Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  19
• Reference
  J:41604 Welch CL, et al., Assignment of Gpam to distal mouse chromosome 19 by linkage analysis. Mamm Genome. 1998 Jan;9(1):93
• ID
  MGI:1195954

Genes

Gene	Assay Type	Description
Fth1	reported elsewhere
D19Ucla2	reported elsewhere
D19Ucla3	reported elsewhere
Vldlr	reported elsewhere
D19Mit29	reported elsewhere
D19Mit31	reported elsewhere
D19Ucla4	reported elsewhere
D19Mit14	reported elsewhere
D19Mit12	reported elsewhere
D19Ucla5	reported elsewhere
Pdcd4	reported elsewhere
D19Mit4	reported elsewhere
D19Mit1	reported elsewhere
Gpam	Southern analysis	Gpam probe
Slc18a2	reported elsewhere
Pnlip	reported elsewhere
Pnliprp1	reported elsewhere
D19Mit6	reported elsewhere

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s> <s>
• Strain
  (C57BL/6J x SPR or SEG/Pas)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  C57BL/6J
• Mapping Panel
  EUCIB (BSB)
• Allele 1
  b from C57BL/6J
• Allele 2
  s from SPR or SEG/Pas

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
Fth1	D19Ucla2	1	65
Fth1	D19Ucla3	1	65
Fth1	Vldlr	1	65
D19Ucla2	D19Ucla3	0	62
D19Ucla2	Vldlr	0	62
D19Ucla3	Vldlr	0	62
D19Ucla2	D19Mit29	2	50
D19Ucla3	D19Mit29	2	50
Vldlr	D19Mit29	2	50
D19Mit29	D19Mit31	4	49
D19Mit31	D19Ucla4	5	57
D19Ucla4	D19Mit14	1	62
D19Mit14	D19Mit12	6	49
D19Mit12	D19Ucla5	4	51
D19Ucla5	Pdcd4	3	60
Pdcd4	D19Mit4	5	55
D19Mit4	D19Mit1	1	62
D19Mit4	Gpam	1	62
D19Mit1	Gpam	0	66
D19Mit1	Slc18a2	1	62
Gpam	Slc18a2	1	62
Slc18a2	Pnlip	1	64
Slc18a2	Pnliprp1	1	64
Pnlip	Pnliprp1	0	66
Pnlip	D19Mit6	1	61
Pnliprp1	D19Mit6	1	61

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
Fth1	D19Ucla2	1	66	1.515	1.504
Fth1	D19Ucla3	1	66	1.515	1.504
Fth1	Vldlr	1	66	1.515	1.504
D19Ucla2	D19Ucla3	0	62	0.000	0.000
D19Ucla2	Vldlr	0	62	0.000	0.000
D19Ucla3	Vldlr	0	62	0.000	0.000
D19Ucla2	D19Mit29	2	52	3.846	2.667
D19Ucla3	D19Mit29	2	52	3.846	2.667
Vldlr	D19Mit29	2	52	3.846	2.667
D19Mit29	D19Mit31	4	53	7.547	3.628
D19Mit31	D19Ucla4	5	62	8.065	3.458
D19Ucla4	D19Mit14	1	63	1.587	1.575
D19Mit14	D19Mit12	6	55	10.909	4.204
D19Mit12	D19Ucla5	4	55	7.273	3.502
D19Ucla5	Pdcd4	3	63	4.762	2.683
Pdcd4	D19Mit4	5	60	8.333	3.568
D19Mit4	D19Mit1	1	63	1.587	1.575
D19Mit4	Gpam	1	63	1.587	1.575
D19Mit1	Gpam	0	66	0.000	0.000
D19Mit1	Slc18a2	1	63	1.587	1.575
Gpam	Slc18a2	1	63	1.587	1.575
Slc18a2	Pnlip	1	65	1.538	1.527
Slc18a2	Pnliprp1	1	65	1.538	1.527
Pnlip	Pnliprp1	0	66	0.000	0.000
Pnlip	D19Mit6	1	62	1.613	1.600
Pnliprp1	D19Mit6	1	62	1.613	1.600