Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  1
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46486

Genes

Gene	Assay Type
D1Mit1	PCR amplified length variant
D1Mit211	PCR amplified length variant
D1Mit20	PCR amplified length variant
D1Mit170	PCR amplified length variant
D1Mit237	PCR amplified length variant
D1Mit18	PCR amplified length variant
D1Mit5.1	PCR amplified length variant
D1Mit21	PCR amplified length variant
D1Mit22	PCR amplified length variant
D5Mit1003	PCR amplified length variant
D1Mit23	PCR amplified length variant
D1Mit162	PCR amplified length variant
D1Mit215	PCR amplified length variant
D1Mit216	PCR amplified length variant
D1Mit8	PCR amplified length variant
D1Mit49	PCR amplified length variant
D1Mit48	PCR amplified length variant
D1Mit45	PCR amplified length variant
D1Mit192	PCR amplified length variant
D1Mit30	PCR amplified length variant
D1Mit31	PCR amplified length variant
D1Mit164	PCR amplified length variant
D1Mit200	PCR amplified length variant
D1Mit43	PCR amplified length variant
D1Mit42	PCR amplified length variant
D1Mit14	PCR amplified length variant
D1Mit33	PCR amplified length variant
D1Mit227	PCR amplified length variant
D1Mit16	PCR amplified length variant
D1Mit15	PCR amplified length variant
D1Mit36	PCR amplified length variant
D1Mit205	PCR amplified length variant
D1Mit206	PCR amplified length variant
D1Mit207	PCR amplified length variant
D1Mit208	PCR amplified length variant
D1Mit221	PCR amplified length variant
D1Mit56	PCR amplified length variant
D1Mit17	PCR amplified length variant
D1Nds5	PCR amplified length variant
Chrng	PCR amplified length variant
Ptprc	PCR amplified length variant
Pepc	PCR amplified length variant
Fcgr2b	PCR amplified length variant
Mtv7	PCR amplified length variant
Akp1	PCR amplified length variant
Ly33	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  BALB/cHeA x STS/A
• Designation
  CcS
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
D1Mit1	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit211	S	S	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit20	S	S	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit170	S	S	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit237	S	C	C	C	C	.	.	C	C	C	C	C	.	.	.	C	C	.	C	C
D1Mit18	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C
D1Mit5.1	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit21	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit22	S	Z	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	.
D5Mit1003	C	C	C	C	S	.	.	C	C	C	C	C	C	.	.	C	C	C	C	.
D1Mit23	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	.
D1Mit162	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	.
D1Mit215	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	.
D1Mit216	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit8	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit49	Z	C	Z	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	.	C	S	C	.
D1Mit48	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	.
D1Mit45	S	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D1Mit192	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D1Mit30	C	C	.	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D1Mit31	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D1Mit164	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	.
D1Mit200	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
D1Mit43	C	C	.	C	.	X	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	X	C	.
D1Mit42	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C
D1Mit14	C	.	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S
D1Mit33	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	.
D1Mit227	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S
D1Mit16	.	.	.	.	.	.	S	C	C	C	Z	C	C	C	C	.	C	C	Z	C
D1Mit15	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	Z	C
D1Mit36	C	.	C	C	C	C	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit205	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit206	C	S	Z	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	C	C
D1Mit207	C	S	C	C	C	.	.	C	C	C	S	S	C	.	.	C	C	.	C	C
D1Mit208	C	S	C	C	C	C	C	S	C	C	S	S	C	C	C	.	C	C	S	.
D1Mit221	C	S	C	C	C	C	C	S	C	C	.	S	C	C	C	C	C	C	C	.
D1Mit56	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	.	C	.
D1Mit17	C	S	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	S	S
D1Nds5	C	.	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	.	.
Chrng	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
Ptprc	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C
Pepc	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	.
Fcgr2b	C	C	C	C	C	C	S	C	Z	Z	S	S	C	C	Z	C	C	C	C	C
Mtv7	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C	C	C	C	S	C
Akp1	C	S	C	C	C	C	C	S	C	C	Z	S	C	C	C	C	C	C	S	.
Ly33	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D1Mit1	D1Mit211	2	20	2.941	2.321
D1Mit211	D1Mit20	0	19	0.000	0.000
D1Mit20	D1Mit170	1	19	1.429	1.510
D1Mit170	D1Mit237	1	14	2.000	2.159
D1Mit237	D1Mit18	0	13	0.000	0.000
D1Mit18	D1Mit5.1	0	19	0.000	0.000
D1Mit5.1	D1Mit21	0	20	0.000	0.000
D1Mit21	D1Mit22	0	17	0.000	0.000
D1Mit22	D5Mit1003	2	13	5.000	4.228
D5Mit1003	D1Mit23	2	14	4.545	3.787
D1Mit23	D1Mit162	0	17	0.000	0.000
D1Mit162	D1Mit215	0	17	0.000	0.000
D1Mit215	D1Mit216	0	18	0.000	0.000
D1Mit216	D1Mit8	3	20	4.839	3.323
D1Mit8	D1Mit49	1	16	1.724	1.842
D1Mit49	D1Mit48	0	16	0.000	0.000
D1Mit48	D1Mit45	1	19	1.429	1.510
D1Mit45	D1Mit192	2	19	3.125	2.482
D1Mit192	D1Mit30	0	17	0.000	0.000
D1Mit30	D1Mit31	0	17	0.000	0.000
D1Mit31	D1Mit164	0	18	0.000	0.000
D1Mit164	D1Mit200	0	18	0.000	0.000
D1Mit200	D1Mit43	1	15	1.852	1.988
D1Mit43	D1Mit42	0	14	0.000	0.000
D1Mit42	D1Mit14	1	18	1.515	1.606
D1Mit14	D1Mit33	0	17	0.000	0.000
D1Mit33	D1Mit227	0	18	0.000	0.000
D1Mit227	D1Mit16	1	11	2.632	2.905
D1Mit16	D1Mit15	1	11	2.632	2.905
D1Mit15	D1Mit36	0	18	0.000	0.000
D1Mit36	D1Mit205	0	19	0.000	0.000
D1Mit205	D1Mit206	2	19	3.125	2.482
D1Mit206	D1Mit207	0	14	0.000	0.000
D1Mit207	D1Mit208	2	13	5.000	4.228
D1Mit208	D1Mit221	1	17	1.613	1.716
D1Mit221	D1Mit56	3	16	6.522	4.722
D1Mit56	D1Mit17	2	15	4.167	3.429
D1Mit17	D1Nds5	0	14	0.000	0.000
D1Nds5	Chrng	0	16	0.000	0.000
Chrng	Ptprc	0	20	0.000	0.000
Ptprc	Pepc	1	19	1.429	1.510
Pepc	Fcgr2b	4	16	10.000	6.928
Fcgr2b	Mtv7	3	17	6.000	4.275
Mtv7	Akp1	1	18	1.515	1.606
Akp1	Ly33	3	18	5.556	3.904