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Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hoxd13
homeobox D13
MGI:96205

10 matching SNPs displayed
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Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs221544233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74667408fHoxd13 : Locus-Region
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNP            C  T   C/T
rs240969642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74668729fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)2Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : Coding-Synonymous
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNP            G  A   A/G
rs33159357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74668915fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : Coding-Synonymous
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
2SNPCCC   C T          C/T
rs266193673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74671403fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : mRNA-UTR
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNP            T  C   C/T
rs27967895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74671514fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)29Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : mRNA-UTR
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
2SNPGGGG  GGAG G GG G GA/G
rs27967894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74671914fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
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Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)2Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)29Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : Locus-Region
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs27967893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74672920fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)2Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)29Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : 1321 bp downstream of
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAGA AA AGAA/G
rs27967892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74672943fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)2Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)29Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : 1344 bp downstream of
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGCG GG GGGC/G
rs27967891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74672973fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)2Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)29Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd13 : 1374 bp downstream of
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs27967890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74673198fDel(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)2Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)16Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)27Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd11-Hoxd13)29Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)5Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)6Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)35Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd12-Hoxd13)41Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd11-Hoxd13)4Ddu : within coordinates of
Hoxd12 : Locus-Region
Hoxd13 : 1599 bp downstream of
In(2Hoxd11;Itga6)1Ddu : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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09/09/2014
MGI 5.19
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