Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  13
• Reference
  J:38409 Beckers MC, et al., High-resolution linkage map of mouse chromosome 13 in the vicinity of the host resistance locus Lgn1. Genomics. 1997 Feb 1;39(3):254-63
• ID
  MGI:1349167

Genes

Gene	Assay Type	Description
D13Hun34	reported elsewhere
D13Hun33	reported elsewhere
D13Mit128	PCR amplified length variant
D13Mit194	PCR amplified length variant
D13Hun35	PCR amplified length variant
Map1b	Southern analysis	MAP1B
D13Gor4	reported elsewhere
D13Mit30	PCR amplified length variant
D13Mit72	PCR amplified length variant
D13Mit195	PCR amplified length variant
D13Mit203	PCR amplified length variant
D13Mit146	PCR amplified length variant
D13Mit37	PCR amplified length variant
D13Mit70	PCR amplified length variant

Notes

• Reference
  Authors use Htr1 for locus symbol Htr1a.
• Experiment
  Offspring types indicate alleles inherited from F1 parent.
  

CROSS

• Type
  Backcross, male
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
• Strain
  (C57BL/6J x M. spretus)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  C57BL/6J
• Allele 1
  b from C57BL/6J
• Allele 2
  s from M. spretus

CROSS Data

MC #mice	D13Hun34	D13Hun33	D13Mit128	D13Mit194	D13Hun35	Map1b	D13Gor4	D13Mit30	D13Mit72	D13Mit195	D13Mit203	D13Mit146	D13Mit37	D13Mit70
120	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b
155	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s
3	b	b	b	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s
1	s	s	s	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b	b
1	b	b	b	b	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s
1	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	s	b

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D13Hun34	D13Hun33	0	281	0.000	0.000
D13Hun33	D13Mit128	0	281	0.000	0.000
D13Mit128	D13Mit194	4	281	1.423	0.707
D13Mit194	D13Hun35	1	281	0.356	0.355
D13Hun35	Map1b	0	281	0.000	0.000
Map1b	D13Gor4	0	281	0.000	0.000
D13Gor4	D13Mit30	0	281	0.000	0.000
D13Mit30	D13Mit72	0	281	0.000	0.000
D13Mit72	D13Mit195	0	281	0.000	0.000
D13Mit195	D13Mit203	0	281	0.000	0.000
D13Mit203	D13Mit146	0	281	0.000	0.000
D13Mit146	D13Mit37	0	281	0.000	0.000
D13Mit37	D13Mit70	1	281	0.356	0.355