Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  4
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46547

Genes

Gene	Assay Type
D4Mit19	PCR amplified length variant
D4Mit101	PCR amplified length variant
D4Mit2	PCR amplified length variant
D4Mit39	PCR amplified length variant
D4Mit4	PCR amplified length variant
D4Mit5	PCR amplified length variant
D4Mit23	PCR amplified length variant
D4Mit53	PCR amplified length variant
D4Mit55	PCR amplified length variant
D4Mit184	PCR amplified length variant
D4Mit164	PCR amplified length variant
D4Mit27	PCR amplified length variant
D4Mit77	PCR amplified length variant
D4Mit145	PCR amplified length variant
D4Mit9	PCR amplified length variant
D4Mit205	PCR amplified length variant
D4Mit28	PCR amplified length variant
D4Mit167	PCR amplified length variant
D4Mit31	PCR amplified length variant
D4Mit37	PCR amplified length variant
D4Mit11	PCR amplified length variant
D4Mit12	PCR amplified length variant
D4Nds2	PCR amplified length variant
D4Mit40	PCR amplified length variant
D4Mit16	PCR amplified length variant
D4Mit72	PCR amplified length variant
D4Mit70	PCR amplified length variant
D4Mit69	PCR amplified length variant
D4Mit54	PCR amplified length variant
D4Mit158	PCR amplified length variant
D4Mit66	PCR amplified length variant
D4Mit170	PCR amplified length variant
D4Mit13	PCR amplified length variant
D4Mit32	PCR amplified length variant
D4Mit126	PCR amplified length variant
D4Mit129	PCR amplified length variant
D4Mit130	PCR amplified length variant
D4Mit179	PCR amplified length variant
D4Mit42	PCR amplified length variant
D17Mit1009	PCR amplified length variant
D4Mit51	PCR amplified length variant
D4Mit3	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  O20/A x B10.O20/Dem
• Designation
  OcB
• Abbreviation 1
  O
• Abbreviation 2
  B

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	19	20
D4Mit19	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O
D4Mit101	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit2	O	.	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit39	O	.	O	B	O	B	O	O	O	.	O	.	O	O	O	B	O	O	.
D4Mit4	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit5	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit23	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O	O
D4Mit53	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit55	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	.	O	B	O	O	O
D4Mit184	O	O	O	B	B	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit164	O	O	O	B	O	B	O	O	O	.	.	O	O	O	O	O	O	O	.
D4Mit27	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit77	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit145	O	O	O	B	O	.	O	O	O	O	O	O	.	.	.	.	O	O	O
D4Mit9	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit205	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	X	O	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit28	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	Z	O	O	O
D4Mit167	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	.	.
D4Mit31	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	.	O	O
D4Mit37	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	.	O	O	O
D4Mit11	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	O	O	O	O	Z	O	O	O
D4Mit12	.	O	O	O	O	O	O	O	B	O	B	B	O	O	O	Z	O	O	O
D4Nds2	O	.	O	O	O	O	O	O	B	O	B	B	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit40	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	B	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit16	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	B	B	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit72	O	O	O	O	O	O	O	O	B	B	O	B	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit70	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	B	O	O	O
D4Mit69	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	Z	O	O	O
D4Mit54	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit158	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit66	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit170	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	.	O	O	O	O	O	O
D4Mit13	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit32	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit126	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit129	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit130	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit179	O	O	O	O	O	B	O	O	B	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O
D4Mit42	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	O	O	O
D17Mit1009	O	X	O	O	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	O	O	.
D4Mit51	O	B	O	O	O	O	O	O	O	B	O	O	O	O	B	B	.	O	.
D4Mit3	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	O	Z	.	O	.

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D4Mit19	D4Mit101	0	18	0.000	0.000
D4Mit101	D4Mit2	0	18	0.000	0.000
D4Mit2	D4Mit39	2	15	4.167	3.429
D4Mit39	D4Mit4	0	15	0.000	0.000
D4Mit4	D4Mit5	0	19	0.000	0.000
D4Mit5	D4Mit23	0	18	0.000	0.000
D4Mit23	D4Mit53	0	18	0.000	0.000
D4Mit53	D4Mit55	1	18	1.515	1.606
D4Mit55	D4Mit184	2	18	3.333	2.667
D4Mit184	D4Mit164	1	16	1.724	1.842
D4Mit164	D4Mit27	1	16	1.724	1.842
D4Mit27	D4Mit77	0	19	0.000	0.000
D4Mit77	D4Mit145	0	14	0.000	0.000
D4Mit145	D4Mit9	0	14	0.000	0.000
D4Mit9	D4Mit205	1	19	1.429	1.510
D4Mit205	D4Mit28	3	19	5.172	3.591
D4Mit28	D4Mit167	0	16	0.000	0.000
D4Mit167	D4Mit31	1	15	1.852	1.988
D4Mit31	D4Mit37	1	17	1.613	1.716
D4Mit37	D4Mit11	3	18	5.556	3.904
D4Mit11	D4Mit12	1	18	1.515	1.606
D4Mit12	D4Nds2	1	17	1.613	1.716
D4Nds2	D4Mit40	1	18	1.515	1.606
D4Mit40	D4Mit16	0	19	0.000	0.000
D4Mit16	D4Mit72	1	19	1.429	1.510
D4Mit72	D4Mit70	1	19	1.429	1.510
D4Mit70	D4Mit69	1	19	1.429	1.510
D4Mit69	D4Mit54	2	19	3.125	2.482
D4Mit54	D4Mit158	0	19	0.000	0.000
D4Mit158	D4Mit66	1	19	1.429	1.510
D4Mit66	D4Mit170	1	18	1.515	1.606
D4Mit170	D4Mit13	1	18	1.515	1.606
D4Mit13	D4Mit32	0	19	0.000	0.000
D4Mit32	D4Mit126	0	19	0.000	0.000
D4Mit126	D4Mit129	0	19	0.000	0.000
D4Mit129	D4Mit130	0	19	0.000	0.000
D4Mit130	D4Mit179	0	19	0.000	0.000
D4Mit179	D4Mit42	6	19	15.000	9.624
D4Mit42	D17Mit1009	5	18	11.905	7.756
D17Mit1009	D4Mit51	5	17	13.158	8.847
D4Mit51	D4Mit3	4	17	9.091	6.143