About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hgd
homogentisate 1, 2-dioxygenase
MGI:96078

209 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32634179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37578232fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT T   TCTC/T
rs32634181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37578387fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A T  AA  ATAA/T
rs52699612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37578838fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs32627734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37578944fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCC  C C G      CGCC/G
rs32627736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37579022fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T T C  TT  TCTC/T
rs236522472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37579141fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs32627738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37579393fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A C  AA  ACAA/C
rs4174131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37579675fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP CC   C  T           C/T
rs4174132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37579777fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP TT   T  A           A/T
rs4174133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37579900fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP CC   C  A           A/C
rs32627740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37580128fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAA  G G    GG  AG A/G
rs32627742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37580195fHgd : Noncoding-Transcript-Variant
Hgd : mRNA-UTR
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC C CC C C T  CC  CTCC/T
rs32628484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37580269fHgd : mRNA-UTR
Hgd : Noncoding-Transcript-Variant
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A G  AA  AGAA/G
rs4174134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37581829fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNP  C   C  T           C/T
rs32628486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37583004fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G A  GG  GAGA/G
rs32628488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37583149fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC C CC C C T   C  CTCC/T
rs32628490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37583421fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP  CCCC C C T  C   CTCC/T
rs4174135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37583462fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNPGGG   G  A           A/G
rs4174136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37583484fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNPGGG   G  A           A/G
rs32628492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37584433fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G A  GG  GAGA/G
rs6233825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37585103fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP      A G            A/G
rs6247967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37585398fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNPG GGG G CC        GC C/G
rs4174137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37585399fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
5SNPTTTTT TCCC        T CC/T
rs256712668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37585472fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             A  T    A/T
rs32629306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37585565fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNPT TTTG G G G GG T TGGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs230767926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37585959fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs32629308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37586152fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G    GG   CGC/G
rs32629310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37587888fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C    CC  CTCC/T
rs32629312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37588206fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP    G  A   A  GG   A A/G
rs252702368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37588593fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs32630134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37588936fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C    CC  CTCC/T
rs32630135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37589528fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G A  GG  GAGA/G
rs217416336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37589601fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             A  A    A
rs240214151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37589603fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             A  A    A
rs32630136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37589972fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G T  GG  GTGG/T
rs32630137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590050fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG T G T  GG  GTTG/T
rs32630139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590135fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G    GG  GAGA/G
rs32630141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590231fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G C  GG  GCGC/G
rs32630142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590244fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G    GG  GAGA/G
rs32631034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590310fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C G  CC  CGCC/G
rs32631036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590459fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T T C  TT  TCTC/T
rs32631038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590501fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A G  AA  AGAA/G
rs32631040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590670fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G G  GG  GAGA/G
rs32631042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590769fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A C  AA  ACAA/C
rs32631824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590905fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP    A      G   A  AGAA/G
rs32631826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37590973fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G A  GG  GAGA/G
rs32631828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591036fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A G  AA  AGAA/G
rs32631830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591281fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC A C C  CC  CCAA/C
rs32631832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591439fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G A  GG  GAGA/G
rs4174138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591524fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
5SNPA AAAGAA G A GGGA AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4174139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591602fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
5SNPG GGGAG  A A AAAG GA A/G
rs32632576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591642fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT C T C  TT  TCCC/T
rs32632578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37591988fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C T  CC  CTCC/T
rs32632580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37592071fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A T  AA  ATAA/T
rs243037932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37592367fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs32632582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37593032fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T T C  TT  TCTC/T
rs32633414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37593166fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T C C  CC  CCTC/T
rs4174140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37593661fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP  A   A  T   T  A    A/T
rs4174141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37593663fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP  A   A  T   T  A    A/T
rs4174142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37595519fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
4SNPC C   C  T   T  C    C/T
rs32633416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37596709fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC A C C  CC  CCAA/C
rs32633417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37597572fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA G A A  AA  AAGA/G
rs32633418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37598321fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A A  AA  ATAA/T
rs32633419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37598615fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C T  CC  CTCC/T
rs32633421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37598823fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C T  CC  CTCC/T
rs32633423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37599474fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C T  CC  CTCC/T
rs32634385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37599585fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G G C  GG  GCGC/G
rs32634387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37599886fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA   A  A   T  AA  ATAA/T
rs32634389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37599915fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C   A  CC  CACA/C
rs32634391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37600126fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T T G  TT  TGTG/T
rs32627554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37600322fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T T G  TT  TGTG/T
rs32627556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37600374fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C C    CC  CACA/C
rs32627558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37600618fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A A G  AA  AGAA/G
rs32627559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37601040fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCC  C CCTC CC  CTCC/T
rs32627560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37601324fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4174143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37601436fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP GA   G              A/G
rs32627562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37601991fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AA A AA  AG A/G
rs32628474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602206fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTTT TT  TTAA/T
rs32628476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602653fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTCC/T
rs32628478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602709fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTCC/T
rs32628480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602750fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCCC/T
rs32628482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602852fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT G TTTT TT  TTGG/T
rs32629214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602930fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GG A/G
rs32629216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37602992fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTGT TT  TGTG/T
rs32629218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37603319fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32629220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37603464fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTTT TT  TTAA/T
rs108119750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37603812fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP  A                  A
rs4174144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604172fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
5SNPCCTTTC C CTCTCCCT CCCC/T
rs32629223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604174fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC  CCC C CCA  CC  CACA/C
rs32629925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604200fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CC C CC  C TC/T
rs32629927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604266fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGG  GG  GGTG/T
rs32629929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604423fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32629931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604450fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32629933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604668fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCTC/T
rs32630524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604723fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32630525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37604802fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32630527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37605542fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AA A AA  ACCA/C
rs32630529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37605632fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs47656969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37605726fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNP  G      A   A  G    A/G
rs32630530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37605932fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32630532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37606301fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32631364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37607330fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCAC CC  CACA/C
rs32631366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37607514fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGA      GA A/G
rs32631368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37607643fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32631370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608183fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCAC CC  CACA/C
rs32631372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608215fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCT  CC  CTCC/T
rs32632034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608406fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT T TT T TTCT T   TCTC/T
rs32632035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608558fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32632036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608631fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGCG GG  GCGC/G
rs32632038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608714fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AA A AA  AGAA/G
rs32632039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608764fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTAT TT  TATA/T
rs32632041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37608980fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CC C CC  CTCC/T
rs32632043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37609407fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs32632884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37609828fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA T AATA AA  ATTA/T
rs32632886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37609941fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32632888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37610009fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32632890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37610166fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC C CC T CC C CC  CCTC/T
rs4174145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37610914fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP CG   C  C           C/G
rs4174146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37610916fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNP CG   C  C           C/G
rs4174147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37611454fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
3SNPGGAGAGGG GAGG GG  GGGA/G
rs32633704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37611470fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CC C CC  CTCC/T
rs247545493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37611609fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs6233728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37611906fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP      G T            G/T
rs6234249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37611996fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP      T C            C/T
rs32633705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37612318fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACA AA  ACCA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32633707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37612420fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs52259327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37612542fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP AA      G           A/G
rs4174148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37612551fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNP AA   A  G           A/G
rs32633709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37612696fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA     AGGA/G
rs32630114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37613378fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs4174149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37613655fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
4SNPCCT      C   C  T    C/T
rs32630116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37613772fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32630118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37613852fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs32630119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37614108fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32630120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37614139fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32630122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37614194fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGAA/G
rs32630123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37614201fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGCG GG  GCGC/G
rs32630954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37615000fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCTC/T
rs32630955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37615270fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32630956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37615422fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32630957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37615587fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32630958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37615769fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs32630960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37616440fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32630962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37616524fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32630963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37616781fHgd : Noncoding-Transcript-Variant
Hgd : Coding-Synonymous
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32631945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37616923fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT  T  TCTC/T
rs32631947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37617550fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32631949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37617564fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AA A AA  AGAA/G
rs32631951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37617629fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AA A AA  AGAA/G
rs32631953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37617732fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG   GGAG GG  GA A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4174150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37618270fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
5SNPTTCCCTTC TCCCTTTC TCCC/T
rs32632806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37618322fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCAC CC  CAAA/C
rs32632808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37618446fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32632810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37618588fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT G TTT  TT  TTGG/T
rs32632812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37618898fHgd : Coding-Synonymous
Hgd : Noncoding-Transcript-Variant
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  C  C/T
rs32633594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37618928fHgd : Noncoding-Transcript-Variant
Hgd : Coding-Synonymous
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGGA/G
rs32633596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619118fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs51182995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619173fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP         C       G   C/G
rs49038017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619174fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP         G       C   C/G
rs47940843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619346fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP  C              T   C/T
rs4174151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619359fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
4SNP CA   C      C  AA   A/C
rs32633598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619401fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNPGGGGGG G GGAG GG AGAGA/G
rs48672579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619554fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP  C              T   C/T
rs32633600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619845fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC A  CC  CC  CCAA/C
rs32633602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37619908fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGCG GG  GCGC/G
rs32634404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37620006fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs32634405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37620100fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGA  GG  GAGA/G
rs32634407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37620304fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAC  AA  ACAA/C
rs32634409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37620478fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32634411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37620509fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs32634413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37620640fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs32634935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37621150fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32634937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37621429fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32634939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37622400fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTA  TT  TATA/T
rs32634941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37623643fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC  C  CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32634943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37623675fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32635575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37623819fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA   AA   AA  AG A/G
rs4174152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37623906fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
4SNPAAGGGAAG AGG AAAG AGGA/G
rs32635578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37623990fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AA A AA  AGAA/G
rs32635580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37624035fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AA A AA  A GA/G
rs32635582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37624400fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCCC/T
rs51904592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37624642fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
2SNP GG      G   G  T    G/T
rs32636504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37624660fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG  G  GAGA/G
rs32636506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37625020fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGGA/G
rs50312618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37625649fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP CC      C       G   C/G
rs32636508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37626578fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCT  CC  CTCC/T
rs32636510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37626738fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32633084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37627045fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32633086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37627056fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCT TT  TCCC/T
rs32633088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37627196fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AATA AA  ATAA/T
rs32633090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37627561fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCTC/T
rs32633092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37627978fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGT  G   GTGG/T
rs32633864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37628579fHgd : Noncoding-Transcript-Variant
Hgd : Coding-Synonymous
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32633866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37629158fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CACA/C
rs32633868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37629276fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CTTC/T
rs32633870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37629463fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32633872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37629569fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT  T  TCTC/T
rs32634564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37629815fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GAAA/G
rs32634566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37629917fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32634568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37630217fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32634570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37631346fHgd : Intron
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AA A AA  AGAA/G
rs32634572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37632221fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs32634573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37632288fHgd : Locus-Region
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32635265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37632599fHgd : 579 bp downstream of
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32635267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37632786fHgd : 766 bp downstream of
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs32635268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37632981fHgd : 961 bp downstream of
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs32635270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37633205fHgd : 1185 bp downstream of
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs45650533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37633745fHgd : 1725 bp downstream of
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP TT      T           T
rs107651549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:37633789rHgd : 1769 bp downstream of
Loh2 : within coordinates of
repro33 : within coordinates of
1SNP AG      G           A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/01/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory