Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  15
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46500

Genes

Gene	Assay Type
D15Mit13	PCR amplified length variant
D15Mit125	PCR amplified length variant
D15Mit10	PCR amplified length variant
D15Mit11	PCR amplified length variant
D15Mit52	PCR amplified length variant
D15Nds2	PCR amplified length variant
D15Mit8	PCR amplified length variant
D15Mit6	PCR amplified length variant
D15Mit22	PCR amplified length variant
D15Mit5	PCR amplified length variant
D15Mit24	PCR amplified length variant
D15Mit121	PCR amplified length variant
D15Mit132	PCR amplified length variant
D15Mit17	PCR amplified length variant
D15Mit3	PCR amplified length variant
D15Mit123	PCR amplified length variant
D15Mit29	PCR amplified length variant
D15Mit1	PCR amplified length variant
D15Mit119	PCR amplified length variant
D15Mit33	PCR amplified length variant
D15Mit37	PCR amplified length variant
D15Mit74	PCR amplified length variant
D15Mit34	PCR amplified length variant
D15Mit108	PCR amplified length variant
D15Mit39	PCR amplified length variant
D15Mit41	PCR amplified length variant
D15Mit44	PCR amplified length variant
D15Mit43	PCR amplified length variant
D15Mit78	PCR amplified length variant
D15Mit14	PCR amplified length variant
D15Mit15	PCR amplified length variant
D15Mit16	PCR amplified length variant
D15Mit79	PCR amplified length variant
D15Mit40	PCR amplified length variant
D15Nds3	PCR amplified length variant
D15Nds5	PCR amplified length variant
D15Nds6	PCR amplified length variant
Gpd1	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  BALB/cHeA x STS/A
• Designation
  CcS
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
D15Mit13	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C
D15Mit125	C	C	C	C	C	C	C	.	C	.	C	.	.	.	.	.	S	.	C	C
D15Mit10	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit11	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit52	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Nds2	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit8	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit6	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit22	C	C	C	C	C	X	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit5	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit24	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D15Mit121	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	C	C	C	C
D15Mit132	C	C	C	S	C	C	C	C	C	.	C	S	C	S	C	.	C	C	C	C
D15Mit17	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	C	C	C	C
D15Mit3	C	C	C	S	C	C	C	C	.	C	C	S	C	.	C	C	C	C	C	C
D15Mit123	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	C	C	C	C
D15Mit29	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit1	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit119	C	C	C	X	.	C	C	C	C	C	C	X	C	S	C	C	C	C	C	C
D15Mit33	C	C	C	S	C	C	C	C	C	.	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C
D15Mit37	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	Z	C	C	C	C	C	C
D15Mit74	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.
D15Mit34	.	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit108	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit39	C	C	C	C	C	C	S	C	C	.	C	C	Z	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit41	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	Z	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit44	C	C	C	C	C	C	C	.	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit43	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit78	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit14	C	C	C	C	C	C	C	C	.	S	C	C	S	.	C	C	C	C	C	C
D15Mit15	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit16	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D15Mit79	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	.
D15Mit40	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D15Nds3	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	C	C	C	C
D15Nds5	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C
D15Nds6	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	.	.	C	C	C	C
Gpd1	Z	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C	C	C	C	C

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D15Mit13	D15Mit125	0	12	0.000	0.000
D15Mit125	D15Mit10	0	12	0.000	0.000
D15Mit10	D15Mit11	0	20	0.000	0.000
D15Mit11	D15Mit52	1	20	1.351	1.424
D15Mit52	D15Nds2	0	20	0.000	0.000
D15Nds2	D15Mit8	0	20	0.000	0.000
D15Mit8	D15Mit6	1	20	1.351	1.424
D15Mit6	D15Mit22	1	20	1.351	1.424
D15Mit22	D15Mit5	1	20	1.351	1.424
D15Mit5	D15Mit24	0	19	0.000	0.000
D15Mit24	D15Mit121	3	19	5.172	3.591
D15Mit121	D15Mit132	0	18	0.000	0.000
D15Mit132	D15Mit17	0	18	0.000	0.000
D15Mit17	D15Mit3	0	18	0.000	0.000
D15Mit3	D15Mit123	0	18	0.000	0.000
D15Mit123	D15Mit29	1	20	1.351	1.424
D15Mit29	D15Mit1	0	20	0.000	0.000
D15Mit1	D15Mit119	3	19	5.172	3.591
D15Mit119	D15Mit33	2	18	3.333	2.667
D15Mit33	D15Mit37	1	19	1.429	1.510
D15Mit37	D15Mit74	3	19	5.172	3.591
D15Mit74	D15Mit34	0	18	0.000	0.000
D15Mit34	D15Mit108	1	19	1.429	1.510
D15Mit108	D15Mit39	2	19	3.125	2.482
D15Mit39	D15Mit41	1	19	1.429	1.510
D15Mit41	D15Mit44	1	19	1.429	1.510
D15Mit44	D15Mit43	1	19	1.429	1.510
D15Mit43	D15Mit78	1	20	1.351	1.424
D15Mit78	D15Mit14	0	18	0.000	0.000
D15Mit14	D15Mit15	0	18	0.000	0.000
D15Mit15	D15Mit16	0	20	0.000	0.000
D15Mit16	D15Mit79	0	19	0.000	0.000
D15Mit79	D15Mit40	0	19	0.000	0.000
D15Mit40	D15Nds3	5	20	10.000	6.197
D15Nds3	D15Nds5	5	20	10.000	6.197
D15Nds5	D15Nds6	0	18	0.000	0.000
D15Nds6	Gpd1	1	18	1.515	1.606