About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Ift172
intraflagellar transport 172
MGI:2682064

129 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33461312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31251856fIft172 : 1424 bp downstream of
Krtcap3 : Intron
Nrbp1 : Locus-Region
3SNPCCC      G   C  C    C/G
rs32434954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31253746fIft172 : Intron1SNPT TTTT   TTTT TT  TA A/T
rs32434041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31254158fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCC  CC  CA A/C
rs32434039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31254387fIft172 : Intron1SNPA AAAA A AAGA AA  AA A/G
rs32434036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31254895fIft172 : Intron1SNPA AAAA   AAT  AA  AA A/T
rs32433273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31255222fIft172 : Intron1SNPT TTTT   TTCT TT  TTTC/T
rs32433270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31255538fIft172 : Intron1SNPA AAAA   A T  AA  AT A/T
rs32433267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31255613fIft172 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA A AAGA AA  AAAA/G
rs32433264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31256435fIft172 : Intron1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs32432451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31256783fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TT T TT  TC C/T
rs32432448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31256788fIft172 : Intron1SNPT TTTT   TTCT TT  T  C/T
rs32432445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31257320fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCGC CC  CCCC/G
rs32431692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31259109fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs32431689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31259862fIft172 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  AGAA/G
rs32431686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31260436fIft172 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs6254142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31260583fIft172 : Intron5SNPCCCC CT CT C CCCC T  C/T
rs6255245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31260780fIft172 : Intron1SNP      G A            A/G
rs6255774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31260862fIft172 : Intron1SNP      G A            A/G
rs6255799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31260881fIft172 : Intron1SNP      T C            C/T
rs32430650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31261230fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs29773549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31262519fIft172 : Intron3SNP TT   G  G   T  T    G/T
rs32430647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31263250fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs212800495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31264134fIft172 : Intron1SNP             A  A    A
rs32430644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31264369fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGA  GG  GGGA/G
rs32429841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31264384fIft172 : Intron1SNPC CCCC C TCC  CC  CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32429838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31264461fIft172 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG G GGA  GG  GGGA/G
rs32429835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31264525fIft172 : Intron1SNPT TTTT C T C  TT  TC C/T
rs32429192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31264581fIft172 : Intron1SNPG GGGG A GGA  GG  GA A/G
rs32429189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31265559fIft172 : Intron4SNPG AGAAGG G G AGAA GG A/G
rs32429186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31265620fIft172 : Intron1SNPA AAAA A A T  AA  AA A/T
rs32428393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31266028fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TTC  TT  TC C/T
rs32428390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31266400fIft172 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC T CCT  CC  CT C/T
rs32428387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31267382fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCG  CC  CC C/G
rs32428384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31267641fIft172 : Coding-NonSynonymous1SNPA AAAA A AAT  AA  AAAA/T
rs33132490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31268755fIft172 : Intron3SNP  C      T   C  C    C/T
rs32427641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31269014fIft172 : Intron1SNPC CCCC G C G  CC  CGGC/G
rs32427638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31270001fIft172 : Intron1SNPT TT T   T C  TT  T  C/T
rs32427635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31270127fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGA  GG  GGGA/G
rs32426882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31270153fIft172 : Intron1SNPG GGGG G G A  GG  GGGA/G
rs33475504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31271055fIft172 : Intron2SNPTTA   A  A           A/T
rs32426879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31271631fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCA  CC  CC A/C
rs32426876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31271858fIft172 : Intron1SNPT TTTT T TTC  TT  TT C/T
rs29533754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31271953fIft172 : Intron2SNP CG      G           C/G
rs32426083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31272495fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCT  CC  CC C/T
rs32426080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31272516fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGA  GG  GG A/G
rs32426077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31272666fIft172 : Intron1SNPA AAAA    AG  AA  AA A/G
rs32426074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31272910fIft172 : Intron3SNPTTGTGGGT GG   TG  G  G/T
rs32425321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31273074fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAG  AA  AG A/G
rs32425318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31273155fIft172 : Intron1SNPA AAAA A AAG  AA  AA A/G
rs32425315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31273240fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGA  GG  GG A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32424592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31274096fIft172 : Intron1SNPA AAAA   AAG  AA  AG A/G
rs33531799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31274390fIft172 : Intron3SNP  A      G   A  A    A/G
rs32424589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31274645fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAG  AA  AG A/G
rs52412459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31275408fIft172 : Intron1SNP TG                  G/T
rs52535809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31275414fIft172 : Intron1SNP TG                  G/T
rs32424586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31275784fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TTC  TT  TC C/T
rs32423743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31276133fIft172 : Intron1SNPG GGGG   GGAG GG  GAGA/G
rs33190108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31276344fIft172 : Intron2SNP AG   G  G           A/G
rs32423740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31276493fIft172 : Intron3SNPCCTCTTTC TTCT CT  TCTC/T
rs29520316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31276759fIft172 : Intron3SNPCCTCTTTC TTCT CT  TCTC/T
rs32423735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31277046fIft172 : Intron1SNPA AAAA A AAGA AA  AAAA/G
rs32437100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31277114fIft172 : Intron2SNPGGAGAAAG AAGA GA  AGAA/G
rs32437097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31277436fIft172 : Intron2SNPGGGGGG G GGAG GG AGGGA/G
rs32437094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31277624fIft172 : Intron2SNP  TTTT T TTGT  T GT TG/T
rs32436221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31277746fIft172 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CTCC/T
rs32436218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31277788fIft172 : Intron1SNPT TTTT T T C  TT  T TC/T
rs32436215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31278379fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  C CC/T
rs32435272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31278385fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs32435269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31278451fIft172 : Intron1SNPA AAAA   AATA AA  ATAA/T
rs33493145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31278800fIft172 : Intron2SNP AT                  A/T
rs32435267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279078fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs32435265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279167fIft172 : Intron1SNPT TTTT A TTA  TT  TA A/T
rs32434392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279316fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AGAA/G
rs32434389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279550fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs32434386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279583fIft172 : Intron1SNP  T  T C T C   T  TC C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32433683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279586fIft172 : Intron1SNPA GAGG   GGG  AG  GGGA/G
rs32433680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279821fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs32433677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279834fIft172 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs32433674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279915fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs32432961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31279956fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs32432958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31280082fIft172 : Intron1SNPT TTTT A TTAT TT  TATA/T
rs32432955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31280930fIft172 : Intron1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs32432182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31281078fIft172 : Intron1SNPT ATAA A AAAA TA  AAAA/T
rs32432179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31281107fIft172 : Intron1SNPT TTTT   TTC  TT  TCTC/T
rs32432176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31281313fIft172 : Intron1SNPT CTCC C CCCC TC  CCCC/T
rs32431423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31281334fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs32431420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31281383fIft172 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT T TTC  TT  TTTC/T
rs29544580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31281885fIft172 : Intron2SNP C       A           A/C
rs32431417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31282186fIft172 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GAGA/G
rs32431414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31282276fIft172 : Intron1SNPA GAGG G GGGG AG  GGGA/G
rs33153872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31282723fIft172 : Intron2SNP GC   C  C           C/G
rs32430741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31282821fIft172 : Intron3SNPAAGAGG G GGGG AG  GGGA/G
rs32430738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31282869fIft172 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GAGA/G
rs32430735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31282976fIft172 : Intron2SNPAAGAGGG  GGGG AG  GGGA/G
rs32429862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31283024fIft172 : Intron2SNPCCTCT T  TTCT CT  TCTC/T
rs48841395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31283261fIft172 : Intron1SNP AC      C           A/C
rs32429859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31283277fIft172 : Intron1SNPG AGAA   AAGA GA  AGAA/G
rs32429856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31283567fIft172 : Intron2SNPCCTCTT C TTCT CT  TCTC/T
rs32439433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31284024fIft172 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA A AAGA AA  AAAA/G
rs32439430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31284099fIft172 : Coding-Synonymous3SNPTTCTCCCC CCCC TC  CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32439427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31284111fIft172 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   GGGG GG  GTGG/T
rs32439424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31284475fIft172 : Intron1SNPA GAGG G GGGG AG  GGGA/G
rs32438571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31284566fIft172 : Intron1SNPT CTCC C CCCC TC  CCCC/T
rs32438568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285105fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TT T TT  TCTC/T
rs32438565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285390fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGTG GG  GGGG/T
rs32437682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285544fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs32437679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285581fIft172 : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CTCC/T
rs32437676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285632fIft172 : Intron2SNPG AGAA G AAGA GA  AGAA/G
rs32436923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285656fIft172 : Intron3SNPGGAGAA   AAGA GA  AGAA/G
rs32436920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285772fIft172 : Coding-Synonymous1SNPA TATT   TT T AT  TATA/T
rs32436917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31285943fIft172 : Intron1SNPC CCCC A CCAC CC  CACA/C
rs32436914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31286206fIft172 : Intron1SNPA AAAA   AAG  AA  AGAA/G
rs32436001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31286244fIft172 : Intron1SNPA AAAA T AAT  AA  AT A/T
rs32435998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31286527fIft172 : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs32435995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31286763fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGCG GG  GGGC/G
rs32435092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31286833fIft172 : Intron1SNPT TTTT   TTCT TT  T TC/T
rs32435089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31287042fIft172 : Intron1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs32435086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31287092fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs32434303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31287405fIft172 : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AG A/G
rs32434300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31287422fIft172 : Intron1SNPT TTTT T TTCT TT  TTTC/T
rs32434297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31287518fIft172 : Intron1SNPT TTTT T TTCT TT  TTTC/T
rs241052265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31287923fIft172 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs33347872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31289221fIft172 : Intron2SNP AA      G   A  A    A/G
rs49597935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31289414fIft172 : Intron1SNP             G  G    G
rs244430487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31289421fIft172 : Intron1SNP             G  G    G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs264762524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31290169fIft172 : Intron1SNP             T  T    T
rs49811347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31290643fIft172 : Intron1SNP TT      T       A   A/T
rs47618599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31290723fIft172 : Intron1SNP AA      A       C   A/C
rs50134318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:31291196fIft172 : Locus-Region1SNP  A              G   A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory