About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hba-a2
hemoglobin alpha, adult chain 2
MGI:96016

61 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Exclude SNPs that map to multiple locations

Legend
*The reference flanking sequence for this SNP maps to multiple locations in the mouse genome.
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46686334 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283050f 1SNP  A     A          A
rs3163744 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283053f 1SNP AG                A/G
rs52536758 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283173f 1SNP  A     A          A
rs50721001 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283423f 1SNP  A                A
rs13459866 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283783fHba-a1 : within coordinates of2SNPG GGG  GGTG  GT GGGG/T
rs26823049 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283845fHba-a1 : within coordinates of1SNPT TTTT   TCT TT TT C/T
rs26823019 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32283902fHba-a1 : within coordinates of2SNPT TTTT GTTGT TT TTTG/T
rs13459867 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32284026fHba-a1 : within coordinates of2SNPT TTGG  TGGG GG TTGG/T
rs13459868 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32284064fHba-a1 : within coordinates of1SNPG CCGG G GC   G CGGC/G
rs26823018 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32284202fHba-a1 : within coordinates of2SNPG GGGT GGTGT GT GTTG/T
rs3163746 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32284343fHba-a1 : within coordinates of1SNP CC     C          C
rs3159927 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32284540f 1SNP  T                T
rs26823046 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32284656f 1SNPC CCCC G C C CC CCCC/G
rs48926119 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32286088f 1SNP TC     C          C/T
rs29481561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32294629fHba-a2 : Locus-Region3SNP TC     C   C  T   C/T
rs26823025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32294761fHba-a2 : Locus-Region4SNP GAA  GGA G A  GAA A/G
rs26823024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32294786fHba-a2 : Locus-Region1SNPC  C   T        CC C/T
rs26823023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32294790fHba-a2 : Locus-Region1SNP   A      G     A  A/G
rs26823022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32294812fHba-a2 : Locus-Region4SNPA GG  AAG A G  AGG A/G
rs29425823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32294813fHba-a2 : Locus-Region3SNP  T   C T   T  C   C/T
rs29422606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295062fHba-a2 : Locus-Region3SNP  T   C T   T  C   C/T
rs29418570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295066fHba-a2 : Locus-Region3SNP  G   A G   G  A   A/G
rs48317363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295131fHba-a2 : Locus-Region2SNP  T     T   T  C   C/T
rs47560250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295139fHba-a2 : Locus-Region2SNP  T     T   T  A   A/T
rs46881412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295156fHba-a2 : Locus-Region2SNP  A     A   A  C   A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49452715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295269fHba-a2 : Locus-Region2SNP  G         G  A   A/G
rs52262089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295299fHba-a2 : Locus-Region2SNP  C         C  A   A/C
rs52485300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295306fHba-a2 : Locus-Region2SNP  A         A  A   A
rs52376561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295332fHba-a2 : Locus-Region1SNP            T  G   G/T
rs52318241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295445fHba-a2 : Locus-Region1SNP  G                G
rs51170364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295486fHba-a2 : Locus-Region1SNP  C                C
rs46991029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295502fHba-a2 : Locus-Region1SNP  T                T
rs51265156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295506fHba-a2 : Locus-Region2SNP  A         A  G   A/G
rs48769547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295534fHba-a2 : Locus-Region1SNP  C                C
rs48006744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295545fHba-a2 : Locus-Region1SNP  G                G
rs47894465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295547fHba-a2 : Locus-Region1SNP  T                T
rs49571310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295568fHba-a2 : Locus-Region1SNP  A                A
rs52018834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295644fHba-a2 : Locus-Region1SNP  G                G
rs50998860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295667fHba-a2 : Locus-Region1SNP  C                C
rs49386980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295681fHba-a2 : Locus-Region1SNP  G                G
rs48936376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295713fHba-a2 : Locus-Region1SNP  C                C
rs51135054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295737fHba-a2 : Locus-Region1SNP  A                A
rs48603671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295762fHba-a2 : Locus-Region1SNP  C                C
rs46686334 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295885fHba-a2 : 604 bp upstream of1SNP  A     A          A
rs3163744 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32295888fHba-a2 : 601 bp upstream of1SNP AG                A/G
rs52536758 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296008fHba-a2 : 481 bp upstream of1SNP  A     A          A
rs50721001 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296240fHba-a2 : 249 bp upstream of1SNP  A                A
rs13459866 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296600fHba-a2 : within coordinates of2SNPG GGG  GGTG  GT GGGG/T
rs26823049 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296662fHba-a2 : within coordinates of1SNPT TTTT   TCT TT TT C/T
rs26823019 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296719fHba-a2 : within coordinates of2SNPT TTTT GTTGT TT TTTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13459867 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296843fHba-a2 : within coordinates of2SNPT TTGG  TGGG GG TTGG/T
rs13459868 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32296881fHba-a2 : within coordinates of1SNPG CCGG G GC   G CGGC/G
rs26823018 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32297019fHba-a2 : within coordinates of2SNPG GGGT GGTGT GT GTTG/T
rs3163746 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32297160fHba-a2 : within coordinates of1SNP CC     C          C
rs26823017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32297325fHba-a2 : Locus-Region2SNPC ACCC  ACCC CC CCCA/C
rs3159927 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32297357fHba-a2 : 59 bp downstream of1SNP  T                T
rs26823046 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32297473fHba-a2 : 175 bp downstream of1SNPC CCCC G C C CC CCCC/G
rs26823016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32297503fHba-a2 : Locus-Region2SNPT TTCT TTTTT CT TTTC/T
rs26823015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32298837fHba-a2 : 1539 bp downstream of
Hbq1a : Locus-Region
1SNPA AGAA  AA A AA GGAA/G
rs3159928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32299112fHba-a2 : 1814 bp downstream of
Hbq1a : Locus-Region
1SNPT C     C          C/T
rs48926119 *
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:32299112fHba-a2 : 1814 bp downstream of1SNP TC     C          C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory