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Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Bbs12
Bardet-Biedl syndrome 12 (human)
MGI:2686651

106 matching SNPs displayed
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Legend
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SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3141153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37310597fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNP GG   A G   G  GA   A/G
rs30033565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37310985fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNPA GAGA G GGG AA  AAAA/G
rs3141154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311164fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNPG     A     G  G    A/G
rs47991675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311402fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP TT         T  T    T
rs51459406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP GG         G  G    G
rs251505058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311492fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            G  C    C/G
rs51246275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311554fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP GG                 G
rs51510712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311557fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP AA                 A
rs212145206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311638fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            A  A    A
rs48064966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311856fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
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1SNP            C  A    A/C
rs261605808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37311981fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
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1SNP            C  A    A/C
rs50844768
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Chr3:37312031fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            G  G    G
rs47266463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312048fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP  A     A   A  A    A
rs48429274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312111fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP TT     T   T  A    A/T
rs50305167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312157fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP TT     T   T  C    C/T
rs48524242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312223fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP CC     C   C  C    C
rs46161135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312292fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Intron
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            A  A    A
rs52279063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312417fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : mRNA-UTR
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP GG     G           G
rs46404731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312494fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Locus-Region
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP GG     G           G
rs47842149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312510fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Locus-Region
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP TT     T   T  T    T
rs49104112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312539fBbs12 : Locus-Region
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP GG     G   G  G    G
rs3141155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312607fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP GG     G   G  G    G
rs3141156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312613fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP CC     C   C  A    A/C
rs3141157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37312802fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNP TT   G T   T  T    G/T
rs3141158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313205fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNP  T   C T   T  T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs225160647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313237fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            T  G    G/T
rs47415884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313247fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP  C                 C
rs256071685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313254fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            A  G    A/G
rs48080954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313319fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP        A           A
rs3141159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313409fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP        T   T  T    T
rs3141160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313502fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
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2SNP        G   G  G    G
rs3141161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313584fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
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2SNP        A   A  A    A
rs3141162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313697fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            C  C    C
rs3141163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313698fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
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1SNP            T  T    T
rs3141164
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Chr3:37313828fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
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2SNP        T   T  T    T
rs3141165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37313833fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
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2SNP        T   T  T    T
rs3141166
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Chr3:37313946fBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
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2SNP        T   T  T    T
rs30723550
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Chr3:37314213rBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
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1SNPAA    G A           A/G
rs30718676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37314217rBbs12 : Intron
Cetn4 : Locus-Region
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNPAA    G A           A/G
rs3141167
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Chr3:37314704fBbs12 : Intron
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2SNP G      G   G  G    G
rs3141168
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Chr3:37314757fBbs12 : Intron
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2SNP AA     A   A  A    A
rs30033568
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Chr3:37314774fBbs12 : Intron
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1SNP    G   GG    T     G/T
rs3141169
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Chr3:37314779fBbs12 : Intron
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2SNP TT     T   T  T    T
rs3141170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37314960fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP  C         C  CG   C/G
rs3141171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37314995fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP CC     C   C  CT   C/T
rs3141172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37315010fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP  T         T  TC   C/T
rs3141173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37315637fBbs12 : Intron
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Mos3 : within coordinates of
3SNP  A   G     A  AG   A/G
rs3141174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37315985fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNPA     G A   A  A    A/G
rs49160059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37316321fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
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2SNP CC     C   C  C    C
rs49830969
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Chr3:37316330fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP  G         G  G    G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3141175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37316683fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP TT     T   T  T    T
rs3151758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37316848fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
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3SNP G    A G   G  G    A/G
rs3151759
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Chr3:37317058fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNP TT   A T   T  T    A/T
rs3141176
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Chr3:37317352fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
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Mos3 : within coordinates of
3SNP  A   G A   A  A    A/G
rs3141177
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Chr3:37317527fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNP GG   T G   G  G    G/T
rs3158927
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Chr3:37317606rBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNP TT   G T   T  T    G/T
rs30923317
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Chr3:37317626rBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNPGGG   A G   G  G    A/G
rs3141178
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Chr3:37318254fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP C    T     C  C    C/T
rs3141179
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Chr3:37318275fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP G    T     G  G    G/T
rs235639623
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Chr3:37318408fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            G  G    G
rs252891472
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Chr3:37318477fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            C  C    C
rs223038313
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Chr3:37318552fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            C  C    C
rs232605665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37318563fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            T  C    C/T
rs108649493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37318675fBbs12 : Intron
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
2SNP A          A  A    A
rs3146738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37318738fBbs12 : Intron
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
1SNP            G  G    G
rs3141180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37319446fBbs12 : Coding-Synonymous
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hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNPCCCCTC CCTC CCTC C CC/T
rs3141181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37319466fBbs12 : Coding-NonSynonymous
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNPGGGGAG AGAAGGGAG G  A/G
rs3141182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37319497fBbs12 : Coding-Synonymous
Fgf2 : within coordinates of
hlb258 : within coordinates of
Mos3 : within coordinates of
3SNPCCCCAC AC ACCCAC C CA/C
rs3141183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37319580fBbs12 : Coding-NonSynonymous
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hlb258 : within coordinates of
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3SNPAAAAGA GAGGAAAGA A AA/G
rs30034579
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Chr3:37319628fBbs12 : Coding-NonSynonymous
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hlb258 : within coordinates of
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1SNPC CCCC  CCGC CC  C CC/G
rs3141184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37319843fBbs12 : Coding-NonSynonymous
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hlb258 : within coordinates of
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3SNPAAAAGA AA AAAAGA A AA/G
rs3141185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37320223fBbs12 : Coding-Synonymous
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3SNPG GGAG GGAGGGGAG G GA/G
rs3141186
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Chr3:37320333fBbs12 : Coding-NonSynonymous
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3SNPGGGGAG AGAAGGGAG G GA/G
rs30035758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:37320720fBbs12 : Coding-NonSynonymous
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1SNPA AAA  AACAA AA  A AA/C
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Chr3:37320822fBbs12 : Coding-NonSynonymous
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4SNPGGGGCGCGG GGGGCG G GC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3141188
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rs30037015
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rs30037018
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rs30039787
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rs30039790
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rs30039793
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rs50720970
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2SNP CC     C   C  C    C
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2SNP GG     G   G  G    G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50170462
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rs51138113
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rs3162849
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2SNPA AAG  GAGGAAAGA A AA/G
rs30040698
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1SNP  GGG  A  AG GG  G  A/G
rs3162848
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1SNP            A  A    A
rs46013439
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1SNP  A             G   A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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08/12/2014
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