Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  11
• Reference
  J:40351 Wakabayashi Y, et al., Genetic and physical delineation of the region of the mouse deafness mutation shaker-2. Biochem Biophys Res Commun. 1997 May 8;234(1):107-10
• ID
  MGI:893480

Genes

Gene	Assay Type
Anxa6	reported elsewhere
D11Mit143	PCR amplified length variant
D11Mit112	PCR amplified length variant
D11Mit155a	PCR amplified length variant
D11Mit316	PCR amplified length variant
Myo15a	visible phenotype
D11Mit26	PCR amplified length variant
Llgl1	reported elsewhere
D11Mit157	PCR amplified length variant
D11Mit260	PCR amplified length variant
D11Mit261	PCR amplified length variant
D11Mit317	PCR amplified length variant
D11Mit88	PCR amplified length variant
D11Mit350	PCR amplified length variant
Pmp22	reported elsewhere
D11Mit339	PCR amplified length variant
D11Jpk1	reported elsewhere

Notes

• Reference
  Authors use Camb and Mgl1 for locus symbols Anx6 and Llglh respectively.

CROSS

• Type
  Backcross, male
• Female Parent
  <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
• Strain
  STOCK Myo15a
• Male Parent
  <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
• Strain
  (MSM x STOCK Myo15a)F1
• Allele 1
  s from STOCK Myo15a
• Allele 2
  m from MSM/Ms

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
Anxa6	D11Mit143	30	921
Anxa6	D11Mit112	30	921
D11Mit143	D11Mit155a	1	950
D11Mit112	D11Mit155a	1	950
D11Mit155a	D11Mit316	2	949
D11Mit316	Myo15a	2	949
D11Mit316	D11Mit26	2	949
D11Mit316	Llgl1	9	949
Myo15a	D11Mit157	3	948
Myo15a	D11Mit260	3	948
Myo15a	D11Mit261	3	948
Myo15a	D11Mit317	3	948
D11Mit26	D11Mit157	3	948
D11Mit26	D11Mit260	3	948
D11Mit26	D11Mit261	3	948
D11Mit26	D11Mit317	3	948
Llgl1	D11Mit157	3	948
Llgl1	D11Mit260	3	948
Llgl1	D11Mit261	3	948
Llgl1	D11Mit317	3	948
D11Mit157	D11Mit88	2	949
D11Mit260	D11Mit88	2	949
D11Mit261	D11Mit88	2	949
D11Mit317	D11Mit88	2	949
D11Mit157	D11Mit350	2	949
D11Mit260	D11Mit350	2	949
D11Mit261	D11Mit350	2	949
D11Mit317	D11Mit350	2	949
D11Mit157	Pmp22	2	949
D11Mit260	Pmp22	2	949
D11Mit261	Pmp22	2	949
D11Mit317	Pmp22	2	949
D11Mit88	D11Mit339	9	942
D11Mit350	D11Mit339	9	942
Pmp22	D11Mit339	9	942
D11Mit339	D11Jpk1	16	935

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
Anxa6	D11Mit143	30	951	3.155	0.567
Anxa6	D11Mit112	30	951	3.155	0.567
D11Mit143	D11Mit155a	1	951	0.105	0.105
D11Mit112	D11Mit155a	1	951	0.105	0.105
D11Mit155a	D11Mit316	2	951	0.210	0.149
D11Mit316	Myo15a	2	951	0.210	0.149
D11Mit316	D11Mit26	2	951	0.210	0.149
D11Mit316	Llgl1	9	958	0.939	0.312
Myo15a	D11Mit157	3	951	0.315	0.182
Myo15a	D11Mit260	3	951	0.315	0.182
Myo15a	D11Mit261	3	951	0.315	0.182
Myo15a	D11Mit317	3	951	0.315	0.182
D11Mit26	D11Mit157	3	951	0.315	0.182
D11Mit26	D11Mit260	3	951	0.315	0.182
D11Mit26	D11Mit261	3	951	0.315	0.182
D11Mit26	D11Mit317	3	951	0.315	0.182
Llgl1	D11Mit157	3	951	0.315	0.182
Llgl1	D11Mit260	3	951	0.315	0.182
Llgl1	D11Mit261	3	951	0.315	0.182
Llgl1	D11Mit317	3	951	0.315	0.182
D11Mit157	D11Mit88	2	951	0.210	0.149
D11Mit260	D11Mit88	2	951	0.210	0.149
D11Mit261	D11Mit88	2	951	0.210	0.149
D11Mit317	D11Mit88	2	951	0.210	0.149
D11Mit157	D11Mit350	2	951	0.210	0.149
D11Mit260	D11Mit350	2	951	0.210	0.149
D11Mit261	D11Mit350	2	951	0.210	0.149
D11Mit317	D11Mit350	2	951	0.210	0.149
D11Mit157	Pmp22	2	951	0.210	0.149
D11Mit260	Pmp22	2	951	0.210	0.149
D11Mit261	Pmp22	2	951	0.210	0.149
D11Mit317	Pmp22	2	951	0.210	0.149
D11Mit88	D11Mit339	9	951	0.946	0.314
D11Mit350	D11Mit339	9	951	0.946	0.314
Pmp22	D11Mit339	9	951	0.946	0.314
D11Mit339	D11Jpk1	16	951	1.682	0.417