About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hoxd4
homeobox D4
MGI:96208

16 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4223229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74720062fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Locus-Region
1SNP  T TTTTT    AT                  A/T
rs4223230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74720083fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Locus-Region
1SNP  C CCCCC    GC                  C/G
rs27967846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74720098fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Locus-Region
1SNPG GGGG  GGCG   G     G    GC   G C/G
rs27967845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74721068fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Locus-Region
1SNPG GGGG  GGCG   G     G    GC   G C/G
rs27967844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74722171fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : mRNA-UTR
1SNPA AA A  AACA   A     A    AC   A A/C
rs27967843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74722402fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Intron
1SNPT TT T  TTCT   T     T    TT   T C/T
rs27967842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74722573fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG  GGGG   G     G    GT   G G/T
rs27967841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74723084fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Intron
1SNPT TTTT  TTCT   T     T    TC   T C/T
rs27967840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74723309fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Intron
1SNPA AAAA  AATA   A     A    AT   A A/T
rs27967839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74723557fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Intron
1SNPC CCCC  CCAC   C     C    CA   C A/C
rs241446380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74724016fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Intron
1SNP            A         G          A/G
rs260992950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74727006fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : mRNA-UTR
1SNP            G         A          A/G
rs108837940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74727011fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : mRNA-UTR
1SNP  C     C               T        C/T
rs13476579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74727562fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : Coding-NonSynonymous
2SNP C C C  C   C   GCCCC GC CC CCC CC/G
rs242267488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74730138fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : 978 bp downstream of
1SNP            C         A          A/C
rs265100436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74730934fHoxd3 : Intron
Hoxd4 : 1774 bp downstream of
1SNP            A         C          A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory