About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Gata1
GATA binding protein 1
MGI:95661

105 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs261329805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957363fGata1 : 1897 bp downstream of1SNP              A   G     A/G
rs33379106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957693fGata1 : 1567 bp downstream of1SNPT TTT T C TTCT  TT   TCTC/T
rs224062641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957772fGata1 : 1488 bp downstream of1SNP              A   G     A/G
rs33379109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957774fGata1 : 1486 bp downstream of1SNPA AAA A G AAAA  AA   AAAA/G
rs33379112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957791fGata1 : 1469 bp downstream of1SNPC CCC C A CCAC  CC   CACA/C
rs33379994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957927fGata1 : 1333 bp downstream of2SNPT TTT T A T ATA TTT  AAAA/T
rs259570778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7957946fGata1 : 1314 bp downstream of1SNP              A   C     A/C
rs33379997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7958059fGata1 : 1201 bp downstream of1SNPA AAA A G A GA  AA   AGAA/G
rs33380000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7958092fGata1 : 1168 bp downstream of1SNPC CCC C C C TC  CC   CTCC/T
rs33380002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7958328fGata1 : 932 bp downstream of1SNPC CCC C C C TC  CC   CCCC/T
rs33381014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7958490fGata1 : 770 bp downstream of1SNPA AAA A G A GA  AA   AGAA/G
rs33381016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7958607fGata1 : 653 bp downstream of1SNPC CCC C C C CC  CC   CCTC/T
rs33381019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959154fGata1 : Locus-Region1SNPG GGG G A G GG  GG   GGGA/G
rs33381022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959226fGata1 : Locus-Region1SNPG GGG G A G AG  GG   GAGA/G
rs33381865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959255fGata1 : Locus-Region1SNPC CCC C T C CC  CC   CCCC/T
rs33381868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959322fGata1 : mRNA-UTR1SNPT TTT T C T CT  TT   TCTC/T
rs226510203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959337fGata1 : mRNA-UTR1SNP              C   T     C/T
rs108832024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959635fGata1 : mRNA-UTR1SNP          G         A   A/G
rs108261705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959826fGata1 : Coding-Synonymous2SNP          T   C   T C   C/T
rs108479523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959832fGata1 : Coding-Synonymous1SNP          C         T   C/T
rs33381871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7959853fGata1 : Coding-Synonymous2SNPA AAA A G A GA  AA  GAGAA/G
rs33376264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7960033fGata1 : Coding-Synonymous2SNPA AAA A T A TA  AA  TATAA/T
rs33376267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7960429fGata1 : Intron2SNPG GGG G C G GGA GGG  G GA/C/G
rs236881756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7960563fGata1 : Intron1SNP              T   C     C/T
rs33376270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7960622fGata1 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C C C GC  CC   CGCC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33376273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7960685fGata1 : Coding-Synonymous1SNPG GGG G G G AG  GG   GAGA/G
rs252282488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7960897fGata1 : Intron1SNP              A   G     A/G
rs33376976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7961403fGata1 : Intron1SNPA AAA A T A TA  AA   ATAA/T
rs213074152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7961807fGata1 : Intron1SNP              G   A     A/G
rs235654360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7961811fGata1 : Intron1SNP              G   A     A/G
rs33376979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962328fGata1 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C   C GC  CC   CGCC/G
rs33376981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962377fGata1 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGG G G G AG  GG   GGGA/G
rs33377884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962693fGata1 : Intron2SNPG GGG G T G TGT GGG  GTGG/T
rs33377885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962761fGata1 : Intron2SNPA AGA A G A GGG AAA  GGGA/G
rs33377887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962790fGata1 : Intron1SNPA AAA A G A GA  AA   AGAA/G
rs33377889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962841fGata1 : Intron2SNPT TCT T T T TCC TTT  CTCC/T
rs33377892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7962865fGata1 : Intron1SNPA AAA A A A GA  AA   AGAA/G
rs33378895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7963136fGata1 : Coding-Synonymous2SNPA AGA A G A GGG AAA  GGGA/G
rs33378898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7963523fGata1 : Intron1SNPT TTT T C T CT  TT   TCTC/T
rs33378899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7963663fGata1 : Intron1SNPC CCC C C C TC  CC    TCC/T
rs33378901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7964563fGata1 : Intron1SNPA AAA   G A GA  AA   AGAA/G
rs33378903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7965005fGata1 : Intron1SNPG GGG   G G A   GG    AGA/G
rs33379925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7965226fGata1 : Intron1SNPG GGG G A G AG  GG   GAGA/G
rs8238247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7965454rGata1 : Intron1SNP  TT TTTC      T   T    C/T
rs8238246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7965471rGata1 : Intron1IN-DEL  CC CCCC      -   C    -/C
rs8238245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7965474rGata1 : Intron1IN-DEL   - --        C   -    -/C
rs8238244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7965491rGata1 : Intron1SNP  CC CCCT      C   C    C/T
rs223551451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966178fGata1 : Intron1SNP              A   C     A/C
rs33379927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966340fGata1 : Intron1SNPT TTT T T T TT  TT   TGTG/T
rs241577154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966452fGata1 : Intron1SNP              C   A     A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs264924166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966463fGata1 : Intron1SNP              A   T     A/T
rs222174691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966464fGata1 : Intron1SNP              A   T     A/T
rs33379930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966651fGata1 : Intron1SNPG GGG G G G CG  GG   GCGC/G
rs33379933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966710fGata1 : Intron1SNPC CCC C T C CC  CC   CCCC/T
rs33380825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7966909fGata1 : Intron1SNPT TTT T C T TT  TT   TTTC/T
rs33380827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7967349fGata1 : Intron1SNPT TTT T A T AT  TT   TATA/T
rs33380829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968081fGata1 : Locus-Region1SNPG GGG G A G GG  GG   GGGA/G
rs240644277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968568fGata1 : Locus-Region1SNP              A   G     A/G
rs33380832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968648fGata1 : Locus-Region1SNPA AAA A A A GA  AA   AGAA/G
rs33382004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968674fGata1 : Locus-Region1SNPA AAA A G AAGA  AA   AGAA/G
rs259633659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968820fGata1 : Locus-Region1SNP              G   A     A/G
rs226569086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968855fGata1 : Locus-Region1SNP              T   G     G/T
rs257807604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7968948fGata1 : Locus-Region1SNP              A   C     A/C
rs33382006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7969180fGata1 : Locus-Region1SNPT TTT T T T CT  TT   TCTC/T
rs33382008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7969383fGata1 : Locus-Region1SNPA AAA A   A CA  AA   ACAA/C
rs33382009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7969888fGata1 : within coordinates of1SNPC CCC C T C TC  CC   CTCC/T
rs33382012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7970394fGata1 : within coordinates of1SNPG GGG G   G AG  GG   GAGA/G
rs33383065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7970524fGata1 : within coordinates of1SNPG GGG G   G AG  GG   GAGA/G
rs262355564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7970643fGata1 : within coordinates of1SNP              A   C     A/C
rs33383068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7970889fGata1 : within coordinates of2SNPC CTC C   C CTT CCC  TCTC/T
rs33383071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7970904fGata1 : within coordinates of1SNPA AAA A   A GA  AA   AGAA/G
rs33383874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7971190fGata1 : within coordinates of1SNPT TTT T C T CT  TT   TCTC/T
rs33376306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7971204fGata1 : within coordinates of1SNPA AAA A   A TA  AA   ATAA/T
rs238952753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7972216fGata1 : within coordinates of1SNP              G   T     G/T
rs33376309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7972621fGata1 : within coordinates of1SNPT TTT T C T  T  TT   TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs212776724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7972982fGata1 : within coordinates of1SNP              C   T     C/T
rs235409593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7973389fGata1 : within coordinates of1SNP              T   A     A/T
rs249014661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7973392fGata1 : within coordinates of1SNP              A   T     A/T
rs47521015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7973456fGata1 : within coordinates of1SNP GG                     G
rs33376311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7973553fGata1 : within coordinates of1SNPG GGG G G GG G  GG   GTGG/T
rs33377244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7973982fGata1 : within coordinates of1SNPC CCC C C C TC  CC   CTCC/T
rs33377247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974040fGata1 : within coordinates of2SNPC CGC C   C  G  CC   C CC/G
rs33377250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974117fGata1 : within coordinates of2SNPA AGA     A  GG AAA  A AA/G
rs33377253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974148fGata1 : within coordinates of1SNPA AAA A A A GA  AA   AGAA/G
rs238755989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974163fGata1 : within coordinates of1SNP              A   C     A/C
rs33378066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974169fGata1 : within coordinates of1SNPT TTT T T T TT  TT   TGTG/T
rs33378069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974277fGata1 : within coordinates of1SNPA AAA A   A GA  AA   AGAA/G
rs33378072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974332fGata1 : within coordinates of1SNPT TTT T T TTTT  TT   TCTC/T
rs262044950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974497fGata1 : within coordinates of1SNP              G   A     A/G
rs33378865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974593fGata1 : within coordinates of1SNPT TAT T   T TA  TT    TTA/T
rs33378868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7974973fGata1 : within coordinates of1SNPA AAA A A A GA  AA   AGAA/G
rs31359008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7975531rGata1 : within coordinates of3SNP AG    G      A   G     A/G
rs236763271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7975581fGata1 : within coordinates of1SNP              A   G     A/G
rs33378871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7975829fGata1 : within coordinates of1SNPG GGG G   G TG  GG   GTGG/T
rs6220005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7976117fGata1 : within coordinates of1SNP       A T              A/T
rs249259800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7976327fGata1 : within coordinates of1SNP              T   C     C/T
rs6221559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7976401fGata1 : within coordinates of1SNP       T C              C/T
rs48212613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7976715fGata1 : within coordinates of1SNP                    G   G
rs31203211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7977462rGata1 : within coordinates of3SNPAAG    G  G   A   G     A/G
rs31167765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7977469rGata1 : within coordinates of2SNPCCA    A  A   C   A     A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33379704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7977878fGata1 : within coordinates of1SNPG GGG G G G TG  GG   GGGG/T
rs253017848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7979673fGata1 : 1602 bp upstream of1SNP              A   G     A/G
rs108095843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7979867fGata1 : 1796 bp upstream of3SNP  G    A  G         A   A/G
rs31298843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7979914rGata1 : 1843 bp upstream of2SNP T     C                C/T
rs31160559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7980006rGata1 : 1935 bp upstream of4SNPCCACA AAC A CCC CAA  CCCA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/16/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory