About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Emx2
empty spiracles homeobox 2
MGI:95388

51 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30805165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59456570fEmx2 : 1802 bp upstream of
Emx2os : Intron
1SNP CC   T C          C/T
rs3659728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59456601fEmx2 : 1771 bp upstream of
Emx2os : Intron
4SNPGGG   A G   G  A   A/G
rs3660180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59456609fEmx2 : 1763 bp upstream of
Emx2os : Intron
4SNPCCC   T C   C  T   C/T
rs30961291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59457591fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Intron
3SNP  T   A T   T  T   A/T
rs30310891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59457592fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Intron
2SNP  A   G A   A  A   A/G
rs30661952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59457781fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Intron
3SNP  A   T A   A  A   A/T
rs30757848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59457807fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Intron
3SNP  G   A G   G  G   A/G
rs30640521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59457832fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Intron
3SNP AA   T A   A  A   A/T
rs50066458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59458200fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP G      G   G  C   C/G
rs52189206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59458303fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP A      A   T  A   A/T
rs46716233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59458538fEmx2 : Locus-Region
Emx2os : Noncoding-Transcript-Variant
2SNP GG     G   G  A   A/G
rs50155758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59459807fEmx2 : Intron
Emx2os : Locus-Region
2SNP AA     A   A  A   A
rs47514099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59459840fEmx2 : Intron
Emx2os : Locus-Region
2SNP GG     G   G  G   G
rs47960997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59459916fEmx2 : Intron
Emx2os : Locus-Region
2SNP TT     T   T  T   T
rs30789342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59460144fEmx2 : Intron
Emx2os : Locus-Region
3SNP GG   T G   G  G   G/T
rs48121114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59460158fEmx2 : Intron
Emx2os : Locus-Region
2SNP CC     C   C  C   C
rs30323693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59460732fEmx2 : Intron3SNP TT   C T   T  T   C/T
rs31278778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59460829fEmx2 : Intron3SNP GG   A G   G  G   A/G
rs30570856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461009fEmx2 : Intron3SNP GG   T G   G  G   G/T
rs31054475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461163fEmx2 : Intron3SNP C    A C   C  C   A/C
rs30359007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461232fEmx2 : Intron3SNP A    T A   A  A   A/T
rs48360074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461328fEmx2 : Intron2SNP T      T   T  T   T
rs50090045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461424fEmx2 : Intron2SNP T          T  T   T
rs248886487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461475fEmx2 : Intron1SNP            G  T   G/T
rs254574181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461476fEmx2 : Intron1SNP            C  G   C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30708190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59461939fEmx2 : Intron3SNP GG   C G   G  G   C/G
rs30455342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59462216fEmx2 : Intron3SNP AA   G A   A  A   A/G
rs30563241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59462290fEmx2 : Intron3SNP AA   G A   A  A   A/G
rs31129332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59462439fEmx2 : Intron3SNP  T   C T   T  T   C/T
rs30918219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59462994fEmx2 : Intron3SNPA A   G A   A  A   A/G
rs30985277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463113fEmx2 : Intron3SNPC C   A C   C  C   A/C
rs30900409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463171fEmx2 : Intron3SNPA A   C A   A  A   A/C
rs30997728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463199fEmx2 : Intron3SNPT T   C T   T  T   C/T
rs31053169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463220fEmx2 : Intron3SNPC C   T C   C  C   C/T
rs50618347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463380fEmx2 : Intron2SNP        T   T  T   T
rs51953134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463399fEmx2 : Intron2SNP        C   C  C   C
rs50887254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463412fEmx2 : Intron2SNP        C   C  C   C
rs45945242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463476fEmx2 : Intron2SNP        A   A  A   A
rs52457605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463606fEmx2 : Intron2SNP AA     A   A  A   A
rs50363411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463648fEmx2 : Intron2SNP GG     G   G  G   G
rs46925028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463711fEmx2 : Intron2SNP CC     C   C  C   C
rs49000214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59463798fEmx2 : Intron2SNP GG         G  G   G
rs48902766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59464069fEmx2 : mRNA-UTR2SNP GG         G  G   G
rs241538368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59464219fEmx2 : mRNA-UTR1SNP            A  T   A/T
rs30985850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59464753fEmx2 : mRNA-UTR3SNPGGG   T G   G  T   G/T
rs30457485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59465489fEmx2 : Locus-Region3SNP  G   A G   G  G   A/G
rs47528851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59465619fEmx2 : Locus-Region1SNP  C                C
rs31002799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59465758fEmx2 : Locus-Region3SNP  G   A G   G  G   A/G
rs30355747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59466555fEmx2 : 1198 bp downstream of4SNPAAAAAACAAACAACAAACCA/C
rs36532555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59466712fEmx2 : 1355 bp downstream of1SNPT TTTT TTTTT CT TTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30696740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:59466821fEmx2 : 1464 bp downstream of4SNPGGGGGGAGGGAGGGGGGGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/19/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory