About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Hmbs
hydroxymethylbilane synthase
MGI:96112

57 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32610362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142431fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNPA AAA A GAAGA     AA  AGAA/G
rs32610954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142461fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNPG GGG G GGGTG     GG  GGGG/T
rs8254818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142554fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
2SNPG GGGGGGGGGCGGC GGGGGGGCGC/G
rs8254819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142569fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNP  C CCCCCC   CT CC  CC   C/T
rs8254820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142680fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNP  A AAAAAA   AG AA  AA   A/G
rs8254821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142693fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNP  T TTTTTT   TATTT  TT   A/T
rs8254822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142763fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNP  G GGGGGG   GCCGG  GG   C/G
rs13463799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142805fH2afx : mRNA-UTR
Hmbs : Locus-Region
1SNPG GGG G GGGTG     GG  GTGG/T
rs13463798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44142844fH2afx : mRNA-UTR
Hmbs : Locus-Region
1SNPT TTT T CTTCT     TT  TCTC/T
rs32610959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44143034fH2afx : Coding-Synonymous
Hmbs : Locus-Region
1SNPC CCC C TCCCC     CC  CCCC/T
rs3023211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44143651fH2afx : mRNA-UTR
Hmbs : Locus-Region
2SNPC TCT TCCTCCT     CC  CCCC/T
rs3023212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44143731fH2afx : mRNA-UTR
Hmbs : Locus-Region
1SNPA AAA A TAATA     AA  A AA/T
rs32605085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44143867fH2afx : mRNA-UTR
Hmbs : Locus-Region
1SNPT TTT T CTTCT     TT  TCTC/T
rs32605087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44143899fH2afx : mRNA-UTR
Hmbs : Locus-Region
1SNP  GGG G GGGTG     GG  G GG/T
rs29587256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44144174fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNP CG    G G               C/G
rs30088828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44144335fH2afx : Locus-Region
Hmbs : Locus-Region
1SNP AG    G G               A/G
rs32605089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44144627fH2afx : Locus-Region
Hmbs : mRNA-UTR
1SNPG GGG G GGGAG     GG  GGGA/G
rs30012077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44144716fHmbs : mRNA-UTR2SNPGCGGG GGCGGCG     GG  GCGC/G
rs30482502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44144878fHmbs : Coding-Synonymous2SNP CAAA AACAACA     AA  ACAA/C
rs30027525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44144988fHmbs : Intron2SNP CTTT TT TTCT     TT  TCTC/T
rs30092812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145075fHmbs : Coding-Synonymous2SNPGTGGG GGGGGTG     GG  GTGG/T
rs29693643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145124fHmbs : Intron2SNPAGAAA AAGAAGA     AA  AGAA/G
rs32606076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145150fHmbs : Intron1SNPC CCC C GCCGC     CC  CGCC/G
rs32606078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145320fHmbs : Intron1SNPG GGG G GGGAG     GG  GAGA/G
rs33713001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145578fHmbs : Intron1SNP TA    A A               A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30084452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145759fHmbs : Coding-Synonymous1SNP CT    T T               C/T
rs32606080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44145870fHmbs : Intron2SNPGAGGG GGGGGAG     GG  GAGA/G
rs30322104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44146052fHmbs : Coding-Synonymous2SNPGAGGG GGGGGAG     GG  GAGA/G
rs32606082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44146088fHmbs : Coding-Synonymous1SNPG GGG G AGGAG     GG  GAGA/G
rs32607114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44147112fHmbs : Intron1SNPG GAG G GGAGG     GG  GGGA/G
rs32607116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44147179fHmbs : Intron1SNPG GGG G AGGAG     GG  GAGA/G
rs32607118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44147581fHmbs : Coding-NonSynonymous1SNPG GGG G GGGTG     GG  GTGG/T
rs32607120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44148273fHmbs : Intron1SNP  AAA A GAAGA     AA  AGAA/G
rs32607122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44148639fHmbs : Intron1SNPG GGG G GGGCG     GG  GCGC/G
rs32607123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44148836fHmbs : Coding-Synonymous1SNPG GGG G AGGAG     GG  GAGA/G
rs32607865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149048fHmbs : Intron1SNPC CCC C CCCTC     CC  CTCC/T
rs32607867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149088fHmbs : Intron1SNP  GGG G AGGAG     GG  G GA/G
rs32607869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149104fHmbs : Intron1SNPG GGG G  GGAG     GG  G GA/G
rs32607871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149600fHmbs : Intron1SNPG GGG G AGGGG     GG  GGGA/G
rs30189547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149831fHmbs : Intron1SNP TA                      A/T
rs29591137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149862fHmbs : Intron1SNP GA                      A/G
rs32607873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44149995fHmbs : Intron1SNPA AAA A  AAGA     AA  A AA/G
rs30035032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44150077fHmbs : Intron2SNP?GAAA A GAAGA     AA  A AA/G
rs30391859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44150234fHmbs : Intron1SNP GA    A A               A/G
rs30334998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44150825fHmbs : Intron1SNP GT    T T               G/T
rs30423613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44150828fHmbs : Intron1SNP TC    C C               C/T
rs29839018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151102fHmbs : Intron1SNP TC    C C               C/T
rs30189214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151227fHmbs : Intron1SNP GA    A A               A/G
rs29889079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151422fHmbs : Intron1SNP AT    T T               A/T
rs29795289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151484fHmbs : Intron1SNP AG    G G               A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30282537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151627fHmbs : Intron2SNPGGAGA AGGAGGA     GG  G GA/G
rs32608597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151654fHmbs : Intron1SNPT TTT T  TTAT     TT  T TA/T
rs30373941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151799fHmbs : Intron1SNPCCT    T T               C/T
rs30134789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44151815fHmbs : Intron1SNPTTC    C C               C/T
rs29697034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44152036fHmbs : Intron1SNPGGA    A A               A/G
rs29942660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44152188fHmbs : mRNA-UTR2SNP?AGGG GG GGAG     GG  G GA/G
rs30385195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44152346fHmbs : Locus-Region2SNPTTCCC CCCCCTC     CC  C CC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory