Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  2
• Reference
  J:31555 Stassen AP, et al., Genetic composition of the recombinant congenic strains. Mamm Genome. 1996 Jan;7(1):55-8
• ID
  MGI:46487

Genes

Gene	Assay Type
D2Mit1	PCR amplified length variant
D2Mit115	PCR amplified length variant
D2Mit5	PCR amplified length variant
D2Mit4	PCR amplified length variant
D2Mit7	PCR amplified length variant
D2Mit156	PCR amplified length variant
D2Mit61	PCR amplified length variant
D2Mit9	PCR amplified length variant
D2Mit56	PCR amplified length variant
D2Mit11	PCR amplified length variant
D2Mit10	PCR amplified length variant
D2Mit35	PCR amplified length variant
D2Mit37	PCR amplified length variant
D2Mit158	PCR amplified length variant
D2Mit128	PCR amplified length variant
D2Mit66	PCR amplified length variant
D2Mit94	PCR amplified length variant
D2Mit160	PCR amplified length variant
D2Mit220	PCR amplified length variant
D2Mit248	PCR amplified length variant
D2Mit331	PCR amplified length variant
D2Mit332	PCR amplified length variant
D2Mit14a	PCR amplified length variant
D2Mit126	PCR amplified length variant
D2Mit272	PCR amplified length variant
D2Mit127	PCR amplified length variant
D2Nds1	PCR amplified length variant
D2Mit43	PCR amplified length variant
D2Mit13	PCR amplified length variant
D2Mit42	PCR amplified length variant
D2Mit44	PCR amplified length variant
D2Mit99	PCR amplified length variant
D2Mit130	PCR amplified length variant
D2Mit185	PCR amplified length variant
D2Mit186	PCR amplified length variant
D2Mit250	PCR amplified length variant
D2Mit252	PCR amplified length variant
D2Mit253	PCR amplified length variant
D2Mit303	PCR amplified length variant
D2Mit333	PCR amplified length variant
D2Mit350	PCR amplified length variant
D2Mit58	PCR amplified length variant
D2Mit162	PCR amplified length variant
D2Mit101	PCR amplified length variant
D2Mit102	PCR amplified length variant
D2Mit17	PCR amplified length variant
D2Nds3	PCR amplified length variant
D2Mit55	PCR amplified length variant
D2Mit49	PCR amplified length variant
D2Mit50	PCR amplified length variant
D2Mit51	PCR amplified length variant
D2Mit227	PCR amplified length variant
D2Mit52	PCR amplified length variant
D2Mit74	PCR amplified length variant
Hc	PCR amplified length variant
Cd44	PCR amplified length variant
Cat	PCR amplified length variant
Fshb	PCR amplified length variant
B2m	PCR amplified length variant
Mpmv28	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  D3Mit371 mapped on Chromosome 3 in this reference has since been withdrawn to equal D5Mit123 on Chromosome 5.

RI

• Origin
  BALB/cHeA x STS/A
• Designation
  CcS
• Abbreviation 1
  C
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20
D2Mit1	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	Z	C	C	C	C	C	C
D2Mit115	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
D2Mit5	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C
D2Mit4	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C
D2Mit7	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	.	C	C	C	C	S	C
D2Mit156	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.
D2Mit61	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	S	C
D2Mit9	.	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	S	C
D2Mit56	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D2Mit11	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	S	C	C	C
D2Mit10	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C
D2Mit35	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	C	S	C	C	C
D2Mit37	C	C	C	.	C	C	C	C	C	S	C	C	C	C	C	.	S	C	C	C
D2Mit158	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit128	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit66	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit94	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	.
D2Mit160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.
D2Mit220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.
D2Mit248	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit331	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit332	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit14a	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit126	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	.
D2Mit272	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C
D2Mit127	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	.
D2Nds1	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	.
D2Mit43	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit13	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit42	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit44	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.
D2Mit99	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit130	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit185	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit186	C	C	C	C	C	C	C	C	C	X	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit250	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit252	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.
D2Mit253	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	.	S	C	S	C
D2Mit303	C	.	.	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	.	S	C	S	C
D2Mit333	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit350	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit58	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit162	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit101	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit102	C	C	.	C	.	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit17	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	S	C	S	C
D2Nds3	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C	S	C	C	S	C
D2Mit55	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
D2Mit49	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C
D2Mit50	C	C	C	C	C	C	C	.	.	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C
D2Mit51	C	C	C	C	C	C	C	.	.	C	C	C	C	C	C	S	S	C	C	C
D2Mit227	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	S	C	C	C	S
D2Mit52	C	C	C	C	C	C	C	.	C	C	C	C	C	C	C	S	C	.	C	S
D2Mit74	C	C	C	C	C	C	.	.	.	.	.	C	C	C	C	C	C	C	C	S
Hc	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	C
Cd44	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
Cat	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
Fshb	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
B2m	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C
Mpmv28	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C	S	S	C	S	C

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit1	D2Mit115	0	19	0.000	0.000
D2Mit115	D2Mit5	1	20	1.351	1.424
D2Mit5	D2Mit4	0	20	0.000	0.000
D2Mit4	D2Mit7	1	18	1.515	1.606
D2Mit7	D2Mit156	0	1	0.000	0.000
D2Mit156	D2Mit61	0	1	0.000	0.000
D2Mit61	D2Mit9	0	18	0.000	0.000
D2Mit9	D2Mit56	2	18	3.333	2.667
D2Mit56	D2Mit11	0	20	0.000	0.000
D2Mit11	D2Mit10	2	20	2.941	2.321
D2Mit10	D2Mit35	0	20	0.000	0.000
D2Mit35	D2Mit37	0	18	0.000	0.000
D2Mit37	D2Mit158	2	18	3.333	2.667
D2Mit158	D2Mit128	1	19	1.429	1.510
D2Mit128	D2Mit66	1	19	1.429	1.510
D2Mit66	D2Mit94	0	19	0.000	0.000
D2Mit94	D2Mit160	0	1	0.000	0.000
D2Mit160	D2Mit220	0	1	0.000	0.000
D2Mit220	D2Mit248	0	1	0.000	0.000
D2Mit248	D2Mit331	0	20	0.000	0.000
D2Mit331	D2Mit332	0	19	0.000	0.000
D2Mit332	D2Mit14a	0	19	0.000	0.000
D2Mit14a	D2Mit126	0	19	0.000	0.000
D2Mit126	D2Mit272	0	18	0.000	0.000
D2Mit272	D2Mit127	1	18	1.515	1.606
D2Mit127	D2Nds1	0	19	0.000	0.000
D2Nds1	D2Mit43	0	19	0.000	0.000
D2Mit43	D2Mit13	0	20	0.000	0.000
D2Mit13	D2Mit42	0	20	0.000	0.000
D2Mit42	D2Mit44	0	1	0.000	0.000
D2Mit44	D2Mit99	0	1	0.000	0.000
D2Mit99	D2Mit130	0	20	0.000	0.000
D2Mit130	D2Mit185	0	20	0.000	0.000
D2Mit185	D2Mit186	0	19	0.000	0.000
D2Mit186	D2Mit250	0	19	0.000	0.000
D2Mit250	D2Mit252	0	1	0.000	0.000
D2Mit252	D2Mit253	0	1	0.000	0.000
D2Mit253	D2Mit303	0	15	0.000	0.000
D2Mit303	D2Mit333	0	16	0.000	0.000
D2Mit333	D2Mit350	0	20	0.000	0.000
D2Mit350	D2Mit58	0	20	0.000	0.000
D2Mit58	D2Mit162	0	20	0.000	0.000
D2Mit162	D2Mit101	0	20	0.000	0.000
D2Mit101	D2Mit102	0	18	0.000	0.000
D2Mit102	D2Mit17	1	18	1.515	1.606
D2Mit17	D2Nds3	1	20	1.351	1.424
D2Nds3	D2Mit55	2	20	2.941	2.321
D2Mit55	D2Mit49	1	20	1.351	1.424
D2Mit49	D2Mit50	0	18	0.000	0.000
D2Mit50	D2Mit51	0	18	0.000	0.000
D2Mit51	D2Mit227	2	17	3.571	2.881
D2Mit227	D2Mit52	0	17	0.000	0.000
D2Mit52	D2Mit74	1	14	2.000	2.159
D2Mit74	Hc	2	15	4.167	3.429
Hc	Cd44	2	20	2.941	2.321
Cd44	Cat	0	20	0.000	0.000
Cat	Fshb	0	20	0.000	0.000
Fshb	B2m	0	20	0.000	0.000
B2m	Mpmv28	0	20	0.000	0.000