About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Iqcb1
IQ calmodulin-binding motif containing 1
MGI:2443764

31 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs38351097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36826765fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Locus-Region
1SNP  A              A   GAA/G
rs37019104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36827822fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Locus-Region
1SNPT TTT   T TTT   TT  TCTC/T
rs8242704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36828121rEaf2 : Intron
Iqcb1 : Locus-Region
1IN-DEL  - --  --   -C    -   -/C
rs8242705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36829332rEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNP  T    TTT    CT  TT   C/T
rs37394543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36829787fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TTT T TTTCT   TT  T TC/T
rs8242714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36830222rEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNP  GG GG  G   GAG   G   A/G
rs38384415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36832214fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGAG   GG  GGGA/G
rs37443901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36833174fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGTG   GG  G GG/T
rs36618700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36834920fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPC       CCCTC   C   CCCC/T
rs38646096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36835472fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPC CCC C CCCTC   CC  C CC/T
rs36611347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36836170fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPC CCC C CCCTC   CC  CCCC/T
rs36565137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36841280fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPA AA  A AAATA    A  A AA/T
rs37029937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36842476fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPC CCC C CCCCC    C  CTCC/T
rs36619629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36843748fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPA AA  A AAAGA   AA  AAAA/G
rs36872008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36848306fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TT  T TTTCT    T  TCTC/T
rs38035109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36849060fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TTT T TTTCT   TT  TCTC/T
rs36311348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36849098fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TT  T TTTTT    T  TCTC/T
rs36594258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36849150fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPC CCC C CCCTC    C  CCCC/T
rs4173868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36851452fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
2SNP CA    A A             A/C
rs4173869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36851456fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
2SNP CC    A A             A/C
rs38616242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36853091fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGGG   GG  GAGA/G
rs37653483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36856254fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TTT T TTTCT   TT  TCTC/T
rs37975370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36856929fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPA AAA A AAAGA   AA  AGAA/G
rs36761019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36857154fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGGG   GG  GAGA/G
rs36483181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36857286fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPA AAA A AAAGA   AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs38616107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36857394fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGGG   GG  GAGA/G
rs37375859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36858258fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGTG    G  GTGG/T
rs39130108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36858949fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPG GGG G GGGCG   GG  GGGC/G
rs37092615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36859108fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TTT T TTTGT   TT  TTTG/T
rs36452048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36860095fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPA AAA A AAAAA   AA  ATAA/T
rs36310204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:36860861fEaf2 : Intron
Iqcb1 : Intron
1SNPT TTT T TTTCT   TT  TCTC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory