About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Lrrc8a
leucine rich repeat containing 8A
MGI:2652847

48 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27209239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30236593fDwh : within coordinates of
Lrrc8a : Locus-Region
1SNPC CCCC C CCGCCC CGCC/G
rs27209238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30248975fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC C CCTCCC CTCC/T
rs27209237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30249264fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT TTTT T TTGTTT TGTG/T
rs27209236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30249664fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC    C   CC CCC CGCC/G
rs27209235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30250249fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT TTTT G TTGTTT TGTG/T
rs27209234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30250415fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPG GGGG   GGAGGG GAGA/G
rs27209233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30250424fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs27209232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30251056fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT  TTT A TTATTT TATA/T
rs27209231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30252268fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC C CC CCC CGCC/G
rs27209230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30252352fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPG GGGG G GGAGGG GAGA/G
rs27209229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30252389fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs27209228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30252528fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPA AAAA A AACAAA ACAA/C
rs27209227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30253029fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPA   AA A A GAAA AGAA/G
rs27209226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30253642fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC C CCCCCC CTCC/T
rs27209225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30253784fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPA AAAA A  AGAAA AGAA/G
rs27209224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30255241fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPT  TTT T TTGTTT TGTG/T
rs27209223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30255484fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPA  AAA A AAGAAA AGAA/G
rs27209222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30255499fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC C  CTCCC CTCC/T
rs27209221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30255865fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs27209220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30256165fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs27209219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30256273fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPC CCC  C CT CCC CCCC/T
rs27209218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30256540fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG G GGTGGG GTGG/T
rs27209217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30257318fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG G GGGGGG GAGA/G
rs27209216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30257426fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT CCCC C CCCCCC CCCC/T
rs6166730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30258437fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
2SNPC CCCCCCTCCTCCC CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27209215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30258568fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC C CCTCCC CCCC/T
rs6169045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30258884fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
2SNPT T  TTCC TC TT TCTC/T
rs6169524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30258933fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNP      T C          C/T
rs27209214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30259250fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT T TT G TTG TT TGTG/T
rs27209213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30259600fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC T CCCCCC CCCC/T
rs27209212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30259892fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPA AAAA G AA AAA AGAA/G
rs27209211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30260176fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPA AAAA G  AGAAA AGAA/G
rs27209210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30260208fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT TTTT C  TTT T TTTC/T
rs27209209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30260248fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPG GGGG    GAG G GAGA/G
rs27209208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30260303fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPC CCCC C CCACCC CCCA/C
rs27209207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30261419fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Intron
1SNPT TTTT C TTCTTT TCTC/T
rs27209206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30262012fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA A  AAA A ATAA/T
rs27209205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30263328fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : mRNA-UTR
1SNPG  GGG    GAG    AGA/G
rs27209204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30263508fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : mRNA-UTR
1SNPG GGGG A  GGG G GAGA/G
rs27209203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30263980fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : Locus-Region
1SNPG GGGG A GGGGGG GGGA/G
rs27209202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30264585fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 795 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
1SNPC CCCC T  CCCCC CCCC/T
rs27209201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30264599fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 809 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
1SNPC CCCC C  CTC C CTCC/T
rs27209200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30264609fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 819 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
1SNPG GGGG A  GGG G GGGA/G
rs27209199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30264882fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 1092 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
1SNPC  CCC C  CGC C CGCC/G
rs27209198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30264910fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 1120 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
1SNPG  GGG A  GAG G GAGA/G
rs27209197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30265142fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 1352 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
1SNPC CCCC C  CTC C CTCC/T
rs27209196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30265605fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 1815 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
2SNPGGGGGG T GGTG GTGTGG/T
rs27209195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:30265638fDwh : within coordinates of
Gm28035 : within coordinates of
Lrrc8a : 1848 bp downstream of
Phyhd1 : Locus-Region
2SNPGGGGGG T GGTG GTGTGG/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory