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Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Gm2a
GM2 ganglioside activator protein
MGI:95762

41 matching SNPs displayed
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Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26961171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55096512fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT TTTT    T TT C C/T
rs48588508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55096721fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  T              T
rs49970876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55096729fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  C              C
rs51556368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP AA              A
rs47361590
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Chr11:55096746fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  C              C
rs47382360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55096772fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  C              C
rs51068476
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Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  G              G
rs51166415
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Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  T              T
rs45672978
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Gm2a : Locus-Region
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  A              A
rs26961170
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Gm2a : Locus-Region
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1SNPA AAAA G AA AA AAA/G
rs26961169
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Gm2a : Intron
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1SNPG GGGG G GG GG AGA/G
rs26961168
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CC CC CCC/T
rs26945267
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC C CC C CC CC TCC/T
rs26945266
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPG GGGG  GGG GG AGA/G
rs26945265
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPA A  A   AA AA GAA/G
rs26945264
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT TTTT  TTT TT CTC/T
rs26945263
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Gm2a : Intron
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1SNPA A AA   AA AA GAA/G
rs26945262
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Gm2a : Intron
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1SNPT TTTT  TTT TT GTG/T
rs26945261
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPG GGGG  GGG GG AGA/G
rs26945260
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Chr11:55103124fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC CCCC  CCC CC GCC/G
rs26945259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55103809fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPA AAAA  AAA AA GAA/G
rs26945258
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Chr11:55103858fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPA AAAA  AAA AA TAA/T
rs26945257
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPA AAAA  AAA AA CAA/C
rs26945256
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
3SNPTTTCCT  CTTCTCTCCC/T
rs26945255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT TTTT  TTT TC CTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26945254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55105627fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPG GGGG  GGG GG AGA/G
rs29423890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55106107fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
3SNP  T   G G  G  T  G/T
rs26945253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55106402fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC CCCC  CCC CA ACA/C
rs26945252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55106438fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPG GGCG  GGG GG GGC/G
rs26945251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC CCCC  CCC CT TCC/T
rs26945250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107062fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPA AAAA  AAA AA TAA/T
rs26945249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107112fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC CCCC  CCC CC TCC/T
rs26945248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107151fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT TTTT  TTT TC TTC/T
rs26945247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107156fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPG GGGG  GGG GG AGA/G
rs26945246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107446fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT TTTT  TTT TC CTC/T
rs47938736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107488fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNP  C     C        C
rs26945245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55107799fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT TTTT  TTT TT ATA/T
rs26945244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55109340fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : Intron
Hlb290 : within coordinates of
1SNPA AAAA  AAA AA GAA/G
rs26945243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55109596fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : mRNA-UTR
Hlb290 : within coordinates of
1SNPC CCCC  CCC CC TCC/T
rs26945242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55109777fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : mRNA-UTR
Hlb290 : within coordinates of
1SNPG GGGG  GGG GA GGA/G
rs26945241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:55111893fDel(11Sparc-Gpx3)91Anjm : within coordinates of
Gm2a : mRNA-UTR
Hlb290 : within coordinates of
1SNPT   TT   TT TC  TC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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11/11/2014
MGI 5.20
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