Mapping Data

Experiment

• Experiment
  RI
• Chromosome
  11
• Reference
  J:49829 Taylor BA, et al., Genotyping new BXD recombinant inbred mouse strains and comparison of BXD and consensus maps. Mamm Genome. 1999 Apr;10(4):335-48
• ID
  MGI:1343308

Genes

Gene	Assay Type
D11Mit62	PCR amplified length variant
D11Mit78	PCR amplified length variant
D11Mit79	PCR amplified length variant
D11Mit19	PCR amplified length variant
D11Mit296	PCR amplified length variant
D11Mit20	PCR amplified length variant
D11Mit140	PCR amplified length variant
D11Mit157	PCR amplified length variant
D11Mit4	PCR amplified length variant
D11Mit5	PCR amplified length variant
D11Mit219	PCR amplified length variant
D11Mit194	PCR amplified length variant
D11Mit178	PCR amplified length variant
D11Mit36	PCR amplified length variant
D11Mit41	PCR amplified length variant
D11Mit38	PCR amplified length variant
D11Mit179	PCR amplified length variant
D11Mit99	PCR amplified length variant
D11Mit258	PCR amplified length variant
D11Mit338	PCR amplified length variant
D11Mit337	PCR amplified length variant
Es3	PCR amplified length variant

RI

• Origin
  C57BL/6J x DBA/2J
• Designation
  BXD
• Abbreviation 1
  B
• Abbreviation 2
  D

RI Data (columns show RI Lines sampled)

Marker	1	2	5	6	8	9	11	12	13	14	15	16	18	19	20	21	22	23	24	25	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
D11Mit62	B	B	B	D	B	D	B	B	D	D	B	B	D	B	D	B	B	B	D	B	D	D	D	B	D	D	B	B	D	B	D	D	B	B	D	D
D11Mit78	B	B	B	D	B	D	B	B	D	D	D	B	D	B	D	B	B	D	D	B	D	D	D	B	D	D	B	B	D	B	B	D	B	B	D	D
D11Mit79	B	D	B	D	B	D	B	B	D	D	D	B	D	B	D	B	B	D	D	B	D	D	D	D	D	D	B	B	D	B	B	D	B	B	B	D
D11Mit19	B	D	B	D	B	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D	B	B	B	D	B	D	D	D	D	D	D	B	D	D	B	B	D	B	B	B	D
D11Mit296	D	D	B	D	B	B	B	D	D	D	D	B	D	B	B	B	B	B	B	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	B	B	D	B	B	D	D
D11Mit20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	D	D	B	B	D	B	B	.	D
D11Mit140	D	D	B	D	B	B	B	D	D	D	B	D	B	B	B	D	B	B	B	B	B	D	D	B	D	D	B	D	B	B	B	D	D	B	.	D
D11Mit157	D	D	B	D	B	B	B	D	D	D	D	D	B	D	B	D	B	B	B	B	B	D	D	B	B	D	B	D	B	B	B	D	B	B	.	B
D11Mit4	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	D	D	B	D	D	B	B	B	B	B	.	B
D11Mit5	B	D	B	D	B	B	B	B	D	B	D	D	B	D	B	D	B	B	B	B	B	D	D	B	D	D	B	D	D	B	B	B	B	B	.	B
D11Mit219	B	D	B	D	B	B	B	B	D	B	D	D	B	D	B	D	B	B	B	B	B	D	D	B	B	D	B	D	D	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit194	B	D	B	D	B	B	B	B	D	B	D	D	B	D	B	D	B	B	B	B	B	B	D	B	B	D	B	D	D	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit178	B	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	B	B	B	B	B	D	B	B	D	B	B	B	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit36	B	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	B	B	B	B	B	D	B	B	D	B	B	B	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit41	B	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	B	B	B	B	B	D	B	B	D	B	B	B	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit38	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	B	B	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit179	B	D	D	B	D	D	B	D	B	D	D	D	B	D	D	D	D	B	B	B	D	B	D	B	B	D	B	B	B	B	B	B	B	B	D	B
D11Mit99	B	D	D	D	D	D	B	B	B	D	D	D	B	D	D	D	D	B	D	B	B	B	B	D	B	D	B	D	B	D	B	B	B	B	D	D
D11Mit258	D	D	D	D	D	D	B	B	B	B	B	B	D	D	D	D	D	B	D	B	B	B	B	D	B	D	B	D	B	.	B	B	B	B	.	D
D11Mit338	D	D	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	B	B	B	D	B	D	B	D	D	B	B	B	B	B	B	D
D11Mit337	D	D	B	D	D	D	B	D	D	B	D	D	B	B	D	D	D	B	D	D	D	B	B	D	B	D	B	D	D	D	B	D	B	B	B	D
Es3	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	D	D	D	B	D	B	B	.	D

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D11Mit62	D11Mit78	3	36	2.381	1.504
D11Mit78	D11Mit79	3	36	2.381	1.504
D11Mit79	D11Mit19	4	36	3.333	1.886
D11Mit19	D11Mit296	7	36	6.863	3.287
D11Mit296	D11Mit20	0	9	0.000	0.000
D11Mit20	D11Mit140	2	9	8.333	7.795
D11Mit140	D11Mit157	5	35	4.545	2.395
D11Mit157	D11Mit4	4	13	14.286	11.037
D11Mit4	D11Mit5	0	13	0.000	0.000
D11Mit5	D11Mit219	1	35	0.746	0.768
D11Mit219	D11Mit194	1	36	0.725	0.746
D11Mit194	D11Mit178	10	36	11.905	5.485
D11Mit178	D11Mit36	0	36	0.000	0.000
D11Mit36	D11Mit41	0	36	0.000	0.000
D11Mit41	D11Mit38	0	10	0.000	0.000
D11Mit38	D11Mit179	0	10	0.000	0.000
D11Mit179	D11Mit99	9	36	10.000	4.619
D11Mit99	D11Mit258	5	34	4.717	2.500
D11Mit258	D11Mit338	9	34	10.976	5.203
D11Mit338	D11Mit337	3	36	2.381	1.504
D11Mit337	Es3	0	9	0.000	0.000