About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Setx
senataxin
MGI:2443480

165 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51442256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29123270fDwh : within coordinates of
Setx : Locus-Region
1SNP AA      A       T   A/T
rs52227296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29123468fDwh : within coordinates of
Setx : Locus-Region
1SNP AA      A       T   A/T
rs52229238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29123501fDwh : within coordinates of
Setx : Locus-Region
1SNP TT      T       C   C/T
rs27195633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29123795fDwh : within coordinates of
Setx : Locus-Region
1SNP                G A  A/G
rs27195632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29124299fDwh : within coordinates of
Setx : Locus-Region
1SNP                  AG A/G
rs27195631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29126763fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP           T      TC C/T
rs27195630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29128669fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP           C      AC A/C
rs27195629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29130826fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP           G      TG G/T
rs27195628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29131341fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP           G      CG C/G
rs32899519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29133298fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
2SNPAAG   G  G           A/G
rs27195627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29135008fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  TTTT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29135038fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  TT   C TT T  TT T TC/T
rs27195625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29135094fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AAAA G AAAA  AA AAAA/G
rs27195624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29136285fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  A AA C AAC   AA ACAA/C
rs27195623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29136504fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  GGGG G GGTG  GG GTGG/T
rs27195622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29136557fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AAAA C AACA  AA ACAA/C
rs27195621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29136802fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  T TT   TTAT  TT TATA/T
rs27195620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29136871fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AAAA G AAGA  AA AGAA/G
rs27195619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29136914fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  TTTT C TTT   TT TTTC/T
rs27195618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29137466fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP   C     ACA   AA A AA/C
rs27195617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29137593fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  GGT    TGGG  TT TGGG/T
rs27195616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29137601fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AAAA G AA A  AA AGAA/G
rs27195615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29137625fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  TTTT G TTTT  TT TTTG/T
rs27195614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29138100fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29138382fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AA A G A G   AA AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27195612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29139066fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  GGGG   G  G  GG GAGA/G
rs6267246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29139636fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP      G A            A/G
rs27195611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29139809fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  T T  C TTT   TT TTTC/T
rs27195610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29139893fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  ACCC   ACA   AA A CA/C
rs27195609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29140075fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP     C C A CA  AA ACAA/C
rs27195608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29140443fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  TTTT A T T   TT TTTA/T
rs27195607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29141012fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  CCCC   CCGC  CC C CC/G
rs27195606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29141429fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  TTTT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29141514fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  T TT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29141785fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AAAA G AAGA  AA AGAA/G
rs27195603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29143342fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  GGGG A GGAG  GG GAGA/G
rs27195602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29143909fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNP  TTTT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29144425fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29144467fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  AAAA   AAT    A ATAA/T
rs27195599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29145560fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPT TTTT A TTTT  TT TTTA/T
rs27195598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29145800fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG G GGTG  GG GTGG/T
rs27195597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29145900fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29146015fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC G C GC  CC CGCC/G
rs27195595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29146110fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPA AAAA C AAAA  AA AAAA/C
rs27195594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29146313fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29146613fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPC CCCC G CCGC  CC CGCC/G
rs27195592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29146671fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPA AAAA G AAGA  AA AGAA/G
rs27195591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29147026fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPT TTTT A TTAT  TT TATA/T
rs27195590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29147858fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29147941fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27195588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29148412fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNP  AAAA G AAA   AA AAAA/G
rs27195587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29148826fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP  GGGG C  GGG     GGGC/G
rs27195586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29149137fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29149870fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA C AACA  AA ACAA/C
rs27195584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29150189fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA G AAAA  AA AAAA/G
rs27195583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29150612fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29151300fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AA A G AAA   AA AAAA/G
rs27195581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29152100fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG T GGGG  GG GGGG/T
rs27195580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29155170fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC C CCTC  CC CTCC/T
rs27195579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29155643fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC C CCAC  CC CACA/C
rs27195578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29155691fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA   AAGA  AA AGAA/G
rs27195577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29156302fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29156434fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC A CCAC  CC CACA/C
rs27195575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29156485fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29156522fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT A TTAT  TT TATA/T
rs27195573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29157076fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29157184fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29157291fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29157311fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG G GGAG  GG GAGA/G
rs27195569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29157377fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG G GGC    G GCGC/G
rs27195568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29157846fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
2SNPAAAAAA G AAGA  AAGAGAA/G
rs27195567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29158044fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
2SNPCCCCCC T CCTC  CCTCTCC/T
rs27195566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29158823fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159153fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG C GGGG  GG GGGC/G
rs27195564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159321fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA G AAGA  AA AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27195563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159365fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC C CCTC  CC CTCC/T
rs27195562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159383fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC G CCCC  CC CCCC/G
rs27195561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159586fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT T TTCT  TT TCTC/T
rs27195560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159694fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG G GGAG  GG GAGA/G
rs27195559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29159813fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA A AAGA  AA AAAA/G
rs49205074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29160215fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP TC      C           C/T
rs27195558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29160308fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCTC  CC CTCC/T
rs27195557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29160644fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29160775fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29160884fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG   GGAG  GG GAGA/G
rs27195554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161070fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA T AAAA  AA AAAA/T
rs27195553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161081fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA A AACA  AA ACAA/C
rs27195552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161161fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TT T  TT T TC/T
rs27195551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161209fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTCT  TT TCTC/T
rs27195550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161281fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161284fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC C CCAC  CC CACA/C
rs27195548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161387fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161449fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP   AAA C          AAAA/C
rs27195546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29161620fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29162079fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG C GGGG  GG GGGC/G
rs27195544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29162527fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC A CCCC  CC CCCA/C
rs27195543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29162706fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG T GGTG  GG GTTG/T
rs27195542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29162888fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29163255fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCTC  CC CTCC/T
rs27195540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29163815fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27195539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164075fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG C GGGG  GG GGGC/G
rs27195538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164497fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164554fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG C GGGG  GG GGGC/G
rs27195536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164725fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164783fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC   CCGC  CC CGCC/G
rs27195534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164806fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29164915fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29165377fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA C AAAA  AA AAAA/C
rs27195531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29165414fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29165650fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29166614fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG A GGAG  GG GAGA/G
rs27195528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29168353fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29168378fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA A AACA  AA ACAA/C
rs27195526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29168385fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA G AAAA  AA AAAA/G
rs27195525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29169465fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT      A       TT TATA/T
rs27195524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29169628fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA G AAAA  AA AAAA/G
rs27195523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29170283fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG A GGAG  GG GAGA/G
rs27195522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29170421fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs33145366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29170667fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP AA   A  A           A
rs27195521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29170689fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC C CCCC  CC CTCC/T
rs27195520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29171392fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CC C  CC C CC/T
rs27195519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29171983fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG G GGGG  GG GGAA/G
rs27195518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29172050fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA   A  A A TA  AA ATAA/T
rs27195517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29172087fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC C CCTC  CC CTCC/T
rs6409116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29172488fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
2SNPT TTTTTCCTTCT  TT TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6162360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29172851fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP      T C            C/T
rs6162895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29172959fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
2SNPT TTTTTCCTTCT  TT TCTC/T
rs27195516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29173039fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC A CCAC  CC CACA/C
rs27195515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29173244fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA G AAAA  AA AAAA/G
rs46122945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29174051fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP AG      G           A/G
rs27195514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29176326fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPG GGGG   GGAG  GG GAGA/G
rs27195513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29176555fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC G CCCC  CC CCCC/G
rs27195512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29176790fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
2SNPA AAAA C AACA  AACACAA/C
rs27195511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29176907fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-Synonymous
2SNPCCCCCC C CCTC  CCTCTCC/T
rs50686608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29177165fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNP CC      C       T   C/T
rs27195510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29177670fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT T TTGT  TT TGTG/T
rs27195509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29177832fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPT TTTT C TTTT  TT TTTC/T
rs27195508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29178103fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPA AAAA A AACA  AA ACAA/C
rs27195507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29178220fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC   CCTC  CC CTCC/T
rs27195506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29179178fDwh : within coordinates of
Setx : Intron
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29179463fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPA AAAA T AATA  AA ATAA/T
rs27195504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29179662fDwh : within coordinates of
Setx : Coding-NonSynonymous
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29180135fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPG GGGG G GGCG  GG GGGC/G
rs27195502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29180540fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPC CCCC C CCTC  CC CTCC/T
rs27195501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29180603fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPG GGGG C GGGG  GG GGGC/G
rs27195500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29180758fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPC CCCC C CCAC  CC CACA/C
rs27195499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29180890fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29180914fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPC CCCC A CCAC  CC CACA/C
rs27195497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29181064fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPA AAAA C AAAA  AA AAAA/C
rs27195496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29181218fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27195495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29181684fDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNPC CCCC A CCCC  CC CCCA/C
rs4223081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29182301rDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNP  C CCCC C   TC      C/T
rs4223080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29182431rDwh : within coordinates of
Setx : mRNA-UTR
1SNP  A AAA  A   CA      A/C
rs4223079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29182492rDwh : within coordinates of
Setx : Locus-Region
2SNPT TTTTTC TTTTCTTT TTTC/T
rs27195494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183110fDwh : within coordinates of
Setx : 639 bp downstream of
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183157fDwh : within coordinates of
Setx : 686 bp downstream of
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183303fDwh : within coordinates of
Setx : 832 bp downstream of
1SNPA AAAA T AAAA  AA AAAA/T
rs27195491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183340fDwh : within coordinates of
Setx : 869 bp downstream of
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183382fDwh : within coordinates of
Setx : 911 bp downstream of
1SNPC CCCC C CCCC  CC CTCC/T
rs27195489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183486fDwh : within coordinates of
Setx : 1015 bp downstream of
1SNPA AAAA A AAAA  AA AAGA/G
rs27195488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183821fDwh : within coordinates of
Setx : 1350 bp downstream of
1SNPC CCCC C CCTC  CC CTCC/T
rs27195487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183859fDwh : within coordinates of
Setx : 1388 bp downstream of
1SNPA AAAA C A AA  AA AAAA/C
rs27195486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29183925fDwh : within coordinates of
Setx : 1454 bp downstream of
1SNPC CCCC T CCCC  CC CCCC/T
rs27195485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29184002fDwh : within coordinates of
Setx : 1531 bp downstream of
1SNPG GGGG A GGGG  GG GGGA/G
rs27195484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:29184327fDwh : within coordinates of
Setx : 1856 bp downstream of
1SNPG GGGG G GGAG  GG GAGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory