Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  2
• Reference
  J:37225 Peichel CL, et al., Genetic and physical mapping of the mouse Ulnaless locus. Genetics. 1996 Dec;144(4):1757-67
• ID
  MGI:48130

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Mit11	SSLP
D2Mit381	SSLP
D2Mit328	SSLP
D2Mit10	SSLP
D2Pri1	Southern analysis	FF1L
Hoxd11	SSLP	D2Tfv9f/D2Tfv9r
Hoxd	visible phenotype
D2Mit247	SSLP
D2Mit418	SSLP
D2Mit219	SSLP
D2Mit93	SSLP
D2Mit158	SSLP
D2Mit14a	SSLP

Notes

• Reference
  Authors state that all ten genes of the Hoxd cluster are possible candidate genes for U1.
• Experiment
  F1 direction known.
  

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m>
• Strain
  (B6C3F1-Lnpk

  x MOLF/Ei)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  C57BL/6J
• Allele 1
  b from C57BL/6J
• Allele 2
  m from MOLF/EiJ

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D2Mit11	D2Mit10	3	155
D2Mit381	D2Mit10	3	155
D2Mit328	D2Mit10	3	155
D2Mit10	D2Pri1	0	155
D2Mit10	Hoxd11	0	155
D2Mit10	Hoxd	0	155
D2Mit10	D2Mit247	0	155
D2Mit10	D2Mit418	0	155
D2Pri1	D2Mit219	0	155
Hoxd11	D2Mit219	0	155
Hoxd	D2Mit219	0	155
D2Mit247	Hoxd11	0	155
D2Mit247	Hoxd	0	155
D2Mit247	D2Mit219	0	155
D2Mit247	D2Mit418	0	155
D2Mit418	Hoxd11	0	155
D2Mit418	Hoxd	0	155
D2Mit418	D2Mit219	0	155
D2Pri1	D2Mit93	0	155
Hoxd11	D2Mit93	0	155
Hoxd	D2Mit93	0	155
D2Mit247	D2Mit93	0	155
D2Mit418	D2Mit93	0	155
D2Pri1	D2Mit158	0	155
Hoxd11	D2Mit158	0	155
Hoxd	D2Mit158	0	155
D2Mit247	D2Mit158	0	155
D2Mit418	D2Mit158	0	155
D2Mit219	D2Mit14a	6	152
D2Mit93	D2Mit14a	6	152
D2Mit158	D2Mit14a	6	152

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit11	D2Mit10	3	158	1.899	1.086
D2Mit381	D2Mit10	3	158	1.899	1.086
D2Mit328	D2Mit10	3	158	1.899	1.086
D2Mit10	D2Pri1	0	155	0.000	0.000
D2Mit10	Hoxd11	0	155	0.000	0.000
D2Mit10	Hoxd	0	155	0.000	0.000
D2Mit10	D2Mit247	0	155	0.000	0.000
D2Mit10	D2Mit418	0	155	0.000	0.000
D2Pri1	D2Mit219	0	155	0.000	0.000
Hoxd11	D2Mit219	0	155	0.000	0.000
Hoxd	D2Mit219	0	155	0.000	0.000
D2Mit247	Hoxd11	0	155	0.000	0.000
D2Mit247	Hoxd	0	155	0.000	0.000
D2Mit247	D2Mit219	0	155	0.000	0.000
D2Mit247	D2Mit418	0	155	0.000	0.000
D2Mit418	Hoxd11	0	155	0.000	0.000
D2Mit418	Hoxd	0	155	0.000	0.000
D2Mit418	D2Mit219	0	155	0.000	0.000
D2Pri1	D2Mit93	0	155	0.000	0.000
Hoxd11	D2Mit93	0	155	0.000	0.000
Hoxd	D2Mit93	0	155	0.000	0.000
D2Mit247	D2Mit93	0	155	0.000	0.000
D2Mit418	D2Mit93	0	155	0.000	0.000
D2Pri1	D2Mit158	0	155	0.000	0.000
Hoxd11	D2Mit158	0	155	0.000	0.000
Hoxd	D2Mit158	0	155	0.000	0.000
D2Mit247	D2Mit158	0	155	0.000	0.000
D2Mit418	D2Mit158	0	155	0.000	0.000
D2Mit219	D2Mit14a	6	158	3.797	1.521
D2Mit93	D2Mit14a	6	158	3.797	1.521
D2Mit158	D2Mit14a	6	158	3.797	1.521