Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  13
• Reference
  J:49605 Mori M, et al., Genetic profile of the SMXA recombinant inbred mouse strains revealed with restriction landmark genomic scanning. Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):695-709
• ID
  MGI:1352420

Genes

Gene	Assay Type	Description
D13Rik67	RLGS	NaSM112
D13Rik68	RLGS	NaA126
D13Rik69	RLGS	NaSM122
D13Rik70	RLGS	NaSM154
D13Rik71	RLGS	NaSM7
D13Rik72	RLGS	NaA2
D13Rik73	RLGS	NdA202
D13Mit18
D13Rik74	RLGS	NdA209
D13Rik75	RLGS	NaA44
D13Rik76	RLGS	NaSM119
D13Rik77	RLGS	NaA134
D13Rik78	RLGS	NaSM143
D13Mit19
D13Mit34
D13Rik79	RLGS	NaSM169
D13Rik80	RLGS	NaA193
D13Rik81	RLGS	NdSM43
D13Rik82	RLGS	NdA100
D13Rik83	RLGS	NdSM149
D13Rik84	RLGS	NdA110
D13Rik85	RLGS	NaSM98
D13Rik86	RLGS	NaA108
D13Rik87	RLGS	NdSM182
D13Rik88	RLGS	NdA133
D13Rik89	RLGS	NaA199
D13Rik90	RLGS	NdA61
D13Rik91	RLGS	NaSM54
D13Rik92	RLGS	NaA20
D13Rik93	RLGS	NaSM18
D13Rik94	RLGS	NaA23
D13Rik95	RLGS	NaSM177
D13Rik96	RLGS	NaA116
D13Rik97	RLGS	NdSM247
D13Rik98	RLGS	NdA160
D13Rik99	RLGS	NdA186
D13Rik100	RLGS	NdSM82
D13Rik101	RLGS	NdA60
D13Mit35
D13Rik102	RLGS	NaSM121
D13Rik103	RLGS	NaSM19

RI

• Origin
  SM/J x A/J
• Designation
  SMXA
• Abbreviation 1
  A
• Abbreviation 2
  S

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	14	15	16	17	18	19	20	21	21d	22	23	24	25	26	27	29	30
D13Rik67	S	S	S	S	S	S	A	S	A	S	S	S	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	A
D13Rik68	S	S	S	S	S	S	A	S	A	S	S	S	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	A
D13Rik69	S	S	S	S	S	S	A	S	A	S	S	S	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	A
D13Rik70	S	A	S	S	S	S	S	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	S
D13Rik71	S	A	S	S	S	S	S	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	S
D13Rik72	S	A	S	S	S	S	S	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	S
D13Rik73	S	A	S	S	S	S	S	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	A	S	S
D13Mit18	S	A	S	S	S	S	S	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	S	S	S	S	S
D13Rik74	S	A	S	S	S	S	S	S	S	.	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	S	S	S
D13Rik75	S	A	S	S	S	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	S	A	A	A	S	S	S	S
D13Rik76	S	A	S	S	S	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	A	A	A	A	A	.	S	S
D13Rik77	S	A	S	S	S	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	A	A	A	A	A	.	S	S
D13Rik78	S	A	S	S	S	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	A	A	A	A	A	S	S	S
D13Mit19	S	A	S	S	S	S	A	S	A	S	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	A	A	A	S	A	S	S	S
D13Mit34	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	S	.	A	A	A	S	A	S	S	A
D13Rik79	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	A	A	A	S	A	S	S	A
D13Rik80	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	A	A	A	S	A	S	S	A
D13Rik81	S	A	S	.	S	S	A	A	A	A	S	A	A	.	S	S	.	.	.	.	A	S	A	S	A	S	.	A
D13Rik82	S	A	S	S	A	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	A	S	A	S	A	S	S	A
D13Rik83	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	A	A	A	S	A	A	S	A
D13Rik84	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	A	A	A	S	A	A	S	A
D13Rik85	S	A	S	S	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	S	A	.	A	.	A	A	A	S	A	A	S	A
D13Rik86	S	A	S	.	S	S	A	A	A	A	S	A	A	S	S	A	A	.	A	.	A	S	A	S	A	S	S	A
D13Rik87	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	A	A	.	A	.	A	S	A	S	A	S	S	A
D13Rik88	S	A	S	S	S	S	S	A	A	A	S	S	A	S	S	A	A	.	A	.	A	S	A	S	A	S	S	A
D13Rik89	S	A	S	A	A	S	S	S	A	A	S	S	A	A	S	A	A	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik90	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	A	A	A	S	A
D13Rik91	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik92	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	.	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik93	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik94	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik95	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik96	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik97	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik98	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik99	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	A	A	S	A
D13Rik100	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	A	A	A	S	A
D13Rik101	S	A	S	A	A	S	S	S	S	S	A	S	A	A	S	A	.	.	S	.	A	S	S	A	A	A	S	A
D13Mit35	S	A	S	A	A	S	A	S	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	S	A	A	A
D13Rik102	S	A	S	A	A	S	A	S	A	A	A	S	A	A	S	A	S	.	S	.	A	S	S	S	S	.	A	A
D13Rik103	S	A	.	A	A	S	A	S	A	A	S	S	A	A	A	A	S	.	S	.	A	A	S	S	S	A	A	A

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D13Rik67	D13Rik68	0	26	0.000	0.000
D13Rik68	D13Rik69	0	26	0.000	0.000
D13Rik69	D13Rik70	4	26	5.000	2.990
D13Rik70	D13Rik71	0	26	0.000	0.000
D13Rik71	D13Rik72	0	26	0.000	0.000
D13Rik72	D13Rik73	0	26	0.000	0.000
D13Rik73	D13Mit18	2	26	2.174	1.670
D13Mit18	D13Rik74	2	25	2.273	1.752
D13Rik74	D13Rik75	2	25	2.273	1.752
D13Rik75	D13Rik76	2	25	2.273	1.752
D13Rik76	D13Rik77	0	25	0.000	0.000
D13Rik77	D13Rik78	0	25	0.000	0.000
D13Rik78	D13Mit19	1	26	1.020	1.062
D13Mit19	D13Mit34	3	26	3.488	2.291
D13Mit34	D13Rik79	1	26	1.020	1.062
D13Rik79	D13Rik80	0	26	0.000	0.000
D13Rik80	D13Rik81	1	21	1.282	1.347
D13Rik81	D13Rik82	1	21	1.282	1.347
D13Rik82	D13Rik83	3	26	3.488	2.291
D13Rik83	D13Rik84	0	26	0.000	0.000
D13Rik84	D13Rik85	0	26	0.000	0.000
D13Rik85	D13Rik86	3	25	3.659	2.416
D13Rik86	D13Rik87	2	25	2.273	1.752
D13Rik87	D13Rik88	0	26	0.000	0.000
D13Rik88	D13Rik89	7	26	11.290	6.119
D13Rik89	D13Rik90	5	26	6.757	3.817
D13Rik90	D13Rik91	1	26	1.020	1.062
D13Rik91	D13Rik92	0	25	0.000	0.000
D13Rik92	D13Rik93	0	25	0.000	0.000
D13Rik93	D13Rik94	0	26	0.000	0.000
D13Rik94	D13Rik95	0	26	0.000	0.000
D13Rik95	D13Rik96	0	26	0.000	0.000
D13Rik96	D13Rik97	0	26	0.000	0.000
D13Rik97	D13Rik98	0	26	0.000	0.000
D13Rik98	D13Rik99	0	26	0.000	0.000
D13Rik99	D13Rik100	1	26	1.020	1.062
D13Rik100	D13Rik101	0	25	0.000	0.000
D13Rik101	D13Mit35	6	25	9.375	5.213
D13Mit35	D13Rik102	0	25	0.000	0.000
D13Rik102	D13Rik103	3	24	3.846	2.557