Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  2
• Reference
  J:38533 Alfred JB, et al., Mapping in the region of Danforth's short tail and the localization of tail length modifiers. Genome Res. 1997 Feb;7(2):108-17
• ID
  MGI:48463

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Mit1	reported elsewhere
D2Mit31	reported elsewhere
D2Mit119	reported elsewhere
D2Mit149	reported elsewhere
D2Mit118	reported elsewhere
D2Ucl2	PCR amplified length variant
D2Mit267	reported elsewhere
D2Mit464	reported elsewhere
D2Mit362	reported elsewhere
Bmi1	Southern analysis	Bmil genomic4
Etn2	visible phenotype
D2Mit363	reported elsewhere
D2Mit364	reported elsewhere
D2Mit6	reported elsewhere
D2Mit416	reported elsewhere
D2Mit80	reported elsewhere
Il1rn	SSCP	IL1rn-pC, Il1rn-pD
D2Mit79	reported elsewhere
D2Mit292	reported elsewhere
Pax8	SSCP	Pax-pA, Pax-pB
D2Mit7	reported elsewhere

CROSS

• Type
  Backcross, sexes unspecified or combined
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>
• Strain
  (CBA/Ca-Etn2 x CAST/Ei)F1-Etn2
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  CBA/Ca
• Allele 1
  b from CBA/Ca
• Allele 2
  c from CAST/EiJ

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D2Mit1	D2Mit31	7	93
D2Mit31	D2Mit119	0	336
D2Mit119	D2Mit118	2	334
D2Mit118	D2Mit149	0	336
D2Mit149	D2Ucl2	1	335
D2Ucl2	D2Mit267	4	332
D2Mit267	D2Mit362	2	334
D2Mit362	D2Mit464	0	336
D2Mit464	Bmi1	0	336
Bmi1	Etn2	1	335
Etn2	D2Mit80	2	334
D2Mit80	D2Mit6	0	336
D2Mit6	D2Mit416	0	336
D2Mit416	D2Mit363	0	336
D2Mit363	D2Mit364	0	336
D2Mit364	Il1rn	0	336
Il1rn	D2Mit292	1	279
D2Mit292	D2Mit79	0	280
D2Mit79	Pax8	0	280
Pax8	D2Mit7	31	249

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit1	D2Mit31	7	100	7.000	2.551
D2Mit31	D2Mit119	0	336	0.000	0.000
D2Mit119	D2Mit118	2	336	0.595	0.420
D2Mit118	D2Mit149	0	336	0.000	0.000
D2Mit149	D2Ucl2	1	336	0.298	0.297
D2Ucl2	D2Mit267	4	336	1.190	0.592
D2Mit267	D2Mit362	2	336	0.595	0.420
D2Mit362	D2Mit464	0	336	0.000	0.000
D2Mit464	Bmi1	0	336	0.000	0.000
Bmi1	Etn2	1	336	0.298	0.297
Etn2	D2Mit80	2	336	0.595	0.420
D2Mit80	D2Mit6	0	336	0.000	0.000
D2Mit6	D2Mit416	0	336	0.000	0.000
D2Mit416	D2Mit363	0	336	0.000	0.000
D2Mit363	D2Mit364	0	336	0.000	0.000
D2Mit364	Il1rn	0	336	0.000	0.000
Il1rn	D2Mit292	1	280	0.357	0.357
D2Mit292	D2Mit79	0	280	0.000	0.000
D2Mit79	Pax8	0	280	0.000	0.000
Pax8	D2Mit7	31	280	11.071	1.875