Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  19
• Reference
  J:18648 O'Brien EP, et al., Molecular map of chromosome 19 including three genes affecting bleeding time: ep, ru, and bm. Mamm Genome. 1994 Jun;5(6):356-60
• ID
  MGI:43565

Genes

Gene	Assay Type	Description
D19Mit30	PCR amplified length variant
Papss2	visible phenotype
D19Mit5	PCR amplified length variant
His2	Southern analysis	His-2
Rbp4	Southern analysis	pRbp-2
Dntt	Southern analysis	TDT
D19Mit11.1	PCR amplified length variant
Hps1	visible phenotype
D19Mit24	PCR amplified length variant
D19Mit27	PCR amplified length variant
D19Mit17	PCR amplified length variant
Hps6	visible phenotype
D19Umi1	PCR amplified length variant	D19Umi1-pA, D19Umi1-pB
Cyp17a1	Southern analysis	P450-17(alpha) cDNA
D19Mit9	PCR amplified length variant
D19Mit10	PCR amplified length variant
D19Mit38	PCR amplified length variant
D19Mit8	PCR amplified length variant
D19Mit4	PCR amplified length variant
D19Mit7	PCR amplified length variant
D19Mit3	PCR amplified length variant
D19Mit1	PCR amplified length variant
Adrb1	Southern analysis	B-1

Notes

• Experiment
  F1 direction known.
  

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>/<w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>
• Strain
  (B6C3FeF1-Papss2 Hps1 Hps6/Papss2 Hps1 Hps6 x PWK)F1
• Male Parent
  <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>/<c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>
• Strain
  B6C3FeF1-Papss2 Hps1 Hps6/Papss2 Hps1 Hps6
• Allele 1
  c from B6C3FeF1-Papss2 Hps1 Hps6/Papss2 Hps1 Hps6
• Allele 2
  w from PWK

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D19Mit30	Papss2	20	411
Papss2	D19Mit5	14	443
D19Mit5	His2	1	455
His2	Rbp4	8	448
Rbp4	Dntt	9	447
Dntt	D19Mit11.1	9	448
D19Mit11.1	Hps1	2	455
Hps1	D19Mit24	5	452
D19Mit24	D19Mit27	0	457
D19Mit27	D19Mit17	0	457
D19Mit17	Hps6	1	456
Hps6	D19Umi1	0	457
D19Umi1	Cyp17a1	1	456
Cyp17a1	D19Mit9	4	453
D19Mit9	D19Mit10	0	148
D19Mit10	D19Mit38	0	141
D19Mit38	D19Mit8	0	140
D19Mit8	D19Mit4	1	122
D19Mit4	D19Mit7	0	120
D19Mit7	D19Mit3	0	116
D19Mit3	D19Mit1	3	112
D19Mit1	Adrb1	1	41

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D19Mit30	Papss2	20	431	4.640	1.013
Papss2	D19Mit5	14	457	3.063	0.806
D19Mit5	His2	1	456	0.219	0.219
His2	Rbp4	8	456	1.754	0.615
Rbp4	Dntt	9	456	1.974	0.651
Dntt	D19Mit11.1	9	457	1.969	0.650
D19Mit11.1	Hps1	2	457	0.438	0.309
Hps1	D19Mit24	5	457	1.094	0.487
D19Mit24	D19Mit27	0	457	0.000	0.000
D19Mit27	D19Mit17	0	457	0.000	0.000
D19Mit17	Hps6	1	457	0.219	0.219
Hps6	D19Umi1	0	457	0.000	0.000
D19Umi1	Cyp17a1	1	457	0.219	0.219
Cyp17a1	D19Mit9	4	457	0.875	0.436
D19Mit9	D19Mit10	0	148	0.000	0.000
D19Mit10	D19Mit38	0	141	0.000	0.000
D19Mit38	D19Mit8	0	140	0.000	0.000
D19Mit8	D19Mit4	1	123	0.813	0.810
D19Mit4	D19Mit7	0	120	0.000	0.000
D19Mit7	D19Mit3	0	116	0.000	0.000
D19Mit3	D19Mit1	3	115	2.609	1.486
D19Mit1	Adrb1	1	42	2.381	2.352