About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Ttll1
tubulin tyrosine ligase-like 1
MGI:2443047

95 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31710777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83312809fTtll1 : Locus-Region1SNPA A AC A A A  A  ACA/C
rs31710779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83312872fTtll1 : Locus-Region1SNPA A A  CAA A  AAAC A/C
rs31730894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83312902fTtll1 : Locus-Region1SNPAAA   A C          A/C
rs31710781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83313399fTtll1 : Locus-Region1SNPC C C  TCC C    CC C/T
rs31710783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83313473fTtll1 : Locus-Region1SNPC CCCC TCCCC  CCCC C/T
rs31710815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83313550fTtll1 : Locus-Region1SNPA AAAA GAA A  AAA  A/G
rs4230924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314788rTtll1 : Intron1SNP    CCC C   TC     C/T
rs4230923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314820rTtll1 : Intron1SNP    GGG G   AG     A/G
rs31710817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314829fTtll1 : Intron1SNPC C C   CC C  CCCG C/G
rs4230922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314881rTtll1 : Intron1SNP    GGG G   AG     A/G
rs4230921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314907rTtll1 : Intron1SNP    TTT T   AT     A/T
rs4230920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314909rTtll1 : Intron2SNPC CCCCCTCT CTCCCCT C/T
rs4230919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314916rTtll1 : Intron2SNPA AAAAACAA ACAAAA  A/C
rs4230918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83314937rTtll1 : Intron2SNPC CCCCCGCG CGCCCCG C/G
rs31710822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83315539fTtll1 : Intron1SNPT T T  CTT T  TTTC C/T
rs31710844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83315592fTtll1 : Intron1SNPC CCCC GCC C  CCCG C/G
rs31710846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83315642fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCC C  CCCTCC/T
rs31710848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83317908fTtll1 : Intron1SNPC C C  TCCTC  CCCTTC/T
rs31710850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83317933fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGAG  GGGAGA/G
rs31711295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83318004fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAAGA  AAAGAA/G
rs31711297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83318105fTtll1 : Intron1SNPG G G  AGGGG   GGGAA/G
rs31711299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83318272fTtll1 : Intron1SNPA AAA  GAA A  AAA  A/G
rs31711301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83318384fTtll1 : Intron1SNPC CCC  TCC C  CCC  C/T
rs31711303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83318831fTtll1 : Intron1SNPG G GG  GG G  GGGC C/G
rs31711415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83319551fTtll1 : Intron1SNPT TTTT CTTCT  TTTC C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31711417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83320097fTtll1 : Intron1SNPC C CT TCCTC    CTTC/T
rs31711419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321296fTtll1 : Intron1SNPA A A  GAAGA  AAAGGA/G
rs31711421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321588fTtll1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA  AAAAAA/G
rs31711423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321628fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTT T  TTTGTG/T
rs31711515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321689fTtll1 : Intron1SNPT TTTT  TTGT  TTTGTG/T
rs31711517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321700fTtll1 : Intron1SNPC C CC TCCCC  CCCCTC/T
rs31711519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321740fTtll1 : Intron1SNPT TTTT GTT T  TTT  G/T
rs31711521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321746fTtll1 : Intron1SNPC C C   CCGC  CCCG C/G
rs31711523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83321922fTtll1 : Intron1SNPT TTTT CTT T  TTTCTC/T
rs31711815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83322429fTtll1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG  GGGG A/G
rs31711817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83322784fTtll1 : Intron1SNPC CCCC TCC C  CCC CC/T
rs31711819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83322939fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCCTC  CCCCCC/T
rs31711821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83323072fTtll1 : Intron1SNPC CCCC ACCCC  CCCC A/C
rs31711823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83323143fTtll1 : Intron1SNPT TTTT CTCCT  TTTC C/T
rs31712125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83323538fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG  GGGAGA/G
rs31712127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83323605fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCCTC  CCCTCC/T
rs31712129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83323856fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAAGA  AAAGAA/G
rs31577708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324023fTtll1 : Intron2SNPAAGGGGGGGGGG  AGGGGA/G
rs31712132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324069fTtll1 : Intron1SNPA AAA   AG A  AAA AA/G
rs31712514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324306fTtll1 : Intron1SNPC CCCC GCCCC  CCCCCC/G
rs31712516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324320fTtll1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC  CCCCCC/T
rs31712518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324355fTtll1 : Intron1SNPG G GG AGGAG  GGGA A/G
rs31712520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324395fTtll1 : Intron1SNPT T T  A TTT  TTTT A/T
rs31712522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83324482fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCTCC  CCCCCC/T
rs31712824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83325139fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGG G  GGGAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31712826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83325408fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGAG  GGGGGA/G
rs31712828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83325646fTtll1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG  GGGGGA/G
rs31712830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83325697fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT  TTTCTC/T
rs31712832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83325732fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCCTC  CCCTCC/T
rs31713164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83325817fTtll1 : Intron1SNPG GGGG AGGAG  GGGG A/G
rs31713166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83327102fTtll1 : Intron1SNPA AAA  AAAGA  AAAAAA/G
rs31713168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83327568fTtll1 : Intron1SNPA AAAA GAG A  AAA  A/G
rs31713170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83327616fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT  TTTCTC/T
rs31713172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83327753fTtll1 : Coding-Synonymous1SNPA A A  AAA A  AAAGAA/G
rs31713394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83328438fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGG G  GGGAGA/G
rs31713396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83328443fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGAG  GGG GA/G
rs31713398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83328809fTtll1 : Intron1SNPC CCCC C CTC  CCCTCC/T
rs31713400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83329730fTtll1 : Intron1SNPG GGG    GAG  GGGAGA/G
rs31713402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83329884fTtll1 : Intron1SNPC CCCC C CTC  CCCTCC/T
rs31713664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83330046fTtll1 : Intron1SNPC CCCC C C C  CCCTCC/T
rs31713666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83331273fTtll1 : Intron1SNPC CCCC C CTC  CCCTCC/T
rs31893535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83331639fTtll1 : Intron1SNP AA   A G          A/G
rs32081040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83331662fTtll1 : Intron1SNP  C   C T          C/T
rs31713668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83332744fTtll1 : Intron1SNPA AAAA A AGA  AAAGAA/G
rs31713670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83332793fTtll1 : Intron1SNPA AAA  A AAA  A ACAA/C
rs31713672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83332877fTtll1 : Intron1SNPA AAAA G GGA  AAAGAA/G
rs31711115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83333530fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT  TTTCTC/T
rs31711117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83333682fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCCTC  CCCTCC/T
rs31711119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83334199fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGAG  GGGAGA/G
rs31711121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336149fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAAGA  AAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31711123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336214fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTTGT  TTTGTG/T
rs31711175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336269fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAAGA  AAAGAA/G
rs31711177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336638fTtll1 : Intron1SNPT TTT  TTTTT   TTATA/T
rs31711179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336750fTtll1 : mRNA-UTR1SNPT TTTT TTT T  TTTCTC/T
rs31711181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336821fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG  GGGAGA/G
rs31711183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336833fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCTCC/T
rs31711325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83336871fTtll1 : Intron1SNPC CCC  CCCCC  CCCACA/C
rs31711327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83337620fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT  TTT TC/T
rs31711329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83337828fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAA A  AAAGAA/G
rs31711331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83338035fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA  AAAGAA/G
rs31711333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83338191fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAAGA  AAAGAA/G
rs31711435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83338218fTtll1 : Intron1SNPT TTT  TTTCT  TTTCTC/T
rs31711437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83338606fTtll1 : Intron1SNPG GGGG GGGCG  GGGCGC/G
rs31711439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83338766fTtll1 : Intron1SNPA AAAA AAATA  AAATAA/T
rs31711441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83339109fTtll1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT  TTTC C/T
rs31711443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83339357fTtll1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG    GG A/G
rs31711795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83340015fTtll1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCTCC/T
rs31711797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83340844fTtll1 : Intron1SNPT TTTT ATT T  TTT TA/T
rs31711799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83340879fTtll1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG  GGGG A/G
rs31711801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:83341308fTtll1 : Locus-Region1SNPG GGGG CGC    G G  C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory