Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  13
• Reference
  J:49829 Taylor BA, et al., Genotyping new BXD recombinant inbred mouse strains and comparison of BXD and consensus maps. Mamm Genome. 1999 Apr;10(4):335-48
• ID
  MGI:1343310

Genes

Gene	Assay Type
D13Mit57	PCR amplified length variant
D13Mit18	PCR amplified length variant
D13Mit63	PCR amplified length variant
D13Mit91	PCR amplified length variant
D13Mit248	PCR amplified length variant
D13Mit224	PCR amplified length variant
D13Mit126	PCR amplified length variant
D13Mit145	PCR amplified length variant
D13Mit148	PCR amplified length variant
D13Mit151	PCR amplified length variant
D13Mit35	PCR amplified length variant

RI

• Origin
  C57BL/6J x DBA/2J
• Designation
  BXD
• Abbreviation 1
  B
• Abbreviation 2
  D

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	5	6	8	9	11	12	13	14	15	16	18	19	20	21	22	23	24	25	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
D13Mit57	D	B	B	B	B	B	B	D	D	D	B	B	D	B	B	B	B	D	B	D	B	B	D	D	B	D	B	B	D	D	D	B	D	B	D	B
D13Mit18	B	D	D	.	B	B	D	D	D	D	B	B	D	B	D	B	B	D	B	D	D	D	B	D	B	D	D	B	D	D	D	B	D	B	D	B
D13Mit63	B	D	D	B	B	B	D	D	D	B	B	B	D	B	B	B	B	B	B	D	D	D	B	D	B	D	D	B	D	D	D	B	D	B	D	B
D13Mit91	B	D	D	B	B	D	D	D	D	B	D	D	B	B	B	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	D	B	D	B	D	B
D13Mit248	B	D	B	D	B	D	D	D	D	B	B	D	B	B	D	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	D	B	D	B	B	B
D13Mit224	B	D	B	D	B	D	D	D	D	D	B	D	B	B	D	D	B	D	D	D	D	D	B	D	D	D	D	B	B	D	D	B	D	B	B	B
D13Mit126	D	D	B	B	B	D	D	D	D	D	D	D	B	B	D	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	B	D	D	B	B
D13Mit145	D	D	B	B	B	D	D	D	D	D	D	D	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	B	D	D	D	D	B	D	D	D	B	B	B	B	B
D13Mit148	D	B	B	D	B	D	D	D	B	D	B	D	B	D	D	D	D	D	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D	B	B	B	B	D
D13Mit151	B	B	D	D	B	D	D	B	B	B	B	D	B	B	D	B	D	D	D	B	B	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D	B	B	B	B	D
D13Mit35	D	B	D	D	D	D	D	D	B	B	B	D	B	B	D	B	D	D	D	B	B	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D	B	B	B	B	D

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D13Mit57	D13Mit18	9	35	10.465	4.894
D13Mit18	D13Mit63	3	35	2.459	1.558
D13Mit63	D13Mit91	8	36	8.333	3.898
D13Mit91	D13Mit248	5	36	4.386	2.299
D13Mit248	D13Mit224	4	36	3.333	1.886
D13Mit224	D13Mit126	6	36	5.556	2.761
D13Mit126	D13Mit145	3	36	2.381	1.504
D13Mit145	D13Mit148	7	36	6.863	3.287
D13Mit148	D13Mit151	7	36	6.863	3.287
D13Mit151	D13Mit35	4	36	3.333	1.886