Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  4
• Reference
  J:54496 Rogers MJ, et al., Genetic mapping of the whirler mutation. Mamm Genome. 1999 May;10(5):513-9
• ID
  MGI:1336971

Genes

Gene	Assay Type	Description
D4Nds10
D4Mit88
D4Mit139
D4Mit140
D4Mit197
D4Mit242
D4Mit287
D4Mit44
D4Mit151
D4Mit243
D4Mit217
D4Mit326
Alad	Southern analysis	Lv cDNA4
Ambp	Southern analysis	Ambp-pA, Ambp-pB
D4Mit87
Whrn	visible phenotype
Orm1
Tnfsf8	SSCP	Tnfsf8-pA, Tnfsf8-pB
Tnc	Southern analysis	Tnc cDNA2
D4Mit218
D4Mit82
D4Mit80
Tyrp1

CROSS

• Type
  Backcross, sexes unspecified or combined
• Female Parent
  <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>/<c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>
• Strain
  (STOCK Whrn x CAST/Ei)F1
• Male Parent
  <w> <w> <<w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>/<w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w> <w>
• Strain
  STOCK Whrn
• Allele 1
  w from STOCK Whrn
• Allele 2
  w from CAST/EiJ

CROSS Data

MC #mice	D4Nds10	D4Mit88	D4Mit139	D4Mit140	D4Mit197	D4Mit242	D4Mit287	D4Mit44	D4Mit151	D4Mit243	D4Mit217	D4Mit326	Alad	Ambp	D4Mit87	Whrn	Orm1	Tnfsf8	Tnc	D4Mit218	D4Mit82	D4Mit80	Tyrp1
403	c	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	c	c	.	.	.	.	.	c
316	w	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	w	w	.	.	.	.	.	w
4	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	w	w
6	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	c	c
5	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	w	w
6	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	c	c
1	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	w	w
3	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	c	c
1	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	w	w
1	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	w	w
6	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	w	w
1	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	c	c
3	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	c	c
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	c	c
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c	c	c
1	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c	c
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	w	w	w	w	w
2	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	c	c	c	c	c
1	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	w	w	w	w
2	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	w	w	w
2	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	c	c	c
33	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	c	.	c	c	c	w	w
16	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	w	.	w	w	w	c	c

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
Whrn	Orm1	0	817	0.000	0.000