About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Gata3
GATA binding protein 3
MGI:95663

106 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49840595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9857663fDwh : within coordinates of
Gata3 : mRNA-UTR
1SNP CC      T        C/T
rs33458094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9857814fDwh : within coordinates of
Gata3 : mRNA-UTR
1SNPTT    A  T        A/T
rs27150273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9860036fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP          C   CT CC/T
rs27150272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9860190fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP              GA  A/G
rs27150271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9861362fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA   A     A  AAA CA/C
rs27150270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9862109fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC C C     C CCCC TC/T
rs27150269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9862464fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP          A   AA CA/C
rs27150268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9862736fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP          T   TT CC/T
rs27150267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9863446fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA         A   AA CA/C
rs27150266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9863459fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG         C   CG GC/G
rs27150265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9863729fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC         C   CC GC/G
rs27150264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9864505fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP          T   TT CC/T
rs27150263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9864540fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP    A     A   AA GA/G
rs27150262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9864821fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP              GT  G/T
rs27150261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9865826fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP  C       T  CTC CC/T
rs27150260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9866903fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP          A   AG GA/G
rs27150259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9867881fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC C C     T  CTC TC/T
rs6312556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9868733fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP      A C         A/C
rs6314548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869081fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNP      T C         C/T
rs27150258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869224fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs27150257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869354fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC C CCCCCCC TC/T
rs27150256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869556fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs27150255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869636fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG G GGAGGGGGGA/G
rs27150254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869799fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs27150253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869869fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27150252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9869970fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA A AAGAAAAGAA/G
rs27150251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870055fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AGGAAGAGGA/G
rs27150250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870083fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGG  A GGGGGGGGGA/G
rs27150249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870233fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA A AACAAAACAA/C
rs27150248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870272fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG G GGGGGGGCGC/G
rs27150247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870810fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AA   A AGGAAGAGGA/G
rs27150246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870851fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA A ATAAATAATA/T
rs27150245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870893fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC C CCCCCCCGCC/G
rs27150244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9870975fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC G CCCCCCCC C/G
rs27150243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9871154fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs27150242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9871285fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC G CCGCCCCGCC/G
rs27150241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9871610fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
3SNPTTGGGGGG GGGGGGGGGG/T
rs27150240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9872024fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGG  C GG GGGGCGC/G
rs27150239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9872419fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs27150238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9872514fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG G GGGGGGAGGA/G
rs27150237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9872713fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AAGAAAAGGA/G
rs27150236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9872835fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG   GGTGGGGTGG/T
rs27150235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9873249fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA C ACCAACACCA/C
rs27150234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9873314fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
rs27150233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9873331fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC C CCCCCCCCAA/C
rs27150232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9874774fDwh : within coordinates of
Gata3 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG G GAGGGAGGGA/G
rs27150231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9875104fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs27150230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9875895fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs27150229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876242fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs27150228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876278fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG A GGAGGGGAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27150227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876696fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs27150226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876735fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs27150225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876801fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPG GGG  G GGAGGGGAGA/G
rs27150224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876848fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCTTTTCTC/T
rs27150223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876892fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC C CTCCCTCCTC/T
rs27150222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876922fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPA AAAA T ATTAATATTA/T
rs27150221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9876983fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC C    C  CTCCCCTCC/T
rs27150220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9877190fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPT TTTT T TAATTATAAA/T
rs27150219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9877221fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs27150218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9877290fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
Gm13256 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs27150217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9877600fDwh : within coordinates of
Gata3 : mRNA-UTR
Gm13256 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAGGGGGGA/G
rs27150216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9877756fDwh : within coordinates of
Gata3 : mRNA-UTR
Gm13256 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGGGGGAGA/G
rs27150215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9877923fDwh : within coordinates of
Gata3 : mRNA-UTR
Gm13256 : within coordinates of
1SNPC CCCC   CCTCCCCTCC/T
rs27150214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9878074fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
Gm13256 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCTTTTCTC/T
rs27150213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9878115fDwh : within coordinates of
Gata3 : Intron
Gm13256 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs27150212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9879029fDwh : within coordinates of
Gata3 : Locus-Region
1SNPT TTT     TAT TTATA/T
rs27150211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9879355f4930412O13Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : Locus-Region
1SNPA AAAA G AGGAAGAGGA/G
rs27150210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9879389f4930412O13Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : Locus-Region
1SNPC CCCC T CCTCCCCTCC/T
rs27150209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9879498f4930412O13Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : Locus-Region
1SNPC CCCC C CCACCCCCCA/C
rs27150208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9879787f4930412O13Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : Locus-Region
1SNPC CCC  C CCTCCCCCCC/T
rs27150207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9881788f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTCCCCTTC/T
rs27150206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9881835f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs27150205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9882234f4930412O13Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTTTTTTATA/T
rs27150204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9882248f4930412O13Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACAAAACCA/C
rs27150203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9882478f4930412O13Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAGGGGA A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27150202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9883054f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Noncoding-Transcript-Variant
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGGGGGCGC/G
rs27150201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9883288f4930412O13Rik : Intron
9230102O04Rik : Noncoding-Transcript-Variant
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs27150200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9883803f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAA  A  AGA  AGAA/G
rs27150199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9883884f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAA  A  GAAAGA AA/G
rs27150198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9884221f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAAAGGA/G
rs27150197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9884451f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG C GGCGGGGCGC/G
rs27150196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9884499f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPT TTT  C  CCTTCT CC/T
rs27150195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9884746f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTCCCCTTC/T
rs27150194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9884892f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCCCCCTCC/T
rs27150193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885011f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTTTTTTTC/T
rs27150192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885038f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAA    AATAAAATAA/T
rs27150191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885046f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAA  G AAAAAAA AA/G
rs51203352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885179f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNP  T               T
rs27150190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885326f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA A A  A AATAA ATAA/T
rs27150189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885513f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AGGAAGAGGA/G
rs27150188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885697f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCGCCCCGCC/G
rs27150187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9885984f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGTGGGGTGG/T
rs27150186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9886106f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TCTTTTTTTC/T
rs27150185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9886144f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs27150184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9886645f4930412O13Rik : Noncoding-Transcript-Variant
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GTGGGTGGTG/T
rs27150183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9887039f4930412O13Rik : Intron
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGAAAAGAA/G
rs27150182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9887100f4930412O13Rik : Intron
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCGCCCC CC/G
rs27150181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9887155f4930412O13Rik : Intron
9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGCGGGGCGC/G
rs27150180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9888070f9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA   ATTAATATTA/T
rs27150179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9888197f9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AGAAAAAAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27150178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9888393f9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTATTTTATA/T
rs27150177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9888590f9230102O04Rik : Intron
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPC CCC  T C C C C  C/T
rs27150176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9889453f9230102O04Rik : Noncoding-Transcript-Variant
Dwh : within coordinates of
Gata3 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AGAAAGAAGA/G
rs27150175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9890122f9230102O04Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : 88 bp upstream of
1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs27150174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9890572f9230102O04Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : 538 bp upstream of
1SNPG GGGG T GGTGGGGTGG/T
rs27150173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:9890817f9230102O04Rik : Locus-Region
Dwh : within coordinates of
Gata3 : 783 bp upstream of
1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/09/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory