About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Lefty2
left-right determination factor 2
MGI:2443573

139 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs261843060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891149fLefty2 : Locus-Region1SNP            A  C    A/C
rs224939164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891478fLefty2 : Locus-Region1SNP            C  T    C/T
rs32736497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891574fLefty2 : Locus-Region1SNPA AAAA AAAGA AA  AAAA/G
rs32736500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891703fLefty2 : Locus-Region1SNPT TTTT TTTAT TT  TTTA/T
rs32736503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891712fLefty2 : Locus-Region1SNPC CCCC CCCCC CC  CACA/C
rs31140722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891732fLefty2 : Locus-Region1SNP TC   T T           C/T
rs32517166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891736fLefty2 : Locus-Region1SNP TA   T T           A/T
rs32309179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891767fLefty2 : Locus-Region2SNPCCTCCCCCCCCC CC  CCCC/T
rs247730141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891797fLefty2 : Locus-Region1SNP            A  G    A/G
rs264427482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891803fLefty2 : Locus-Region1SNP            G  A    A/G
rs31711057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891808fLefty2 : Locus-Region2SNP AT   A A           A/T
rs32685156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891821fLefty2 : Locus-Region4SNPCCTCCCCTCC CTCCC CTCC/T
rs32730704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891853fLefty2 : Locus-Region1SNPA AAAA  AAGA AA  AGAA/G
rs32730707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891931fLefty2 : Locus-Region1SNPG GGGG GGGTG GG  GGGG/T
rs32730709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180891987fLefty2 : Locus-Region1SNPG GGGG GGGAG GG  GGGA/G
rs32117012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892012fLefty2 : Locus-Region4SNPT ATTTT TTATATTT T TA/T
rs32731644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892074fLefty2 : Locus-Region1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs32731646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892167fLefty2 : Locus-Region1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs30894791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892208fLefty2 : Locus-Region4SNPA GAAAA AAGAGAAA AAAA/G
rs32731650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892367fLefty2 : Locus-Region2SNPT  TTT TTTTTCTTT TCTC/T
rs31763820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892370fLefty2 : Locus-Region2SNP  T     G           G/T
rs251572212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892510fLefty2 : Locus-Region1SNP            T  C    C/T
rs32731653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892541fLefty2 : Locus-Region2SNPT TTTT TTT TCTTT TCTC/T
rs31689640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892544fLefty2 : Locus-Region3SNPA GAAA AAAGA AA  AAAA/G
rs32732767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892626fLefty2 : Locus-Region2SNPT TTTT TTTGTGTTT TGTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs257666111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892655fLefty2 : Locus-Region1SNP            G  A    A/G
rs217785659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892723fLefty2 : Locus-Region1SNP            T  C    C/T
rs235810643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892738fLefty2 : Locus-Region1SNP            T  C    C/T
rs30945912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892742fLefty2 : Locus-Region3SNPTTGTTTT TTTT TT  TTTG/T
rs250772163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892748fLefty2 : Locus-Region1SNP            A  G    A/G
rs32541535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892826fLefty2 : Locus-Region4SNPGGCGGGGCGGCGCGGG GCGC/G
rs32732772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180892894fLefty2 : Locus-Region2SNPC CCCC TCCCCTCCC CTCC/T
rs32734075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893145fLefty2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT TTTCT TT  TTTC/T
rs32734078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893155fLefty2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT CTTTT TT  TTTC/T
rs256883199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893156fLefty2 : mRNA-UTR1SNP            G  A    A/G
rs32734081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893168fLefty2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs32734083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893426fLefty2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT CTTCT TT  TTTC/T
rs32734816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893500fLefty2 : Intron1SNPA AAAA GAAGA AA  AAAA/G
rs32734819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893618fLefty2 : Intron2SNPG GGGG AGG GAGGG GAGA/G
rs32734821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893703fLefty2 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs32734822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893779fLefty2 : Intron1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs244781756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893808fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs32735794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893833fLefty2 : Intron1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs31625840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893886fLefty2 : Intron1SNP CG   C C           C/G
rs32734435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893906fLefty2 : Intron1SNP TC   T T           C/T
rs32384976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893950fLefty2 : Intron4SNPTTCTTTTTTTTTCTTT TCTC/T
rs30569083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180893978fLefty2 : Intron3SNP CG   C C   G  C    C/G
rs32735797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894034fLefty2 : Intron1SNPG GGGG GGGAG GG  GGGA/G
rs236566465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894058fLefty2 : Intron1SNP            C  T    C/T
rs32735798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894095fLefty2 : Intron1SNPA AAAA AAAGA AA  A AA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32735800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894155fLefty2 : Coding-NonSynonymous1SNP  AAAA AAAGA AA  AAAA/G
rs32735802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894190fLefty2 : Coding-Synonymous2SNPA AAAA  AACACAAA ACAA/C
rs32041325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894235fLefty2 : Coding-Synonymous3SNPGGCGGGGGGGCG GG  GCGC/G
rs32737146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894274fLefty2 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC CCCGC CC  CCCC/G
rs32737149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894537fLefty2 : Intron1SNP  TTTT CTTCT TT  TCTC/T
rs31843294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894569fLefty2 : Intron2SNP TC                 C/T
rs32737152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894591fLefty2 : Intron2SNPCCTCCC CCCCC CC  CCCC/T
rs30502544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894764fLefty2 : Coding-Synonymous2SNP GT                 G/T
rs219964725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894782fLefty2 : Coding-Synonymous1SNP            T  C    C/T
rs247039917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894879fLefty2 : Intron1SNP            A  C    A/C
rs32737785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894938fLefty2 : Intron2SNPA AAAA AAAGAGAAA AGAA/G
rs32737786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180894953fLefty2 : Intron1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs233140872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895160fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs31488957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895207fLefty2 : Intron2SNP TG   T T           G/T
rs32324364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895224fLefty2 : Intron2SNP AC   A A   C  A    A/C
rs261556723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895326fLefty2 : Intron1SNP            A  G    A/G
rs228874548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895337fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs244524657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895379fLefty2 : Intron1SNP            G  T    G/T
rs212310636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895412fLefty2 : Intron1SNP            C  T    C/T
rs237303316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895544fLefty2 : Intron1SNP            C  A    A/C
rs254906627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895547fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs216425238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895653fLefty2 : Intron1SNP            G  A    A/G
rs239560782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895787fLefty2 : Intron1SNP            G  T    G/T
rs252978160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180895795fLefty2 : Intron1SNP            A  G    A/G
rs221921767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896177fLefty2 : Intron1SNP            A  G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs230661741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896243fLefty2 : Intron1SNP            G  A    A/G
rs248166064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896354fLefty2 : Intron1SNP            A  G    A/G
rs222935838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896373fLefty2 : Intron1SNP            A  T    A/T
rs242995788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896468fLefty2 : Intron1SNP            T  A    A/T
rs265115290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896510fLefty2 : Intron1SNP            A  G    A/G
rs225187092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896546fLefty2 : Intron1SNP            C  T    C/T
rs247868048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896555fLefty2 : Intron1SNP            A  T    A/T
rs261352253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896656fLefty2 : Intron1SNP            A  G    A/G
rs228597437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896678fLefty2 : Intron1SNP            A  T    A/T
rs244596960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896696fLefty2 : Intron1SNP            G  A    A/G
rs256383580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896751fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs231452854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896792fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs251017191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180896915fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs216900223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897164fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs32485198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897165fLefty2 : Intron3SNP  G   A     G  A    A/G
rs247116887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897222fLefty2 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs216338250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897289fLefty2 : Intron1SNP            G  A    A/G
rs32731035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897290fLefty2 : Intron2SNPT TTTT  TTC CTTT T TC/T
rs248113181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897404fLefty2 : Intron1SNP            C  T    C/T
rs223432237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897408fLefty2 : Intron1SNP            C  T    C/T
rs32731038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897476fLefty2 : Coding-NonSynonymous1SNP  CTTT   TCT TT  TCTC/T
rs32731041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897582fLefty2 : Coding-Synonymous3SNPG AGGG GGGAG GG  GGGA/G
rs32731043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897615fLefty2 : Coding-Synonymous3SNPA GAAA AAAGA AA  AAAA/G
rs32731886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897682fLefty2 : Coding-Synonymous2SNPT CTTT CTTCT TT  TCTC/T
rs32731888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897699fLefty2 : Coding-Synonymous2SNP  CCT  CCTC  TT  TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32731891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897819fLefty2 : mRNA-UTR3SNPC TCCC  CCCCTCCC CTCC/T
rs32732434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897829fLefty2 : mRNA-UTR3SNPA CAAA  AAAACAAA ACAA/C
rs32732436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897865fLefty2 : mRNA-UTR2SNPT ATTT ATTTTATTT TTTA/T
rs32732439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180897912fLefty2 : mRNA-UTR1SNPG GGGG GGGAG GG  GGGA/G
rs48698350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898003fLefty2 : mRNA-UTR2SNP  C     G   C  G    C/G
rs32732442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898006fLefty2 : mRNA-UTR3SNPT GTTT  TTGTGTTT TGTG/T
rs32733305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898029fLefty2 : mRNA-UTR2SNPA  AAA  A T TAAA AAAA/T
rs238150448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898043fLefty2 : mRNA-UTR1SNP            G  A    A/G
rs32733307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898098fLefty2 : mRNA-UTR3SNPC ACCC  CCTCACCC CCCA/C/T
rs32733310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898194fLefty2 : mRNA-UTR3SNPCCACCC ACCCCACCC CCCA/C
rs32733313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898232fLefty2 : mRNA-UTR2SNPA  GAA  AAA GAAA A AA/G
rs32734066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898268fLefty2 : mRNA-UTR1SNP  TTTT ATTTT TT   TTA/T
rs32734069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898309fLefty2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs32734072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898464fLefty2 : mRNA-UTR2SNPTTTTTT CTTCT TT CTTTC/T
rs32734775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898583fLefty2 : mRNA-UTR2SNPAAAAAA AAAGA AA GAAAA/G
rs32734778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898769fLefty2 : mRNA-UTR2SNPT TTTT  T A  T  A T A/T
rs32734781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180898820fLefty2 : mRNA-UTR3SNPG AA G    A AG G  AAA/G
rs32735584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899284fLefty2 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs32316737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899386fLefty2 : Intron4SNPCCTTCCC CCCCTCCC CCCC/T
rs32703468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899466fLefty2 : Intron4SNPGGTTGGGGGGGGTGGG GGGG/T
rs32735590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899561fLefty2 : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TTTC/T
rs32735593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899604fLefty2 : 501 bp downstream of1SNPG GGGG AGGGG GG  GGGA/G
rs32736256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899769fLefty2 : 666 bp downstream of1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs31435978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899873fLefty2 : 770 bp downstream of4SNPAATTAA TTATATAAA ATAA/T
rs32392627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899946fLefty2 : 843 bp downstream of1SNP TC     T           C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46831616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180899980fLefty2 : 877 bp downstream of1SNP AT                 A/T
rs31358654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900015fLefty2 : 912 bp downstream of1SNP GT     G           G/T
rs32317846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900066fLefty2 : 963 bp downstream of3SNP CT     C   T  C    C/T
rs31531290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900154fLefty2 : 1051 bp downstream of4SNPCCTTCCC CCCCTCCC CTCC/T
rs32736263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900158fLefty2 : 1055 bp downstream of1SNPC CCCC ACCCC CC  CACA/C
rs32473818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900341fLefty2 : 1238 bp downstream of4SNPT CCTTTCTTCTCTTT TCTC/T
rs32736946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900450fLefty2 : 1347 bp downstream of1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs32736948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900575fLefty2 : 1472 bp downstream of1SNPA AAAA AAACA AA  AAAA/C
rs32731184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900624fLefty2 : 1521 bp downstream of1SNPA AAAA AAAGA AA  AAAA/G
rs32571280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900750fLefty2 : 1647 bp downstream of3SNP  T   A A   T  A    A/T
rs32731186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900874fLefty2 : 1771 bp downstream of1SNPC CCCC CCCTC CC  CCCC/T
rs32676993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900912fLefty2 : 1809 bp downstream of4SNPC TT  CCC T T CC C  C/T
rs31701020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180900998fLefty2 : 1895 bp downstream of3SNP  A   C C   A  C    A/C
rs30753272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:180901039fLefty2 : 1936 bp downstream of3SNP  C   T C   C  T    C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory