About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Ihh
Indian hedgehog
MGI:96533

64 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31014615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74943389fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : 1930 bp downstream of
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
2SNP AC    A C                     A/C
rs31979045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74943459fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : 1860 bp downstream of
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
2SNP AC    A C                     A/C
rs31439235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74943589fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : 1730 bp downstream of
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
3SNPAAT    A T    T        T       A/T
rs31499586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945207fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
3SNPGGC    G      G        C       C/G
rs31996712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945470fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG C    G C                     C/G
rs31565277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945476fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG A    G A                     A/G
rs31676857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945509fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG A    G A                     A/G
rs16785040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945819fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCTC   CCTCCC CC CCCC C  C/T
rs16785041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945856fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCCC   CCACCC CC CCCC C  A/C
rs16785042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945928fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCCC   CCTCCC CC CCCC C  C/T
rs16785043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945940fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAAA   AACAAA AA AAAA A  A/C
rs16785044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74945991fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAGA   AAAAAA AA AAAA A  A/G
rs16785045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946005fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTGT   TTTTTT TT TTTT T  G/T
rs16785046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946022fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : mRNA-UTR
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGGG   GGAGGG GG GGGG G  A/G
rs228947822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946122fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-Synonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP              A        A       A
rs16785047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946166fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-NonSynonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTTT   TTGTTT TT TTTT T  G/T
rs16793344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946359fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-Synonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGGG   GGAGGG GG GGGG G  A/G
rs16793345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946387fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-NonSynonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTCT   TTCTTT TT TTTT T  C/T
rs16793346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946578fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-Synonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGTG   GGGGGG GG GGGG G  G/T
rs16793347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946602fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-Synonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAAA   AAGAAA AA AAAA A  A/G
rs16785048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946910fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  C  C  T    CCT C     CCCC C  C/T
rs16785049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946978fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG GG    GGGG G  A/G
rs16785050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946984fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  G    GGA GG    GGGG G  A/G
rs16785051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946994fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG G     GGGG G  A/G
rs16785052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74946999fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  T  T  C    TTC TT    TTTT T  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16785053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947013fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG G     GGGG G  A/G
rs16785054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947027fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  G    GGA G     GGGG G  A/G
rs16785055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947074fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG GG    GGGG G  A/G
rs16785056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947076fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG GG    GGGG G  A/G
rs16785057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947096fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  A  A  A    AAG AA    AAAA A  A/G
rs16785058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947131fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG G     GGGG G  A/G
rs16785059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947212fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  G  G  A    GGG G     GGGG G  A/G
rs247658694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947424fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP              C        G       C/G
rs16793348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947498fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAAA   AACAAA A  AAAA A  A/C
rs16793349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947601fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAGA   AAAAAA AA AAAA A  A/G
rs16793350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947625fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTCT   TTCTTT TT TTTT T  C/T
rs16793351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947813fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTGT   TTGTTT TT TTTT T  G/T
rs16793352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947836fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGTG   GGGGGG GG GGGG G  G/T
rs16793353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947838fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGAG   GGGGGG GG GGGG G  A/G
rs16793354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947853fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAAA   AACAAA AA AAAA A  A/C
rs16793355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74947867fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGGG   GGAGGG GG GGGG G  A/G
rs31820808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74948085fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
3SNP CT    C T    C        T       C/T
rs16793356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74948246fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  C CCC CC   ACCCCC  C  CCC    A/C
rs16793357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74948509fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Coding-Synonymous
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  A AAA AA   AAGAAA  A AAAA    A/G
rs31906674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74948638fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
2SNP AC    A C    A        C       A/C
rs31711958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950292fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
3SNP CA    C A    C        A       A/C
rs16793336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950596fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCCC   CCTCCC CC CCCC C  C/T
rs16793337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950604fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
4SNP TGTTTGTGG   TTGTGT GT GTGT T  G/T
rs16793338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950611fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTTT   TTCTTT TT TTTT T  C/T
rs16793339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950634fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCCC   CCACCC CC CCCC C  A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16793340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950681fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAAA   AAGAAA AA AAAA A  A/G
rs16793341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950719fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTTT   TTCTTT TT TTTT T  C/T
rs16793342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74950860fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Intron
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGGG   GGAGGG GG GGGG G  A/G
rs235328786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74951914fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP              C        G       C/G
rs16785034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74952325fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGG A    GGAG G GG GGGG G  A/G
rs16785035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74952411fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCC C    CCTC C CC CCCC C  C/T
rs16785036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74952508fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCC C    CCAC C CC CCCC C  A/C
rs16785037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74952515fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCC C    CCTC C CC CCCC C  C/T
rs16785038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74952615fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAA G    AAAA A AA AAAA A  A/G
rs16785039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74952666fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TTTTT G    TTTT T TT TTTT T  G/T
rs16793343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74953184fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  TCC T TT      CT  T  TCT     C/T
rs50421357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74953411fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TGT T  TT T      T  T    T  TG/T
rs254410950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74953416fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP              A        G       A/G
rs52548629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:74953534fDbf : within coordinates of
dde : within coordinates of
Ihh : Locus-Region
repro4 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT T T T ATTAT      T  T    T ATA/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory