244 | f | Il3 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485802 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080265 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496307 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080293 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485803 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080362 | f | Il3 : Intron | 3 | SNP | C | C | C | T | T | T | C | T | C | T | C | T | T | T | C | C | T | C | T | C | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29419837 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080375 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | G | G | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485804 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080479 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 3 | SNP | C | C | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945908 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080484 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | G | T | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945907 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080490 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945906 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080491 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | T | T | T | C | C | T | C | C | T | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496308 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080524 | f | Il3 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945905 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080536 | f | Il3 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | A | C | A | A | A | C | A | C | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13459130 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080664 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 4 | SNP | T | T | T | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | T | T | C | T | T | C | C | C | T | C | T | T | C | C | C | T | T | T | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C/T |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs26945904 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080685 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | T | T | T | A | A | T | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13496309 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54080697 | f | Il3 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945903 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54081123 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485805 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54081135 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13485806 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54081169 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs26945902 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:54081235 | f | Il3 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | C | C | G | C/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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