Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  19
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352437

Genes

Gene	Assay Type	Description
D19Rik53	RLGS	NaSM140
D19Rik54	RLGS	NaA172
D19Rik55	RLGS	NaSM85
D19Rik56	RLGS	NaA61
D19Rik57	RLGS	NaSM47
D19Rik58	RLGS	NaA50
D19Rik59	RLGS	NdSM84
D19Rik60	RLGS	NaA18
D19Mit46
D19Rik61	RLGS	NaSM188
D19Rik62	RLGS	NaA162
D19Rik63	RLGS	NdSM160
D19Rik64	RLGS	NdA117
D19Rik65	RLGS	NdSM60
D19Rik66	RLGS	NdA39
D19Rik67	RLGS	NdA161
D19Rik68	RLGS	NaA206
D19Rik69	RLGS	NdA136
D19Rik70	RLGS	NaSM67
D19Rik71	RLGS	NaA66
D19Rik72	RLGS	NdA153

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D19Rik53	A	S	S	A	A	S	A	A	S	A	S	S	A	A	S	A	A	.	A	.	S	A	S	A	A	A	S	A
D19Rik54	A	S	S	A	A	S	A	A	S	A	S	S	A	A	S	A	A	.	A	.	S	A	S	A	A	A	S	A
D19Rik55	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	A	A	.	A	.	S	A	S	A	A	A	A	A
D19Rik56	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	A	A	.	A	.	S	A	S	A	A	A	A	A
D19Rik57	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	A	A	.	A	.	S	A	S	A	A	A	A	A
D19Rik58	A	S	S	A	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	A	A	.	A	.	A	A	S	S	A	A	A	A
D19Rik59	A	A	A	A	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	S	A	A	S
D19Rik60	A	A	A	A	S	A	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	A	.	A	.	A	A	S	S	S	A	A	S
D19Mit46	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	S	A	A	A	A	A	.	A	.	A	A	S	S	S	S	A	A
D19Rik61	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	.	A	A
D19Rik62	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	.	A	A
D19Rik63	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	A	A	A
D19Rik64	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	A	A	A
D19Rik65	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	A	A	A
D19Rik66	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	A	A	A
D19Rik67	A	A	S	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	A	A	A
D19Rik68	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	S	S	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	A	A
D19Rik69	A	A	S	S	A	A	S	A	A	A	S	S	S	A	A	A	S	.	S	.	S	A	S	S	S	S	A	A
D19Rik70	S	A	A	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	S	A	A	S	.	S	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D19Rik71	S	A	A	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	S	A	A	S	.	S	.	S	S	S	S	S	S	A	A
D19Rik72	S	A	A	S	A	A	S	A	S	A	S	S	A	S	A	A	S	.	S	.	S	S	S	S	S	S	A	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D19Rik53	D19Rik54	0	26	0.000	0.000
D19Rik54	D19Rik55	3	26	3.488	2.291
D19Rik55	D19Rik56	0	26	0.000	0.000
D19Rik56	D19Rik57	0	26	0.000	0.000
D19Rik57	D19Rik58	2	26	2.174	1.670
D19Rik58	D19Rik59	6	26	8.824	4.832
D19Rik59	D19Rik60	0	26	0.000	0.000
D19Rik60	D19Mit46	8	26	14.286	7.805
D19Mit46	D19Rik61	4	25	5.263	3.174
D19Rik61	D19Rik62	0	25	0.000	0.000
D19Rik62	D19Rik63	0	25	0.000	0.000
D19Rik63	D19Rik64	0	26	0.000	0.000
D19Rik64	D19Rik65	0	26	0.000	0.000
D19Rik65	D19Rik66	0	26	0.000	0.000
D19Rik66	D19Rik67	0	26	0.000	0.000
D19Rik67	D19Rik68	3	26	3.488	2.291
D19Rik68	D19Rik69	0	26	0.000	0.000
D19Rik69	D19Rik70	6	26	8.824	4.832
D19Rik70	D19Rik71	0	26	0.000	0.000
D19Rik71	D19Rik72	0	26	0.000	0.000