Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  15
• Reference
  J:74275 Okamoto M, et al., Linkage mapping of the mouse nephrosis (nep) gene to chromosome 15. J Vet Med Sci. 2001 Dec;63(12):1347-50
• ID
  MGI:2180673

Genes

Gene	Assay Type
D15Mit1	PCR
D15Mit95	PCR
D15Mit37	PCR
D15Mit96	PCR
D15Mit124	PCR
D15Mit74	PCR
D15Mit14	PCR
D15Mit15	PCR
D15Mit16	PCR
D15Mit39	PCR
D15Mit40	PCR
D15Mit77	PCR
D15Mit79	PCR
D15Mit149	PCR
Tns2	visible phenotype

Notes

• Experiment
  ICGN was a partial Inbred strain at the time of publication. Authors use nep for nph. cM position of 60.0 estimated from average of nonrecombinant markers.

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i>/ <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m> <m>
• Strain
  (ICGN x MSM)F1
• Male Parent
  <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i>/<i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i> <i>
• Strain
  ICGN
• Allele 1
  i from ICGN
• Allele 2
  n from MSM

CROSS Data

MC #mice	D15Mit1	D15Mit95	D15Mit37	D15Mit96	D15Mit124	D15Mit74	D15Mit14	D15Mit15	D15Mit16	D15Mit39	D15Mit40	D15Mit77	D15Mit79	D15Mit149	Tns2
54	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m
40	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i
1	i	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m
2	i	i	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m
1	i	i	i	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m	m
1	i	i	i	i	i	i	m	m	m	m	m	m	m	m	m
2	m	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i
2	m	m	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i
1	m	m	m	m	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i
1	m	m	m	m	m	i	i	i	i	i	i	i	i	i	i
3	m	m	m	m	m	m	i	i	i	i	i	i	i	i	i

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D15Mit1	D15Mit95	3	108	2.778	1.581
D15Mit95	D15Mit37	4	108	3.704	1.817
D15Mit37	D15Mit96	1	108	0.926	0.922
D15Mit96	D15Mit124	1	108	0.926	0.922
D15Mit124	D15Mit74	1	108	0.926	0.922
D15Mit74	D15Mit14	4	108	3.704	1.817
D15Mit14	D15Mit15	0	108	0.000	0.000
D15Mit15	D15Mit16	0	108	0.000	0.000
D15Mit16	D15Mit39	0	108	0.000	0.000
D15Mit39	D15Mit40	0	108	0.000	0.000
D15Mit40	D15Mit77	0	108	0.000	0.000
D15Mit77	D15Mit79	0	108	0.000	0.000
D15Mit79	D15Mit149	0	108	0.000	0.000
D15Mit149	Tns2	0	108	0.000	0.000