Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  17
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352428

Genes

Gene	Assay Type	Description
D17Rik58	RLGS	NaSM96
D17Rik59	RLGS	NaA104
D17Rik60	RLGS	NdSM65
D17Rik61	RLGS	NdA43
D17Rik62	RLGS	NdSM137
D17Rik63	RLGS	NdA94
D17Rik64	RLGS	NdA122
D17Rik65	RLGS	NdA175
D17Rik66	RLGS	NaSM38
D17Rik67	RLGS	NdSM173
D17Rik68	RLGS	NdSM235
D17Rik69	RLGS	NdA190
D17Rik70	RLGS	NaSM144
D17Rik71	RLGS	NaA107
D17Rik72	RLGS	NaSM15
D17Rik73	RLGS	NaA15
D17Rik74	RLGS	NdSM192
D17Rik75	RLGS	NdA140
D17Rik76	RLGS	NaA141
D17Rik77	RLGS	NaA174
D17Rik78	RLGS	NdA71
D17Rik79	RLGS	NaSM129
D17Rik80	RLGS	NaSM120
D17Rik81	RLGS	NaA153
D17Rik82	RLGS	NaSM148
D17Rik83	RLGS	NaSM49
D17Rik84	RLGS	NdA68
D17Rik85	RLGS	NaA55
D17Rik86	RLGS	NdSM221
D17Rik87	RLGS	NaA165
D17Rik88	RLGS	NaSM37
D17Rik89	RLGS	NaSM94
D17Rik90	RLGS	NaA99
D17Rik91	RLGS	NaSM17
D17Rik92	RLGS	NaA42
D17Rik93	RLGS	NdA135
D17Rik94	RLGS	NdSM236
D17Rik95	RLGS	NdA182
D17Rik96	RLGS	NdSM189
D17Rik97	RLGS	NaA163
D17Rik98	RLGS	NaSM25
D17Rik99	RLGS	NaA27

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D17Rik58	S	A	S	A	.	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik59	S	A	S	A	.	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik60	S	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik61	S	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik62	S	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik63	S	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik64	S	A	A	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik65	S	A	A	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik66	S	A	A	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik67	S	A	A	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik68	S	A	A	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik69	S	A	A	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik70	A	A	A	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik71	A	A	A	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	S
D17Rik72	A	A	A	.	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik73	A	A	A	.	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik74	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik75	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik76	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	S	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik77	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	S	A	S	A	A	.	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik78	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	S	A	S	A	A	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik79	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik80	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	.	S	A
D17Rik81	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	.	S	A
D17Rik82	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik83	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik84	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik85	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	S	S	S	S	A
D17Rik86	A	A	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik87	A	A	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	S	S	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik88	A	A	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	S	S	A
D17Rik89	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	.	S	A
D17Rik90	A	A	S	A	A	S	S	S	A	A	A	A	S	A	S	S	S	.	A	.	A	A	A	A	S	.	S	A
D17Rik91	A	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	S
D17Rik92	A	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	S
D17Rik93	A	S	S	A	A	S	S	A	A	A	A	A	S	A	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	S
D17Rik94	A	S	S	A	S	A	S	A	A	A	S	S	S	A	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	S
D17Rik95	A	S	S	A	S	A	S	A	A	A	S	S	S	A	A	S	A	.	A	.	A	A	A	A	A	A	A	S
D17Rik96	S	S	A	A	S	A	S	A	A	A	S	S	S	S	A	A	A	.	A	.	A	A	A	A	S	A	A	S
D17Rik97	S	S	A	A	S	A	S	A	S	A	S	S	S	S	S	A	S	.	A	.	A	S	A	S	A	.	A	S
D17Rik98	S	S	A	A	S	S	S	A	S	A	S	S	S	.	S	A	S	.	S	.	A	.	A	S	A	A	A	S
D17Rik99	S	S	A	A	S	S	S	A	S	A	S	S	S	.	S	A	S	.	S	.	A	.	A	S	A	A	A	S

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D17Rik58	D17Rik59	0	25	0.000	0.000
D17Rik59	D17Rik60	0	25	0.000	0.000
D17Rik60	D17Rik61	0	26	0.000	0.000
D17Rik61	D17Rik62	0	26	0.000	0.000
D17Rik62	D17Rik63	0	26	0.000	0.000
D17Rik63	D17Rik64	1	26	1.020	1.062
D17Rik64	D17Rik65	0	26	0.000	0.000
D17Rik65	D17Rik66	1	26	1.020	1.062
D17Rik66	D17Rik67	0	26	0.000	0.000
D17Rik67	D17Rik68	0	26	0.000	0.000
D17Rik68	D17Rik69	0	26	0.000	0.000
D17Rik69	D17Rik70	2	26	2.174	1.670
D17Rik70	D17Rik71	0	26	0.000	0.000
D17Rik71	D17Rik72	1	25	1.064	1.109
D17Rik72	D17Rik73	0	25	0.000	0.000
D17Rik73	D17Rik74	1	25	1.064	1.109
D17Rik74	D17Rik75	0	26	0.000	0.000
D17Rik75	D17Rik76	1	26	1.020	1.062
D17Rik76	D17Rik77	0	25	0.000	0.000
D17Rik77	D17Rik78	0	25	0.000	0.000
D17Rik78	D17Rik79	2	26	2.174	1.670
D17Rik79	D17Rik80	0	25	0.000	0.000
D17Rik80	D17Rik81	0	25	0.000	0.000
D17Rik81	D17Rik82	0	25	0.000	0.000
D17Rik82	D17Rik83	0	26	0.000	0.000
D17Rik83	D17Rik84	0	26	0.000	0.000
D17Rik84	D17Rik85	1	26	1.020	1.062
D17Rik85	D17Rik86	3	26	3.488	2.291
D17Rik86	D17Rik87	0	26	0.000	0.000
D17Rik87	D17Rik88	1	26	1.020	1.062
D17Rik88	D17Rik89	1	25	1.064	1.109
D17Rik89	D17Rik90	0	25	0.000	0.000
D17Rik90	D17Rik91	7	25	12.069	6.674
D17Rik91	D17Rik92	0	26	0.000	0.000
D17Rik92	D17Rik93	0	26	0.000	0.000
D17Rik93	D17Rik94	4	26	5.000	2.990
D17Rik94	D17Rik95	0	26	0.000	0.000
D17Rik95	D17Rik96	5	26	6.757	3.817
D17Rik96	D17Rik97	6	25	9.375	5.213
D17Rik97	D17Rik98	2	23	2.500	1.943
D17Rik98	D17Rik99	0	24	0.000	0.000